[发明专利]一种葫芦耐热特性的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种葫芦耐热特性的分子标记及其应用。属于作物耐逆性鉴定技术领域。包括SNP1、SNP2或SNP3。本发明能够在苗期对葫芦耐热特性进行分子标记鉴定，在选育耐热葫芦品种的过程中，对供试葫芦材料进行选择，区分耐热和热敏葫芦材料。通过重测序结合生物信息学的方法获得的与葫芦耐热特性相关的分子标记，与葫芦耐热特性相关性高。

技术领域

本发明涉及作物耐逆性鉴定技术领域，更具体的说是涉及一种葫芦耐热特性的分子标记及其应用。

背景技术

目前，全球气候变暖，作物生长面临严峻的高温挑战。鉴定葫芦耐热特性是选育耐热葫芦品种的关键环节。鉴定葫芦耐热特性常用的方法是通过对葫芦植株进行高温处理，根据植株的表型、生化指标等变化，判断葫芦的耐热特性。

但是，通过现有方法判断葫芦耐热特性，需要对植株进行热处理，这个环节可能受到处理条件和植株生长不均一等影响，结果准确性有待提高。

因此，提供一种葫芦耐热特性的分子标记是本领域技术人员亟需解决的问题。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了一种葫芦耐热特性的分子标记及其应用。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种葫芦耐热特性的分子标记，包括SNP1、SNP2或SNP3中至少一种；SNP1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示；SNP2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示；SNP3的核苷酸序列如SEQID NO:3所示。

本发明还提供了一种用于检测上述的葫芦耐热特性的分子标记的引物组，包括：SNP1的PCR扩增用上游引物的核苷酸序列为5’-GTGAACTCCTTGAGCCCACA-3’,如SEQ ID NO:4所示；

SNP1的PCR扩增用下游引物的核苷酸序列为5’-CACTGCCTTGTTCCTTTGCC-3’,如SEQID NO:5所示；

SNP2的PCR扩增用上游引物的核苷酸序列为5’-ACTGCCACATCATCGGTTGT-3’,如SEQID NO:6所示；

SNP2的PCR扩增用下游引物的核苷酸序列为5’-GAGCTCGAGATTGCATCGGA-3’,如SEQID NO:7所示；

SNP3的PCR扩增用上游引物的核苷酸序列为5’-GCCACCAAAGCTAGCAACAC-3’,如SEQID NO:8所示；

SNP3的PCR扩增用下游引物的核苷酸序列为5’-TTGCAGTCGAGGAAGCACAT-3’,如SEQID NO:9所示。

本发明还提供了一种用于检测葫芦耐热特性的试剂盒，包括上述的引物组。

本发明还提供了上述的引物组或上述的试剂盒在耐热葫芦植株筛选中的应用。

本发明还提供了一种葫芦耐热特性检测方法，通过对待测植株进行上述的分子标记的检测，当SNP1分子标记的第433位碱基是A时为耐热性状的植株；当SNP2分子标记的第199位碱基是G时为耐热性状的植株；当SNP3分子标记的第672位碱基是A时为耐热性状的植株。

优选的：包括以下步骤：

(1)提取待测样本基因组DNA；

(2)以提取的待测样本基因组DNA为模板，利用上述的引物组，进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；

(3)对PCR扩增产物进行纯化、测序和鉴定。