[发明专利]一种与桃果实甜酸风味性状相关的SNP标记及其应用有效

申请号：	201611091395.6	申请日：	2016-12-01
公开（公告）号：	CN108130378B	公开（公告）日：	2021-08-20
发明（设计）人：	谢华;徐摇光;任飞;于洋	申请（专利权）人：	北京市农林科学院
主分类号：	C12Q1/6895	分类号：	C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司：	北京纪凯知识产权代理有限公司 11245	代理人：	关畅;白艳
地址：	100097 ***	国省代码：	北京;11
权利要求书：	查看更多	说明书：	查看更多
摘要：
搜索关键词：	一种果实风味性状相关 snp 标记及其应用
钻瓜网技术展会专利词库专利权人专利榜在售专利公布日期热门专利

【说明书】：

本发明公开了一种与桃果实甜酸风味性状相关的SNP标记及其应用。本发明提供了检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实是否为酸性表型中的应用；所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或序列1第601位核苷酸。本发明基于现有的284份测序及芯片的桃SNP标记数据，开展了与表型性状的关联分析，成功在5号染色体上定位到一个与甜酸相关的SNP标记，相较于之前的RAPD、AFLP、SSR标记，可将预测的准确性提高到85％以上，使得预测的结果更加可靠。在种子时期进行个体甜酸性表型的预测，提高选种效率、节约育种成本。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，属于桃分子育种和生物技术领域，尤其涉及一种与桃果实甜酸风味性状相关的SNP标记及其应用。

背景技术

桃(Prunus persica)的果实富含蛋白质、糖类、膳食纤维、维生素等多种营养物质，深受消费者的喜爱。桃果实的甜酸风味是桃的重要经济性状之一，根据品质的不同主要分为酸和非酸的桃。桃起源于中国，因此我国在桃资源的种类及数量上远高于其他的国家，但现有经济价值较高的品种都为育成性品种，因此新品种的选育是提高我国桃品质及产量的重要影响因素。现在桃的育种主要是常规的杂交产生新品种，种植后3-4年才能开花结果，育种周期长、成本高。近年来开发了与甜酸风味性状相关的RAPD、AFLP、SSR等分子标记辅助育种，但是限于材料的数量、标记的密度、研究的手段等众多因素的限制，导致检测的准确率较低。因此为了有效降低错误率和提高检测效率，需要鉴定鉴别出甜酸相关标记或者基因，为桃果树的优良品种的选育提供技术支撑。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指基因组上单碱基的多态性，即一个位点有多种不同的碱基型，多态性丰富，是造成物种多样性的重要原因。SNP作为新一代最高密度的分子标记，可与个体的表型进行关联分析，是研究农艺性状的遗传机制的重要数据依据。目前对桃SNP分型的高通量方法主要有两种，高通量测序技术及基因芯片技术。

发明内容

本发明的一个目的是提供检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质的用途。

本发明提供的检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实是否为酸性表型中的应用；

所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或SEQ ID NO:1第601位核苷酸。

本发明的另一个目的是提供检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质。

本发明提供的检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定待测桃树的果实是否为酸性表型产品中的应用；

所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或SEQ ID NO:1第601位核苷酸。

本发明第三个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测桃树果实的酸性表型的方法。

本发明提供的方法，包括如下步骤：检测待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型为TT、TC还是CC，

若所述待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型为TT，则该待测桃树的果实为或候选为酸性表型；

若所述待测桃树基因组的g.1495589位点的基因型为TC或者CC，则该待测桃树的果实为或候选为非酸性表型；

所述g.1495589位点为5号染色体的第1495589位或SEQ ID NO:1第601位核苷酸。