[发明专利]一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记及其应用和评估水稻耐淹特性的方法

说明书

本发明提供了一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记及其应用和评估水稻耐淹特性的方法，属于植物分子遗传技术领域，包括：分子标记位于水稻第1号染色体上第24100081bp位点、第4号染色体上第17830770bp位点、第5号染色体上第27087016bp位点、第8号染色体上第11254907bp位点、第11号染色体上第1862072bp位点和第11号染色体上第20910780bp位点。采用本发明提供的分子标记能够辅助筛选耐淹水稻品种。

技术领域

本发明属于植物分子遗传技术领域，尤其涉及一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记及其应用和评估水稻耐淹特性的方法。

背景技术

水稻品种大部分在淹没一周后会死亡，在南亚和东南亚地区，每年因洪涝灾害的损失就达10亿美元以上。因而，提高水稻品种的耐淹性一直是世界水稻研究领域的热点之一。

在我国，仅2014年受洪涝灾害影响的耕地面积有5919khm²，成灾面积 2830khm²，直接经济损失达245亿元。尤其在南方稻区，洪涝频繁发生，危害水稻生长、存活，低洼稻田减产严重。同时，目前农村劳力大量流失，人力资源不足，直播稻适应了当前形势，正大面积推广。机械化的大田平整度达不到秧田的标准，种子萌发期的耐淹重要性突显出来，日益受到重视，改良水稻耐淹涝能力已成为水稻育种的重要目标。因此，发掘、克隆具有自主知识产权的新耐淹基因，在加快水稻耐淹品种的培育，保障粮食产量及减少水稻受灾损失等领域具有重大的理论和现实意义。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记及其应用和评估水稻耐淹特性的方法，采用本发明提供的分子标记能够辅助筛选耐淹水稻品种。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记，包括：

所述分子标记位于水稻第1号染色体上第24100081bp位点，所述位点上存在T/G碱基突变，携带T的水稻的耐淹特性高于携带G的水稻；

所述分子标记位于水稻第4号染色体上第17830770bp位点，所述位点上存在G/A碱基突变，携带G的水稻的耐淹特性高于携带A的水稻；

所述分子标记位于水稻第5号染色体上第27087016bp位点，所述位点上存在T/A碱基突变，携带T的水稻的耐淹特性高于携带A的水稻；

所述分子标记位于水稻第8号染色体上第11254907bp位点，所述位点上存在G/T碱基突变，携带G的水稻的耐淹特性高于携带T的水稻；

所述分子标记位于水稻第11号染色体上第1862072bp位点，所述位点上存在A/T碱基突变，携带A的水稻的耐淹特性高于携带T的水稻；

所述分子标记位于水稻第11号染色体上第20910780bp位点，所述位点上存在A/C碱基突变，携带A的水稻的耐淹特性高于携带C的水稻。

优选的，所述水稻第1号染色体上第24100081bp位点的碱基突变，携带T的水稻在水淹下，水稻的苗长长于携带G的水稻。

优选的，所述水稻第4号染色体上第17830770bp位点的碱基突变，携带G的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带A的水稻。

优选的，所述水稻第5号染色体上第27087016bp位点的碱基突变，携带T的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带A的水稻。

优选的，所述水稻第8号染色体上第11254907bp位点的碱基突变，携带G的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带T的水稻。

优选的，所述水稻第11号染色体上第1862072bp位点的碱基突变，携带A的水稻在水淹下，水稻的苗长长于携带T的水稻。