[发明专利]一种与山羊生长性状相关的NFAT5基因分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与山羊生长性状相关的NFAT5基因分子标记及其应用，所述的分子标记位于山羊NFAT5基因5’侧翼序列中；所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为392bp，该序列包括部分5’侧翼序列(‑1～‑238bp)和部分5’非翻译区序列(+1～+154bp)组成，在该序列中第222bp处存在一处CG碱基突变，将该突变命名为c.‑454CG；本发明还提供了与山羊生长性状关联的SNP检测试剂盒，包括：如SEQ ID NO.2～3所示的引物对；如SEQ ID NO.4所示的SNaPshot单碱基延伸引物。本发明发掘了新的与山羊生长性状相关联分子标记，实现了对山羊生长性状进行早期选择，检测方法快速、准确，且不受养殖环境条件因素影响。

技术领域

本发明涉及山羊分子标记筛选技术领域，尤其涉及一种与山羊生长性状相关的NFAT5基因分子标记及其应用。

背景技术

我国山羊饲养历史悠久，是常见的居民肉食来源。近年来，全球山羊养殖规模不断扩大，尤其中国更是山羊养殖大国。随着消费者对于健康饮食要求的不断增长，由于羊肉具有健康、安全的营养特性，促使其在肉类消费中的比重不断上升。包括体重体尺在内的生长性状是山羊生产中最为重要的经济性状。因此，研究如何通过选育提高山羊的生长性状对于山羊产业和山羊育种研究来说都具有十分重要的意义。

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)指的是由个体间基因组中同一位置单个核苷酸(A、T、C和G)发生变异所引起的DNA序列的多态性，主要包括碱基的转换、颠换、插入或缺失等四种形式。SNP具有数量多、分布广、杂合率低、遗传稳定性好、适用于高通量自动化检测等特点。因此，SNP可作为分子育种、基因定位、群体进化等研究的首选工具。分子标记辅助选择(Marker-assisted selection，MAS)利用与特定性状相关联的分子标记作为辅助手段进行选择育种。具有快速、准确、不受环境影响的优点，从而加快育种速度，尤其对于低遗传力性状和难以测量的性状具有更大的优势。随着应用基因组学、分子生物学和分子遗传学理论技术的不断发展，MAS技术能有效的加快山羊重要经济性状的选择进展，可对我国山羊产业的可持续发展将带来巨大的经济效益。

活化T细胞核因子5(Nuclear factor of activated T-cells 5,NFAT5)基因是转录因子蛋白Rel家族的一员，其在高渗透压情况下被磷酸化激活，发挥调节细胞内外的渗透压平衡。有研究发现，NFAT5可以显著促进小鼠卵泡颗粒细胞的增值，表明其可能调控卵泡的发育，从而影响产羔数。迄今为止，尚无有关山羊NFAT5基因做为山羊生长性状的分子标记的研究的相关报道。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术之缺陷，提供了与山羊生长性状关联的分子标记及其应用，本发明发掘了与山羊生长性状关联的分子标记，为山羊生长性状的分子标记辅助育种提供了一种新的分子标记。

本发明的目的之一在于提供一种与山羊生长性状关联的分子标记，所述的分子标记位于山羊NFAT5基因5’侧翼序列中，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，该序列长度为392bp，在该序列中第222bp处存在一处CG碱基突变。

优选地，所述序列中第222bp处的C或G的碱基多态性位点，表现为CC、CG或GG三种基因型，其中C优势等位基因。

本发明的目的之二在于提供所述的分子标记在山羊生长性状标记辅助选择中的应用。

本发明的目的之三在于提供一种山羊NFAT5基因序列中与山羊生长性状关联SNP的检测试剂盒，包括：

用于扩增包含c.-454CG位点的SEQ ID NO.1所示序列的引物对：上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

以及一个用于检测c.-454CG位点的SNaPshot单碱基延伸引物如SEQ ID NO.4所示。