[发明专利]一种同时检测酵母所有端粒长度的方法有效

专利信息
申请号: 202010391704.1 申请日: 2020-05-11
公开(公告)号: CN111575342B 公开(公告)日: 2022-12-02
发明(设计)人: 刘军;刘俊平 申请(专利权)人: 杭州师范大学
主分类号: C12Q1/6804 分类号: C12Q1/6804
代理公司: 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 代理人: 沈渊琪
地址: 311121 浙江省杭*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 同时 检测 酵母 所有 端粒 长度 方法
【权利要求书】:

1.一种同时检测酵母所有端粒长度的方法,其特征在于包括以下步骤:

(1)取酵母细胞的基因组DNA,加入1微升2U限制性内切酶MmeI在50微升体系中消化过夜,得到酵母所有32个端粒的最小末端限制性片段;

(2)置于含有1XTBE缓冲液的0.9%琼脂糖凝胶中电泳分离处理;

(3)电泳完成后,将凝胶浸没于0.25M盐酸中缓慢摇动30min进行脱嘌呤处理,倒去0.25M盐酸后用水洗2次,加入含有1.5 M NaCl和0.5 M NaOH的强碱变性缓冲液,使凝胶浸没缓慢摇动处理30min,倒去强碱变性缓冲液后水洗2次,再加入含有3M NaCl和0.5M Tris-HCl pH7.0的中和缓冲液,使凝胶浸没缓慢摇动处理30min;

(4)利用虹吸法将经步骤(3)处理后的凝胶上的DNA用含有0.3 M NaCl和0.03 M柠檬酸钠的2XSSC缓冲液过夜转移至带正电荷的尼龙膜上,在上述带有DNA的尼龙膜的正面利用紫外交联仪进行能量交联200 mJ/cm2 ,10min;

(5)利用地高辛试剂盒标记长度为250碱基对的TG1-3序列探针,做DNA印记分析,检测端粒长度。

2.如权利要求1所述的一种同时检测酵母所有端粒长度的方法,其特征在于所述步骤(1)中50微升体系包含5微摩尔终浓度SAM。

3. 如权利要求1所述的一种同时检测酵母所有端粒长度的方法,其特征在于所述步骤(2)中凝胶的长´宽´高为:18.5cm´15 cm ´1 cm,电泳分离处理条件为:恒压90V,2.6V/cm,30min,再恒压120 V,3.5V/cm,3-3.5h,所述每厘米为正负电极间的距离。

4. 如权利要求1所述的一种同时检测酵母所有端粒长度的方法,其特征在于所述步骤(5)中标记TG1-3序列探针的方法为:模板量为1微克,加去离子水体积调整为16微升,98℃变性处理5min立即置于冰水浴中2min使模板DNA处于单链状态,1000rpm离心2min后加入试剂盒中标记试剂4微升,37℃温育20小时后,加入2微升0.2 M EDTA在65℃处理10min终止反应后,保存于-20℃备用。

5. 如权利要求1所述的一种同时检测酵母所有端粒长度的方法,其特征在于所述步骤(5)中DNA印记分析方法为:将紫外交联后的膜DNA面朝上,置于杂交管中,杂交炉缓慢转动,60℃进行预杂交处理1-2小时,探针首次使用于98℃处理10min,立即置于冰水浴中10min,倒去预杂交液,加入经过变性冷却的探针使得探针终浓度为25 ng/ml,缓慢转动60℃杂交过夜,期间封闭和结合碱性磷酸酶标记二抗的步骤参考试剂盒条件进行,最后采用终浓度为1%SDS的40 mMpH7.2磷酸缓冲液洗膜2次,每次20min,恒定转速80rpm/min。

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