[发明专利]评价基因组改变的组合物和方法

权利要求书

1.多种靶标捕获试剂，包括第一靶标捕获试剂(R1)和第二靶标捕获试剂(R2)，

其中：

R1包括包含结合对的功能性第一成员的R1和任选地缺少所述结合对的功能性第一成员的R1；并且

R2包括包含结合对的功能性第一成员的R2和缺少所述结合对的功能性第一成员的R2；

其中所述结合对的第一成员能够结合到设置在底物上的所述结合对的第二成员，并且

其中包含所述结合对的功能性第一成员的R1的比例大于包含所述结合对的功能性第一成员的R2的比例。

2.根据权利要求1所述的多种靶标捕获试剂，其中包含所述结合对的功能性第一成员的R1的比例，比包含所述结合对的功能性第一成员的R2的比例大至少0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900或1,000倍。

3.根据权利要求1或2所述的多种靶标捕获试剂，其中每个R1能够形成第一片段/第一靶标捕获试剂(F1/R1)杂合体，并且每个R2能够形成第二片段/第二靶标捕获试剂(F2/R2)杂合体，并且

其中F1、F2或两者均包含来自表1A-5A中描述的基因的对象区间。

4.根据权利要求3所述的多种靶标捕获试剂，其中：

F1包含高测序深度事件；并且

F2包含低测序深度事件，例如，其水平与确定一种或多种生物标志物例如肿瘤突变负荷(TMB)或微卫星不稳定性(MSI)有关。

5.根据前述权利要求中任一项所述的多种靶标捕获试剂，其还包含第三靶标捕获试剂(R3)，

其中R3包括包含所述结合对的功能性第一成员的R3和缺少所述结合对的功能性第一成员的R3；

其中所述结合对的第一成员能够结合到设置在底物上的所述结合对的第二成员，并且

其中包含所述结合对的功能性第一成员的R2的比例大于包含所述结合对的功能性第一成员的R3的比例。

6.根据前述权利要求中任一项所述的多种靶标捕获试剂，其中每个R3能够形成第三片段/第一靶标捕获试剂(F3/R3)杂合体，并且

其中F3包含来自表1A-5A中描述的基因的对象区间。

7.一种分析样品的方法，包括：

使多个第一片段/第一靶标捕获试剂(F1/R1)杂合体与底物接触以形成F1/R1杂合体/底物复合物；以及

使多个第二片段/第二靶标捕获试剂(F2/R2)杂合体与底物接触形成F2/R2杂合体/底物复合物，

其中与底物结合的F1/R1杂合体的比例大于与底物结合的F2/R2杂合体的比例，

从而分析样品。

8.根据权利要求7所述的方法，其中：

F1包含高测序深度事件；并且

F2包含低测序深度事件，例如，其水平与确定一种或多种生物标志物例如肿瘤突变负荷(TMB)或微卫星不稳定性(MSI)有关。

9.根据权利要求7或8所述的方法，其中所述R1的一部分和所述R2的一部分包含结合对的功能性第一成员，并且其中所述结合对的所述第一成员能够结合到设置在底物上的所述结合对的第二成员。

10.根据权利要求7-9中的任一项所述的方法，其中所述R1的一部分、所述R2的一部分或两者缺少结合对的功能性第一成员，例如，改变的或封闭的第一成员，其不能结合到设置在底物上的结合对的第二成员或针对它具有降低的结合亲和力。

11.根据权利要求7-10中任一项所述的方法，其中：

R1包括包含结合对的功能性第一成员的R1和缺少所述结合对的功能性第一成员的R1；并且

R2包括包含结合对的功能性第一成员的R2和缺少所述结合对的功能性第一成员的R2。