[发明专利]与猪肌纤维、肋骨数及背膘厚相关的分子标记、引物、检测方法及应用在审
申请号: | 202310026672.9 | 申请日: | 2023-01-09 |
公开(公告)号: | CN116024356A | 公开(公告)日: | 2023-04-28 |
发明(设计)人: | 徐学文;徐祥华;赵书红;刘炎;马婷婷;郑智伟 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学;岭南现代农业科学与技术广东省实验室 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 张晓博 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肌纤维 肋骨 背膘厚 相关 分子 标记 引物 检测 方法 应用 | ||
1.一种与猪肌纤维的周长、面积以及肋骨数和平均背膘厚相关的分子标记,所述分子标记位于MYLPF基因中,所述分子标记序列如SEQ ID NO:4所示,该序列位于MYLPF基因202转录本第一外显子处,用于检测SNP位点突变。
2.一种扩增如权利要求1所述的猪肌纤维的周长、面积以及肋骨数和平均背膘厚相关的分子标记的引物对,所述引物对的正向核苷酸序列为:
MYLPF_M_F:TCCACATCTCTCGTTAGAACCCTCCCTTGGTATCACTCAT,如SEQ IDNO:5所示,
所述引物对的反向核苷酸序列为:
MYLPF_M_R:ACGGAGGGCAGGAAGGTATG,如SEQ ID NO:6所示。
3.如权利要求1所述的分子标记在猪肉质性状相关分子标记辅助育种中的应用。
4.如权利要求1所述的引物对在猪肉质性状相关分子标记辅助育种中的应用。
5.一种利用权利要求1所述的分子标记检测猪MYLPF方法,包括以下步骤:
S1:设计引物,针对MYLPF基因202转录本在第一外显子区域检测到的SNP位点突变,设计特异性引物:
MYLPF_M_F:TCCACATCTCTCGTTAGAACCCTCCCTTGGTATCACTCAT,如SEQ IDNO:5所示,
MYLPF_M_R:ACGGAGGGCAGGAAGGTATG,如SEQ ID NO:6所示;
S2:对猪的基因组DNA进行PCR扩增;
S3:对PCR产物酶切,并进行电泳判断基因型。
6.根据权利要求5所述的检测猪MYLPF基因突变的方法,所述步骤S2中,PCR反应总体系为10L,其中包括1μL的猪基因组DNA,浓度为50ng/μL;5μL的2×Taq PCR Mix;10μM的正、反向特异性引物各0.2μL;3.6μL的无菌水;扩增条件为:95℃预变性3min;95℃变性30s;60℃退火30s;72℃延伸12s;35个循环;72℃终止延伸5min;15℃冷却2min;PCR产物用2%的琼脂糖凝胶电泳检测。
7.根据权利要求5所述的检测猪MYLPF基因突变的方法,所述步骤S3中,酶切反应体积是5μL,其中10×NEBuffer 0.5μL;PCR产物1.5μL;NlaIII限制性内切酶0.1μL;无菌水2.9μL;振荡混匀之后离心;然后37℃酶切15min;酶切产物用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳检测酶切结果,并判断基因型。
8.如权利要求5-7中任一项所述的检测猪MYLPF基因突变的方法在猪肉质性状辅助育种中应用。
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