[发明专利]拉氏鱥微卫星标记组合及引物对组合物及应用

说明书

本发明公开了拉氏鱥微卫星标记组合及引物对组合物及应用，拉氏鱥微卫星标记组合，该组合包括微卫星标记：PL02、PL08、PL09、PL12、PL17、PL19、PL25、PL27、PL36、PL42、PL44、PL60、PL62、PL63、PL65和PL68，所述微卫星标记的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.16所示。本发明的拉氏鱥卫星标记是从转录组序列中筛选出的微卫星标记，出现无效等位基因的概率小。本发明提供的微卫星标记弥补了拉氏鱥微卫星标记的空白，可为拉氏鱥群体遗传学分析，遗传多样性检测，亲缘关系鉴定，分子标记辅助育种提供有力工具。

技术领域

本发明属于动物微卫星标记技术领域，具体涉及拉氏鱥微卫星标记组合、检测上述拉氏鱥微卫星标记组合的引物对组合物及上述引物对组合物在拉氏鱥遗传多样性检测中的应用。

背景技术

拉氏鱥(Rhynchocypris lagowskii)隶属于鲤形目(Cypriniformes)，鲤科(Cyprinidae)，雅罗鱼亚科(Leuciscinae)，鱥属(Phoxinus)，别名洛氏鱥、长尾鱥，俗称“柳根子”。分布于黑龙江水系、内蒙古东部内流型湖泊、黄河水系、淮河水系、海河水系、钱塘江水系及长江中上游支流等。拉氏鱥属偏冷水性鱼类，一般生活在山区溪流之中和水质清澈的水体，主要以水生植物为食，也摄食水生昆虫，属杂食性鱼类。该鱼肉质细嫩、味道鲜美、无肌间刺、蛋白质和不饱和脂肪酸含量高，可作为良好催乳食品，有很好的市场前景。随着生存环境污染、产卵场破坏和过度捕捞，该鱼自然资源急剧减少，同时随着养殖面积不断扩大，苗种需求量急剧增加，由于苗种供应短缺，严重制约了养殖产业的进一步发展。因此，无论是基于自然种群的保护，还是经济鱼类新品种的开发，拉氏鱥的规模化培育十分重要。

微卫星DNA又称简单重复序列，由2-6bp短核苷酸串联重复组成，均匀分布于真核生物基因组中。微卫星标记为共显性标记，可稳定遗传，遵循孟德尔遗传规律，且容易获得，结果重复性高，是种群遗传多样性监测、遗传结构分析、种质资源鉴定和遗传育种重要的分子标记。目前尚未见拉氏鱥微卫星标记的报道，拉氏鱥微卫星标记的开发对其种群遗传多样性监测及分子标记辅助育种具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于填补拉氏鱥微卫星标记组合的空白，提供拉氏鱥微卫星标记组合。

本发明的第二个目的是提供检测上述拉氏鱥微卫星标记组合的引物对组合物。

本发明的第三个目的是提供上述引物对组合物在拉氏鱥遗传多样性检测中的应用。

本发明的技术方案概述如下：

拉氏鱥微卫星标记组合，该组合包括微卫星标记：PL02、PL08、PL09、PL12、PL17、PL19、PL25、PL27、PL36、PL42、PL44、PL60、PL62、PL63、PL65和PL68，所述微卫星标记的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.16所示。

检测上述拉氏鱥微卫星标记组合的引物对组合物，所述引物对组合物包括如下引物对：

检测第1微卫星标记PL02的引物对：正向引物为SEQ ID NO.17，反向引物为SEQIDNO.18；

检测第2微卫星标记PL08的引物对：正向引物为SEQ ID NO.19，反向引物为SEQ IDNO.20；

检测第3微卫星标记PL09的引物对：正向引物为SEQ ID NO.21，反向引物为SEQ IDNO.22；

检测第4微卫星标记PL12的引物对：正向引物为SEQ ID NO.23，反向引物为SEQ IDNO.24；

检测第5微卫星标记PL17的引物对：正向引物为SEQ ID NO.25，反向引物为SEQ IDNO.26；