[发明专利]一种利用EST‑SSR分子标记快速鉴定辣椒品种金椒纯度的方法有效

专利信息
申请号: 201510398026.0 申请日: 2015-07-08
公开(公告)号: CN104928396B 公开(公告)日: 2018-04-13
发明(设计)人: 袁晓伟;李兴盛;韩永升 申请(专利权)人: 山东省华盛农业股份有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895
代理公司: 济南舜源专利事务所有限公司37205 代理人: 苗峻
地址: 262500 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 利用 est ssr 分子 标记 快速 鉴定 辣椒 品种 纯度 方法
【权利要求书】:

1.一种利用EST-SSR分子标记快速鉴定辣椒品种金椒纯度的方法,其特征在于:利用EST-SSR引物进行鉴定,所述的EST-SSR引物命名为ClHS1,其正向序列为5’-AGTTTTAAGAGCAAGGAGGCTC-3’,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;反向序列为5’-ATCCAACCCAATCCCCAGTC-3’,其核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;

具体步骤如下:

(1)提取金椒杂交种及其亲本叶片基因组DNA;

(2)以第(1)步提取的基因组DNA为模板,用EST-SSR引物ClHS1进行PCR扩增:

PCR反应体系为20μL,其中包括10×PCR Buffer 2μL,0.4mM dNTPs,引物各10μM,1U Taq DNA聚合酶,模板100ng,无菌超纯水补齐至20μL;

扩增程序为:94℃预变性3min;94℃变性30s,57℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环;72℃终延伸10min;PCR产物保存于10℃;

(3)扩增产物检测:5μL扩增产物与2μL上样缓冲液混合,之后经丙烯酰胺质量体积比为10%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,160v恒定电压电泳1.5h,银染显色进行带型统计;

其中所采用的非变性聚丙烯酰胺凝胶中丙烯酰胺∶甲叉双丙烯酰胺的质量比为29∶1;

(4)根据特异谱带的扩增结果鉴定“金椒”杂交种的纯度,判定标准为:

母本具有120bp、200bp、250bp、270bp特异谱带;父本具有120bp、200bp、250bp、260bp特异谱带;杂交种具有120bp、200bp、250bp、270bp、400bp、450bp特异谱带;

根据上述鉴定结果,可以换算金椒品种纯度=(1-n/N)×100%,其中N为待测辣椒种子数目,n为单独具有父本谱带特征或单独具有母本谱带特征或既不同于“金椒”谱带特征也不同于父母本谱带特征的植株数目。

2.根据权利要求1所述的利用EST-SSR分子标记快速鉴定辣椒品种金椒纯度的方法,其特征在于:

步骤(3)中所采用的上样缓冲液选自10×甘油凝胶上样液。

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