[发明专利]胎儿DNA浓度的评估方法及应用

权利要求书

1.胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

S101：对生父DNA样本、孕妇白细胞DNA样本和孕妇游离DNA样本的二态性位点进行测序分别得到DNA数据F、M和S，所述孕妇游离DNA样本通过分离孕妇外周血得到；

S102：获取S中满足以下要求的位点集X’，

X'＝{x_i|na_i(F)/n_i(F)＜0.1∩nAi(M)/n_i(M)＜0.1}∪{x_i|nA_i(F)/n_i(F)＜0.1∩na_i(M)/n_i(M)＜0.1}，

其中，nA与na分别表示二态性位点A与a的观测值，n＝nA+na，k＝na；

S103：根据公式I计算位点集X'上某一个位点的概率P，

其中，0≤p≤0.5，Pm＝0.4；

S104：采用极大似然值法得到点集X'的累计概率h最大时的p_max；

S105：胎儿DNA浓度N＝2p_max。

2.根据权利要求1所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，在步骤S101中，所述测序方法包括：

S1011：构建探针；

S1012：提取样品中的DNA；

S1013：构件文库；

S1014：采用步骤S1011的探针对文库目标区域进行杂交捕获和测序；

S1015：对测序数据进行拆分和质量值过滤得到测序数据。

3.根据权利要求1所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，所述二态性位点选自SNP位点、INDEL位点和/或STR位点，所述二态性位点的人群频率为0.05-0.95。

4.根据权利要求3所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，在SNP位点中，A表示野生型位点，a表示突变型位点。

5.根据权利要求3所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，所述二态性位点的数量大于1000。

6.根据权利要求1所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，步骤S104中：根据公式II计算位点集X’上所有位点的累计概率h，p每隔预定间隔取值计算累计概率h，当h取最大值时的p值即为p_max；

7.根据权利要求6所述的胎儿DNA浓度的评估方法，其特征在于，所述预定间隔为0.0001。

8.如权利要求1-7任一项所述的胎儿DNA浓度的评估方法的应用，其特征在于，N≥0.4时，进行亲子鉴定时，则需要对孕妇的白细胞进行测序；0.004＜N＜0.4时，按二代DNA亲子鉴定法进行亲子鉴定；N≤0.004时，进行亲子鉴定时，如果所有位点跟父本匹配，则判断为生父；如果有位点不匹配且胎儿为男胎时，则根据Y染色体的匹配情况进行判断，有一个错配即判断为非生父；如果有位点不匹配且胎儿为女胎时，则无法判断亲子关系，需要重新采集孕妇游离DNA样本。