[发明专利]3’-O-可逆封闭的核苷酸及其在无模板酶促核酸合成中的应用在审
申请号: | 202110659082.0 | 申请日: | 2021-06-15 |
公开(公告)号: | CN113372402A | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | 王升启;何小羊;王学军;丁思敏;张千曲;黄聪 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | C07H19/207 | 分类号: | C07H19/207;C07H19/10;C07H1/00;C12P19/34 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 徐乐 |
地址: | 100082 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 可逆 封闭 核苷酸 及其 模板 核酸 合成 中的 应用 | ||
1.一种3’-O-封闭的核苷酸,其特征在于,封闭基团为氰基乙烯基。
2.根据权利要求1所述的核苷酸,其特征在于,所述核苷酸选自脱氧腺苷酸及衍生物、脱氧鸟苷酸及衍生物、脱氧胞苷酸及衍生物、脱氧胸苷酸及衍生物、腺苷酸及衍生物、鸟苷酸及衍生物、胞苷酸及衍生物和尿苷酸及衍生物中的任一种。
3.权利要求1或2所述3’-O-封闭的核苷酸在酶促核酸合成中的应用;
优选地,所述酶为TdT酶;
优选地,所述酶促核酸合成为可逆终止的无模板酶促核酸合成。
4.权利要求1或2所述3’-O-封闭的核苷酸的制备方法,其特征在于,用3’-O-氰基乙烯基替代核苷酸的3’-OH,得到3’-O-封闭的核苷酸。
5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于,核苷酸的3’-OH先与甲酸发生酯化反应生成甲酯,再与三苯基亚正膦基乙腈反应生成3’-O-氰基乙烯基,得到3’-O-封闭的核苷酸;
优选地,以5’-OTBDMS保护核苷为原料,5’-OTBDMS保护核苷的3’-OH先与甲酸发生酯化反应生成甲酯,再与三苯基亚正膦基乙腈反应生成3’-O-氰基乙烯基,得到3’-O-氰基乙烯基后,依次经脱除5’-OTBDMS和磷酸化,得到3’-O-封闭的核苷酸。
6.权利要求1或2所述3’-O-封闭的核苷酸的脱保护方法,其特征在于,采用裂解剂将3’-O-封闭的核苷酸中的封闭基团切割,得到3’-OH核苷酸。
7.根据权利要求6所述的脱保护方法,其特征在于,所述裂解剂为钯络合物,优选为二乙腈二氯化钯;
优选地,二乙腈二氯化钯浓度为0.04-0.06M,切割条件为55-65℃反应0.5-10min。
8.一种酶促核酸合成的方法,其特征在于,所述方法的原料包括权利要求1或2所述的3’-O-封闭的核苷酸。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述酶促核酸合成为可逆终止的无模板酶促核酸合成;
优选地,所述酶为TdT酶;
优选地,利用权利要求6或7所述的脱保护方法实现核酸延伸终止的重启。
10.基于权利要求8或9所述方法生成核酸的合成仪器。
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