[发明专利]微生物的识别方法在审
申请号: | 201680084059.0 | 申请日: | 2016-03-31 |
公开(公告)号: | CN108884485A | 公开(公告)日: | 2018-11-23 |
发明(设计)人: | 田村广人;山本奈保美;加藤晃代;岛圭介;船津慎治 | 申请(专利权)人: | 株式会社岛津制作所;学校法人名城大学 |
主分类号: | C12Q1/04 | 分类号: | C12Q1/04 |
代理公司: | 上海立群专利代理事务所(普通合伙) 31291 | 代理人: | 侯莉;毛立群 |
地址: | 日本国*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 微生物 标记蛋白质 质荷比 质谱 读取 核糖体蛋白质 大肠杆菌 志贺氏菌属 质量分析 菌种 | ||
1.一种微生物的识别方法,其特征在于,具有:
a)对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;
b)从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;
c)识别步骤,基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有大肠杆菌、志贺氏菌(Shigella)属菌以及阿尔伯蒂埃希氏菌(Escherichia albertii)的哪一个菌种进行识别,
使用13种核糖体蛋白质S5、L15、S13、L31、L22、L19、L20、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
2.如权利要求1所述的微生物的识别方法,其特征在于,
使用7种核糖体蛋白质L31、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
3.如权利要求2所述的微生物的识别方法,其特征在于,
使用2种核糖体蛋白质L13以及L29作为所述标记蛋白质。
4.如权利要求2所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种为阿尔伯蒂埃希氏菌(Escherichia albertii)、志贺氏痢疾杆菌(Shigelladysenteriae)、福氏志贺氏菌(Shigella flexneri)、宋内氏志贺氏菌(Shigella sonnei)、鲍氏志贺氏菌(Shigella boydii)、大肠杆菌的任一种。
5.如权利要求4所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种是志贺氏菌属菌时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质L29以及L13、核糖体蛋白质L31以及L13中的任一种。
6.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种是阿尔伯蒂埃希氏菌(Escherichia albertii)时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质L31、HdeB、L25以及HNS、核糖体蛋白质L25以及S15、核糖体蛋白质L29中的任一种。
7.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种是志贺氏痢疾杆菌(Shigella dysenteriae)时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质HdeB、L29、L13的任一种。
8.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种为福氏志贺氏菌(Shigella flexneri)时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质L31以及L29的任一种。
9.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种为宋内氏志贺氏菌(Shigella sonnei)时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质L13。
10.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
所述菌种为鲍氏志贺氏菌(Shigella boydii)时,
作为所述标记蛋白质,至少包括核糖体蛋白质L25、HNS以及L13中的一种。
11.如权利要求3所述的微生物的识别方法,其特征在于,
使用聚类解析,对所述试样所含的微生物进行分类,该聚类解析至少将源自核糖体蛋白质HdeB、HNS、L13以及L29的峰的质荷比m/z作为指标。
12.如权利要求11所述的微生物的识别方法,其特征在于,
进而至少将源自核糖体蛋白质L31、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29的质荷比m/z作为指标。
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