[发明专利]一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记及其应用和评估水稻耐淹特性的方法

权利要求书

1.一套与水稻耐淹特性紧密连锁的分子标记在筛选耐淹水稻中的应用；

所述分子标记，包括：

所述分子标记位于水稻第1号染色体上第24100081bp位点，所述位点上存在T/G碱基突变，携带T的水稻的耐淹特性高于携带G的水稻；

所述分子标记位于水稻第4号染色体上第17830770bp位点，所述位点上存在G/A碱基突变，携带G的水稻的耐淹特性高于携带A的水稻；

所述分子标记位于水稻第5号染色体上第27087016bp位点，所述位点上存在T/A碱基突变，携带T的水稻的耐淹特性高于携带A的水稻；

所述分子标记位于水稻第8号染色体上第11254907bp位点，所述位点上存在G/T碱基突变，携带G的水稻的耐淹特性高于携带T的水稻；

所述分子标记位于水稻第11号染色体上第1862072bp位点，所述位点上存在A/T碱基突变，携带A的水稻的耐淹特性高于携带T的水稻；

所述分子标记位于水稻第11号染色体上第20910780bp位点，所述位点上存在A/C碱基突变，携带A的水稻的耐淹特性高于携带C的水稻；

所述分子标记的信息基于的日本晴基因组序列信息版本号为Rice GenomeAnnotation Project - MSU Rice Genome Annotation (Osa1) Release 7。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第1号染色体上第24100081bp位点的碱基突变，携带T的水稻在水淹下，水稻的苗长长于携带G的水稻。

3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第4号染色体上第17830770bp位点的碱基突变，携带G的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带A的水稻。

4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第5号染色体上第27087016bp位点的碱基突变，携带T的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带A的水稻。

5.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第8号染色体上第11254907bp位点的碱基突变，携带G的水稻在水淹下，水稻种子的萌动时间早于携带T的水稻。

6.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第11号染色体上第1862072bp位点的碱基突变，携带A的水稻在水淹下，水稻的苗长长于携带T的水稻。

7.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻第11号染色体上第20910780bp位点的碱基突变，携带A的水稻在水淹下，水稻的苗长长于携带C的水稻。