[发明专利]一种利用荧光检测微囊藻细胞DNA损伤的方法有效
申请号: | 201610109195.2 | 申请日: | 2016-02-26 |
公开(公告)号: | CN105543399B | 公开(公告)日: | 2019-07-16 |
发明(设计)人: | 吴振斌;鲁志营;刘碧云;何燕;贺锋;周巧红;徐栋;张甬元 | 申请(专利权)人: | 中国科学院水生生物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6806 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 王敏锋 |
地址: | 430072 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 荧光 检测 微囊藻 细胞 dna 损伤 方法 | ||
1.一种利用荧光检测微囊藻细胞DNA损伤的方法,其步骤是:
(a)分组设定:除待检测样品外设置正常生长的样品为对照组,待检测样品标记为t,对照样品标记为0,将待检测样品和对照样品分别平均分成三组,测试样品标记为Pt样品、Tt样品和Bt样品;对照样品分别标记为P0样品、T0样品和B0样品,在以下步骤(b)至(f)中,对测试样品和对照样品处理方式相同,在以下步骤(b)至(f)的表述中,T样品包含Tt样品和T0样品,P样品包含Pt样品和P0样品,B样品包含Bt样品和B0样品;
(b)去除细胞角质鞘:1500×g离心15min收集T、P和B样品中藻细胞,将细胞重悬浮于1mL SE缓冲液:SE缓冲液的配制方法:50mM NaCl,50mM Tris,5mM EDTA,调pH至8.0颠倒混匀洗涤2~5min;
(c)细胞裂解:1500×g离心15min,去上清液,将细胞分别重悬浮于415V体积的Lysis裂解液:Lysis裂解液的配制方法:40mM EDTA,400mM NaCl,50mM Tris-HCl,pH=9.0,分别加入50V体积的浓度为50mg/ml溶菌酶,上下颠倒样品管三次,37℃反应20min;然后加入10V体积浓度为5mg/ml的蛋白酶K和25V体积浓度为10%的十二烷基磺酸钠,上下颠倒样品管三次,50℃反应2h;
(d)细胞DNA链解旋:T样品加入1000V体积的超纯水,混匀;B样品加入500V体积的0.1MNaOH混匀,超声处理180s,20℃温浴30min,随后加入500V体积的0.1M HCl,混匀;P样品,加入500V体积的0.1M NaOH混匀,20℃温浴30min,随后加入500V体积的0.1M HCl,混匀;
(e)染色:分别向以上T、P和B样品中加入100V体积的60μM Hoechest33258:溶解于0.1M磷酸缓冲液中,pH=7.6,混匀,25~30℃下10000rpm离心5min,整个过程避光;
(f)荧光测定:根据不同检测器分别取对应量T、P和B样品上清液,于荧光检测器中测荧光强度,T、P和B样品的荧光强度分别记为fP、fB和fT;
(g)结果计算:DNA链断裂指数SSF的计算:
首先,计算残留双链DNA百分比F,F=(fP-fB)/(fT-fB)×100%
然后,根据所计算出的F值计算DNA链断裂指数,计算公式为
SSF=-ln(Ft/F0)
其中,F0为对照组的F值,由对照组的P0样品、T0样品和B0样品的荧光强度f计算得到;Ft为处理组的F值,由处理组Pt样品、Tt样品和Bt样品的荧光计算强度f得到。
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