[发明专利]一种用于结直肠癌诊断的多基因DNA甲基化联合检测试剂盒及应用有效

专利信息
申请号: 202210962887.7 申请日: 2022-08-11
公开(公告)号: CN116064792B 公开(公告)日: 2023-10-27
发明(设计)人: 王传新;杜鲁涛;李培龙;李娟;谢艳 申请(专利权)人: 山东大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 济南泉城专利商标事务所 37218 代理人: 刘庆兰
地址: 250100 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 直肠癌 诊断 多基因 dna 甲基化 联合 检测 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.外周血单个核细胞中TRGV9、TRDJ3、TRDC、FAM174B、ZMIZ2基因在制备结直肠癌诊断试剂盒中的应用。

2.一种用于结直肠癌诊断的多基因DNA甲基化联合检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括用于检测TRGV9、TRDJ3、TRDC、FAM174B、ZMIZ2基因甲基化的引物对和基因特异的水解探针,

所述TRGV9基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;

TRDJ3基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;

TRDC基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;

FAM174B基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;

ZMIZ2基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示。

3.根据权利要求2所述用于结直肠癌诊断的多基因DNA甲基化联合检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括β-actin基因的PCR扩增特异性引物和探针,所述β-actin基因检测正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示,探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示。

4.根据权利要求2所述用于结直肠癌诊断的多基因DNA甲基化联合检测试剂盒,其特征在于,所述特异性识别TRGV9、TRDJ3、TRDC、FAM174B、ZMIZ2基因甲基化的探针5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团;TRGV9、TRDJ3、TRDC基因探针5’端的荧光报告基团为FAM,FAM174B、ZMIZ2基因探针5’端的荧光报告基团为CY5,β-actin基因探针5’端的荧光报告基团为VIC,TRGV9、TRDJ3、TRDC、FAM174B、ZMIZ2及β-actin基因3’端荧光淬灭基团均为BHQ1。

5.根据权利要求2所述用于结直肠癌诊断的多基因DNA甲基化联合检测试剂盒,其特征在于,

试剂盒中的阴性质控品由β-actin基因非甲基化的人基因组DNA配制而成;阳性质控品由β-actin基因甲基化的人基因组DNA配制而成;阴性质控品无明显扩增曲线变化或Ct值≥35,阳性质控品的Ct值≤10,为有效实验;

还包括一个诊断模型,诊断模型公式如下:

△CT1= CTVIC-CTFAM,

△CT2= CTVIC-CTCY5

Multi-PCR Score=1/[1+exp(10.73266+11.57596*△CT1- 15.31471*△CT2)];

Multi-PCR Score大于0.5,结果为阴性;

Multi-PCR Score小于0.5,结果为阳性;

若VIC荧光通道的Ct值35或无扩增,ΔCt为任何结果皆为无效,需要重新提取转化样本后检测。

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