[发明专利]利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法及试剂盒无效
申请号: | 201310298854.8 | 申请日: | 2013-07-16 |
公开(公告)号: | CN104293895A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
发明(设计)人: | 张德强;杜庆章;巩琛锐 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 吴贵明;张永明 |
地址: | 100083 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 卫星 dna 分子 标记 技术 构建 杨树 核心 种质 方法 试剂盒 | ||
1.一种利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,收集毛白杨种质资源;
S2,提取所述步骤S1中毛白杨的基因组DNA;
S3,PCR扩增在毛白杨全基因组区域开发的多态性微卫星DNA标记;
S4,利用UPGMA-聚类分析逐次随机取样及STRUCTURE模型重检测联合分析法构建8%~30%不等规模的候选核心种质群体;
S5,通过比较所述候选核心种质群体与原群体在分子遗传多样性及数量性状变异水平上的差异,确定15%的核心种质群体。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S3中进行PCR扩增的引物具有SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:40的碱基序列。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述毛白杨种质资源来自于我国北方地区十个省份一百万平方公里分布区域的毛白杨种质资源库。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述引物中的正向引物5'端用FAM荧光基团进行修饰。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,每个所述候选核心种质群体符合Hardy-Weinberg定律,无亚群体结构。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述数量性状包括木质素含量、纤维素含量、综纤维素含量、微纤丝角、纤维长、纤维宽、树高、胸径、材积、叶长、叶宽、和叶面积。
7.一种利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的试剂盒,其特征在于,包括PCR扩增的引物具有SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:40的碱基序列。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述引物中的正向引物5'端用FAM荧光基团进行修饰。
9.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,进一步包括林木基因组DNA提取试剂,所述DNA提取试剂包括含有β-巯基乙醇的CTAB提取缓冲液,液氮,体积比为24:1的氯仿-异戊醇溶液,异丙醇,70%乙醇,离子水。
10.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,进一步包括林木基因组DNA扩增试剂,所述DNA扩增试剂PCR扩增缓冲液,25mmolL-1MgCl2,10mmolL-1dNTP,Taq DNA聚合酶和双蒸水。
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