[发明专利]寡聚核苷酸组、试剂盒及其应用有效
申请号: | 202011194966.5 | 申请日: | 2020-10-30 |
公开(公告)号: | CN112322784B | 公开(公告)日: | 2023-01-24 |
发明(设计)人: | 马立新;王珑瑜;何如怡;吕彬;王飞;王亚平 | 申请(专利权)人: | 湖北大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 易贤卫 |
地址: | 430062 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核苷酸 试剂盒 及其 应用 | ||
1.寡聚核苷酸组,用于对病毒目的基因进行LCR扩增,其特征在于,包括四种寡聚核苷酸分子,分别标记为A、B、A’和B’;
若目的基因的核酸分子为双链DNA分子,所述A分子和所述B分子可与双链DNA分子中的一条链互补配对,所述分子A’和所述B’分子可与双链DNA分子中的另一条链互补配对;
若目的基因的核酸分子为单链RNA分子,所述A分子和所述B分子可分别与单链RNA分子逆转录的双链cDNA分子中一条链互补配对以形成连接产物,所述A’分子和所述B’分子可分别与所述连接产物进行再次互补配对;所述B分子、所述A’分子和所述B’分子均带有磷酸基团,四种所述寡聚核苷酸的长度均为14nt以下。
2.根据权利要求1所述的寡聚核苷酸组,其特征在于,所述目的基因包括HPV11病毒E6基因、HPV16病毒E6基因、HPV18病毒L1基因、SARS-CoV-2病毒N基因、SARS-CoV-2病毒ORF-1a基因、SARS-CoV-2病毒S基因、SARS-CoV-2病毒突变体S基因、SARS病毒N基因和MERS病毒N基因中的至少一种。
3.根据权利要求2所述的寡聚核苷酸组,其特征在于,具体为:
靶向HPV11病毒E6基因的所述寡聚核苷酸组包括:
11-A:CTGTGGGGGAACCT,如SEQ ID NO.1所示;
11-B:GTGCCTGATGACCT,如SEQ ID NO.2所示;
11-A’:TCATCAGGCAC,如SEQ ID NO.3所示;
11-B’:AGGTTCCCCCA,如SEQ ID NO.4所示;
靶向HPV16病毒E6基因的所述寡聚核苷酸组包括:
16-A:AATGTTTCAGGACCC,如SEQ ID NO.5所示;
16-B:ACAGGAGCGACCCA,如SEQ ID NO.6所示;
16-A’:GGGTCGCTCCTGT,如SEQ ID NO.7所示;
16-B’:GGGTCCTGAAACAT,如SEQ ID NO.8所示;
靶向HPV18病毒L1基因的所述寡聚核苷酸组包括:
18-A:GGATTGCGTCGCAA,如SEQ ID NO.9所示;
18-B:GCCCACCATAGGCC,如SEQ ID NO.10所示;
18-A’:GCCTATGGTGGGC,如SEQ ID NO.11所示;
18-B’:TTGCGACGCAATC,如SEQ ID NO.12所示;
靶向SARS-CoV-2病毒N基因的所述寡聚核苷酸组包括:
SC2N-A:TGTCAAGCAGCAGC,如SEQ ID NO.13所示;
SC2N-B:AAAGCAAGAGCAGC,如SEQ ID NO.14所示;
SC2N-A’:GCTCTTGCTTT,如SEQ ID NO.15所示;
SC2N-B’:GCTGCTGCTTG,如SEQ ID NO.16所示;
靶向SARS-CoV-2病毒ORF-1a基因的所述寡聚核苷酸组包括:
SC2ORF-A:GAGTTGATCACAACT,如SEQ ID NO.17所示;
SC2ORF-B:ACAGCCATAACCTT,如SEQ ID NO.18所示;
SC2ORF-A’:AGGTTATGGCTGT,如SEQ ID NO.19所示;
SC2ORF-B’:AGTTGTGATCAACT,如SEQ ID NO.20所示;
靶向SARS-CoV-2病毒S基因的所述寡聚核苷酸组包括:
SC2S-A:TGTGCAGTTAACAT,如SEQ ID NO.21所示;
SC2S-B:CCTGATAAAGAACA,如SEQ ID NO.22所示;
SC2S-A’:TTGCTGTTCTTTATCAGG,如SEQ ID NO.23所示;
SC2S-B’:ATGTTAACTGCACA,如SEQ ID NO.24所示;
靶向SARS-CoV-2病毒突变体S基因的所述寡聚核苷酸组包括:
SC2SM-A:TGTGCAGTTAACAC,如SEQ ID NO.25所示;
SC2SM-B:CCTGATAAAGAACA,如SEQ ID NO.26所示;
SC2SM-A’:TTGCTGTTCTTTATCAGG,如SEQ ID NO.27所示;
SC2SM-B’:GTGTTAACTGCACA,如SEQ ID NO.28所示;
靶向SARS病毒N基因的所述寡聚核苷酸组包括:
SN-A:GGTCTAGCAGCAAT,如SEQ ID NO.29所示;
SN-B:AGCGCGAGGGCAGT,如SEQ ID NO.30所示;
SN-A’:CTGCCCTCGCGCT,如SEQ ID NO.31所示;
SN-B’:ATTGCTGCTAGAC,如SEQ ID NO.32所示;
靶向MERS病毒N基因的所述寡聚核苷酸组包括:
MN-A:CAGATGGACCTGGAGA,如SEQ ID NO.33所示;
MN-B:AGTGCCGCGGG,如SEQ ID NO.34所示;
MN-A’:CCCGCGGCACT,如SEQ ID NO.35所示;
MN-B’:TCTCCAGGTCCATC,如SEQ ID NO.36所示。
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