[发明专利]水稻幼芽期耐冷基因CTES11b的分子标记及其应用在审
| 申请号： | 202211657316.9 | 申请日： | 2022-12-22 |
| 公开（公告）号： | CN115961078A | 公开（公告）日： | 2023-04-14 |
| 发明（设计）人： | 姜树坤;张喜娟;杨贤莉;王立志;迟力勇;吕国依;商全玉;高鸿儒;李锐;刘猷红;孟英;唐傲;董文军;刘凯;姜辉;任洋;陈磊;王阳;唐晓东;王翠玲;李佳锐;董风雪;曲忠诚;王宇先;房海悦;季生栋;侯本福;杨传铭 | 申请（专利权）人： | 黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;C12N15/29 |
| 代理公司： | 成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙) 51241 | 代理人： | 邓永红 |
| 地址： | 150086 黑龙*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水稻 幼芽 期耐冷 基因 ctes11b 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与水稻幼芽期耐冷基因CTES11b紧密连锁的InDel标记，该InDel标记的序列为AGGCTACGCACCAATCT；定位于SEQ ID No.2所示核苷酸序列的第203至221碱基之间，当第203至221碱基之间的序列缺失时，具有水稻幼芽期耐冷基因CTES11b，表现为耐冷。
2.检测权利要求1所述的InDel标记的引物对。
3.根据权利要求2所述的引物对，其特征在于，所述引物对的上游引物核苷酸序列如SEQ ID No.3，下游引物核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。
4.一种试剂盒，含有权利要求2或3所述的引物对。
5.权利要求1所述的InDel标记或权利要求2或3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒在水稻幼芽期耐冷性状辅助育种上的应用。
6.一种检测水稻是否含有水稻幼芽期耐冷基因CTES11b的方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)提取待检测水稻的基因组DNA；
(2)以基因组DNA为模板，根据权利要求1所述的InDel标记上下游序列设计引物对进行PCR扩增；
(3)对扩增产物进行检测分析，如果扩增产物中对应InDel位点缺失AGGCTACGCACCAATCT序列，则存在水稻幼芽期耐冷基因CTES11b，表现为耐冷。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述引物对的上游引物核苷酸序列如SEQID No.3，下游引物核苷酸序列如SEQ ID No.4所示；当扩增产物为291bp时，检测材料携带水稻幼芽期耐冷基因CTES11b；当扩增产物为308bp时，检测材料不携带水稻幼芽期耐冷基因CTES11b。
8.一种水稻幼芽期耐冷基因CTES11b的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
9.权利要求8所述的分子标记在水稻幼芽期耐冷基因CTES11b辅助育种中的应用。
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