[发明专利]用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测试剂盒、检测方法及应用在审
申请号: | 201711377828.9 | 申请日: | 2017-12-19 |
公开(公告)号: | CN108165643A | 公开(公告)日: | 2018-06-15 |
发明(设计)人: | 张石磊;王春光;张铁;吕建存;贾泽 | 申请(专利权)人: | 河北农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/10;C12R1/19 |
代理公司: | 石家庄国为知识产权事务所 13120 | 代理人: | 林艳艳 |
地址: | 071000 河北*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 大肠杆菌 检测试剂 流出系统 细菌 荧光定量PCR仪 抗性基因检测 微生物耐药性 试剂盒检测 相对表达量 差异表达 氟喹诺酮 技术空白 内参基因 相关基因 基因 表达量 高通量 检测 扩增 引物 应用 直观 填补 | ||
1.一种用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒用于高通量荧光定量PCR检测大肠杆菌药物流出系统acr,所述检测试剂盒包括16S rDNA为内参基因的acrF、acrR、acrE、acrS基因的引物,所述引物的序列如下:
16S的上游引物:AGAGTTTGATCCTGGCTCAG;
16S的下游引物:GGTTACCTTGTTACGACTT;
acrF的上游引物:GCGGCCAGGCACAAAA;
acrF的下游引物:TACGCTCTTCCCACGGTTTC;
acrR的上游引物:GCGCTGGAGACACGACAAC;
acrR的下游引物:GCCTTGCTGCGAGAACAAA;
acrE的上游引物:AAATACATCAGCCAGCAGGAG;
acrE的下游引物:GTTCAGTCGTTTGCCCATTAG;
acrS的上游引物:AAAAGAACCAAAGCCGAAGC;
acrS的下游引物:CGAAGTGCCAGTAGATAGCG。
2.一种用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法,其特征在于:所述检测方法为高通量荧光定量PCR方法,所述检测方法至少包括以下步骤:
步骤1、从待测样品中提取DNA样品;
步骤2、采取权利要求1所述大肠杆菌药物流出系统acr的检测试剂盒对步骤1所提取的所述DNA样品使用高通量荧光定量PCR仪进行扩增反应;
步骤3、对所得结果进行数据分析。
3.如权利要求2所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法,其特征在于:所述高通量荧光定量PCR反应体系组成如下:Roche FastStart Universal SYBR GreenMaster:5μL,ddH2O:3μL,上游引物:0.75μL,下游引物:0.75μL,DNA样品:0.5μL。
4.如权利要求3所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法,其特征在于:所述DNA样品的浓度为5ng/uL,所述上游引物和下游引物的浓度均为0.1μM。
5.如权利要求2所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法,其特征在于:所述步骤2中扩增反应的条件为:首先在95℃条件下反应10min,进行1次循环;其次在95℃条件下反应30s,进行40次循环,最后在60℃条件下反应30s,进行40次循环。
6.如权利要求2所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法,其特征在于:所述步骤3中采取数据的平均值、标准偏差、倍数变化值、热图进行分析。
7.如权利要求1所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测试剂盒或权利要求2-6任一项所述的用于大肠杆菌药物流出系统acr的检测方法在大肠杆菌药物流出系统acr领域中的应用。
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