[发明专利]小麦分子标记AX-95660756及其在面筋聚集特性改良中的应用

说明书

本发明公开了一个与小麦面筋聚集特性遗传相关的分子标记AX‑95660756，以及一组与该分子标记相关的KASP引物组及其应用；遗传标记名称为AX‑95660756，位于小麦4D染色体长臂上；在该序列的第36位碱基存在一个A/G的等位基因的突变；当第36位碱基为AG时，为面筋聚集特性强的基因型，当第36位碱基为GG时，为面筋聚集特性弱的基因型。利用该KASP引物组为引物，以待测小麦基因组为模板进行PCR扩增KASP标记，可以筛选出具有面筋聚集特性强的小麦品种，有利于利用遗传手段改变小麦面筋聚集特性，从而提升小麦面筋品质，改进小麦育种方法。

技术领域

本发明属于小麦面筋聚集特性分子标记技术领域，涉及小麦分子标记AX-95660756及其在面筋聚集特性改良中的应用。

背景技术

随着人口数量的不断增加以及现代农业技术的发展，丰产优质小麦成为当下小麦育种的重要目标。小麦品质主要通过面团流变学特性反应，传统的方法测试小麦流变学特性主要利用粉质仪、拉伸仪等仪器，但利用这些仪器测试需要耗费大量的时间和材料。为减少实验损耗，利用面筋峰值仪(Glutopeak)直接测量小麦全麦粉，通过桨叶在杯中的快速搅拌使面筋分离后又聚集，测得小麦的面筋聚集特性。且该仪器测量所需时间短(10min)，耗材少(10g)，可重复性高，可快速检测多种小麦材料。

小麦面团品质很大程度上受面筋聚集特性影响，目前，已有大量关于小麦面筋聚集特性与品质关系的研究，但关于小麦面筋聚集特性的遗传基础确少有研究，现有研究已指出小麦面筋聚集特性主要由遗传因素决定，所以对小麦面筋聚集特性进行遗传分析，了解其分子调控机制，有利于优化小麦品质和小麦优质育种的早期选择。

发明内容

为了克服现有技术中存在的缺陷，本发明利用前期构建的自然群体并结合660KSNP芯片基因型数据，初步筛选获得224706个有效的SNPs标记位点。同时，利用Glutopeak对3年3个环境的自然群体207份小麦品种进行了面筋聚集特性的表型测定，通过采用“Q+K”混合线性模型对小麦籽粒中面筋聚集特性进行了全基因组关联分析(Genome-wideassociation study)。结果在前述筛选所得SNPs标记位点中获得了一个在4D染色体长臂上的显著性标记AX-95660756。

第一方面，本发明提供了小麦分子标记AX-95660756在小麦面筋聚集特性改良中的应用，所述小麦分子标记AX-95660756位于小麦4D染色体长臂上，其36位碱基为A/G多态性位点，所述小麦分子标记AX-95660756序列为：GATGTACGCCGGCTGCATGCAAACACAGTGATTCTRTGGGTGTTCACGTGTCTTTGGAGGCCACACATGCA(SEQ ID NO.1)其中，R代表碱基为A/G；基于基因分型结果：纯合态基因型GG，表示面筋聚集特性弱；杂合态基因型AG，表示面筋聚集特性强。

第二方面，本发明还提供了一种检测小麦面筋聚集特性的物质，所述物质为用于检测小麦基因组中染色体4D上SEQ ID No.1所示的分子标记AX-95660756的第36位基因型的成套引物或含有所述成套引物的检测试剂或试剂盒。

进一步地，所述成套引物中含有两条上游引物和一条下游引物；所述上游引物根据所述小麦基因组中染色体4D上SEQ ID No.1所示序列的第36位脱氧核糖核苷酸及其上游序列进行设计，且一条所述上游引物的3’末端脱氧核糖核苷酸为A，另一条所述上游引物的3’末端脱氧核糖核苷酸为G；所述下游引物根据所述小麦基因组中染色体4D上SEQ ID No.1所示序列的第36位脱氧核糖核苷酸的下游序列进行设计。

进一步地，所述上游引物为AX-95660756-F1、AX-95660756-F2，其序列分别如SEQID No.2、SEQ ID No.3所示，所述下游引物为AX-95660756-R12，其序列如SEQ ID No.4所示。

第三方面，本发明该提供了本发明第二方面所述的物质在如下任一中的应用：