[发明专利]基因组合作为诊断阿尔茨海默病的分子标志物

说明书

本发明公开了基因组合作为诊断阿尔茨海默病的分子标志物。本发明的研究表明，LOC653658、LOC648000、RPS27、TOMM7基因组合在诊断阿尔茨海默病时的AUC值均高于单独任何一个基因的诊断效能，故本发明的基因组合可作为诊断指标用于临床阿尔茨海默病的诊断。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及基因组合作为诊断阿尔茨海默病的分子标志物，具体涉及LOC653658、LOC648000、RPS27、TOMM7作为诊断阿尔茨海默病的分子标志物。

背景技术

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease，AD)最常见的生物标志物是Aβ和tau，它们可以通过脑脊液或PET成象检验。然而这个过程是有创的，且非常昂贵，难以在人群中普遍应用。此外，AD与其他类型的痴呆，如血管性痴呆(VaD)、帕金森病性痴呆(PDD)、行为变异性额颞叶痴呆(bvFTD)、路易体痴呆(DLB)等，可能存在重叠的临床表现、病理和生物标志物，往往导致临床诊断困难。

基于上述问题，AD的临床治疗急需一种可有效诊断AD的方法。

发明内容

一方面，本发明提供了一种生物标志物，所述生物标志物包括下列基因中的一种或多种：LOC653658、LOC648000、RPS27、TOMM7。

虽然单独的生物标志物可用于疾病诊断的应用，如本文所示，但生物标志物的组合可比单独使用时的生物标志物提供更高的肿瘤诊断的预测值。具体地，检测多个生物标志物可以增加诊断测试的准确度、灵敏度和/或特异性。

另一方面，本发明提供了检测前面所述的生物标志物的试剂。

生物标志物可通过直接或间接方法检测。在直接检测方法中，通过与核酸分子连接的可检测标记来检测一种或多种生物标志物。在这类方法中，生物标志物可以在与探针结合之前被标记。因此，通过筛选与探针结合的标记的生物标志物来检测结合。

本发明可以利用本领域内已知的任何方法测定基因表达。本领域技术人员应当理解，测定基因表达的手段不是本发明的重要方面。这些技术包括但不限于：核酸测序、核酸杂交、核酸扩增技术。

核酸测序技术的示例性非限制性实例包括但不限于链终止子(Sanger)测序和染料终止子测序。本领域的普通技术人员将认识到，由于RNA在细胞中不太稳定并且在实验中更易受到核酸酶攻击，因此在测序前通常将RNA逆转录成DNA。

核酸测序技术的另一示例性非限制性实例包括下一代测序(深度测序/高通量测序)，高通量测序技术是一种基于单分子簇的边合成边测序技术，基于专有的可逆终止化学反应原理。测序时将基因组的DNA的随机片段附着到光学透明的玻璃表面，这些DNA片段经过延伸和桥式扩增后，在玻璃表面形成数以亿计的簇，每个簇是具有数千份相同模板的单分子簇，然后利用带荧光基团的四种特殊脱氧核糖核苷酸，通过可逆性的边合成边测序技术对待测的模板DNA进行测序。

核酸杂交技术的示例性非限制性实例包括但不限于原位杂交(ISH)、微阵列和Southern或Northern印迹。原位杂交(ISH)是一种使用标记的互补DNA或RNA链作为探针以定位组织一部分或切片(原位)或者如果组织足够小则为整个组织(全组织包埋ISH)中的特异性DNA或RNA序列的杂交。DNAISH可用于确定染色体的结构。RNAISH用于测量和定位组织切片或全组织包埋内的mRNA和其他转录本(例如，ncRNA)。通常对样本细胞和组织进行处理以原位固定靶转录本，并增加探针的进入。探针在高温下与靶序列杂交，然后将多余的探针洗掉。分别使用放射自显影、荧光显微术或免疫组织化学，对组织中用放射、荧光或抗原标记的碱基标记的探针进行定位和定量。ISH也可使用两种或更多种通过放射性或其他非放射性标记物标记的探针，以同时检测两种或更多种转录本。