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[发明专利]一种鉴定毛白杨种质地理来源的分子标记及其应用-CN202211001294.0在审
发明人： 杜庆章;李连政;黄瑞;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种鉴定毛白杨种质地理来源的分子标记及其应用，所述分子标记位于杨树基因组FPA基因第42位碱基处，具有C/A多态性，其中，所述分子标记的基因型为AA的毛白杨个体，具有较短的年平均日照时数，分子标记的基因型为CC的毛白杨个体，具有较长的年平均日照时数。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种；具有环境适应性，适用于杨树定向引种。
一种鉴定毛白杨种质地理来源分子标记及其应用

[发明专利]一种筛选高气孔密度、高光合效率杨树的分子标记及其方法和应用-CN202110497127.9有效
发明人： 杜庆章;李连政;金卓颖;吕晨飞;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2021-05-07 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选高气孔密度、高光合效率杨树的分子标记，所述分子标记为SNP分子标记组合，由SNP1和SNP2两个SNP位点组成，其中，所述SNP1位于杨树基因组ALMT12基因下游第1182位碱基，具有A/T多态性；所述SNP2位于杨树基因组WRKY32基因上游第94位碱基，具有A/C多态性，上述两个位点组成的分子标记组合，能够在杨树幼苗期精准高效地筛选高气孔密度以及高光合效率的树种，缩短杨树育种周期。本发明还公开了用于检测上述分子标记的引物组及其应用、标记的获得方法、预测杨树气孔密度和光合效率的方法及杨树遗传改良方法等，能够显著提高杨树优异种质资源的选育效率。
一种筛选气孔密度光合效率杨树分子标记及其方法应用

[发明专利]一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法-CN202010690993.5有效
发明人：张德强;房媛媛;肖亮;权明洋;王丹;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G01N33/53 文献下载
摘要：本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。
一种检测 dna 甲基化修饰影响转录因子序列结合方法

[发明专利]一种精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记及应用-CN202210999392.1在审
发明人： 杜庆章;李连政;周嘉旋;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2022-08-19 - 公布日： 2023-03-17 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，所述分子标记位于SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的第395位，具有G/T多态性。所述分子标记的基因型为GG的毛白杨个体，春季萌芽时间较晚，所述分子标记的基因型为TT的毛白杨个体，春季萌芽时间较早；所述分子标记的基因型为GT的毛白杨个体，春季萌芽时间适中。本发明提供的精准预测毛白杨春季萌芽时间的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，显著提高育种效率，缩短杨树的育种周期。
一种精准预测毛白杨春季萌芽时间分子标记应用

[发明专利]一种与杨树木材产量相关的单体型分子标记及其应用-CN202110217748.7有效
发明人： 杜庆章;吕晨飞;李连政;周嘉旋;卢文杰;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2021-02-26 - 公布日： 2022-07-26 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种与杨树木材产量相关的单体型分子标记，所述单体型分子标记由InDel1、InDel2、InDel3、InDel4和InDel5共五个标记组合而成，所述单体型分子标记包括单体型I和单体型II，所述单体型分子标记类型为I的杨树个体，相较于单体型分子标记类型为II的杨树个体，具有较大的树高、胸径和材积。本发明提供的与木材产量相关的单体型分子标记，不受杨树的生长阶段的限制，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述单体型分子标记的引物对、试剂盒、检测方法及应用，以及杨树育种方法，为杨树分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
一种杨树木材产量相关体型分子标记及其应用

[发明专利]一种与杨树气孔形态、光合效率相关的分子标记及其应用-CN202110578666.5有效
发明人： 杜庆章;李连政;黄瑞;权明洋;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2021-05-26 - 公布日： 2022-05-31 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了与杨树气孔形态、光合效率相关的分子标记，所述分子标记为SNP标记，其位于杨树基因组ZCWCC3基因下游第3140位碱基处，具有C/T多态性，其中，分子标记的基因型为CC的杨树个体，具有较大的气孔宽度、气孔长宽比及较高的光合效率；分子标记的基因型为TT的杨树个体，具有较小的气孔宽度、气孔长宽比及较低的光合效率。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种，且具有环境适应性，适用于区域育种和气候适应育种。本发明还提供了用于扩增所述分子标记的引物对、分子标记的应用、杨树遗传改良方法和预测杨树气孔形态、光合效率的系统，为杨树的分子标记辅助选择育种提供了重要基础。
一种杨树气孔形态光合效率相关分子标记及其应用

[发明专利]筛选毛白杨抗旱新品种的分子标记及其组合、方法和应用-CN202110064846.1有效
发明人： 杜庆章;李连政;吕晨飞;周嘉旋;宋方媛;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2021-01-18 - 公布日： 2022-05-20 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了与毛白杨抗旱性状相关的分子标记及其单倍型组合，所述分子标记选自SNP1、SNP2和SNP3中的一个，分子标记组合由SNP1、SNP2和SNP3三个标记组合而成，所述分子标记组合按SNP 1～SNP3依次为A、T、C纯合基因型，即为AA‑TT‑CC基因型组合时，对应的毛白杨具有最强的抗旱能力，利用上述分子标记及其组合，能够在分子水平对毛白杨的抗旱性状做出精准评价，在杨树幼苗期精准、高效地筛选出抗旱种质。本发明还公开了利用上述分子标记鉴定或筛选抗旱能力强的毛白杨的方法及对毛白杨进行遗传改良的方法等，为毛白杨分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
筛选毛白杨抗旱新品种分子标记及其组合方法应用

[发明专利]确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法-CN201710230163.2有效
发明人：张德强;周大凌;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2017-04-10 - 公布日： 2021-10-26 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法，其包括以下步骤：分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA；分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA，进行cDNA文库构建及测序；基于测序结果进行lncRNA预测和注释；基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量，进行组织特异性表达分析，以便确定具有组织特异性的lncRNA；将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测，以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif；以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能，对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。
确定林木次生生长过程关键 lncrna 及其功能方法

[发明专利]利用上位性解析毛白杨LncRNA Pto-CRTG及其靶基因Pto-CAD5互作关系的方法及系统-CN201710266801.6有效
发明人：张德强;周大凌;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2017-04-21 - 公布日： 2021-09-24 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提出了利用上位性解析毛白杨LncRNA Pto‑CRTG及其靶基因Pto‑CAD5互作关系的方法及系统。利用根据本发明实施例的方法和系统，能够利用上位性解析毛白杨LncRNA及其靶基因的互作关系。在lncRNA Pto‑CRTG和其Cis靶基因Pto‑CAD5中发现的功能性SNP位点为这两个基因在林木分子标记育种中的应用提供了重要的参考价值。
利用上位解析毛白杨 lncrna pto crtg 及其基因 cad5 关系方法系统

[发明专利]一种联合利用microRNA及其靶基因内SNP筛选杨树木材品质性状的方法-CN201710099761.0有效
发明人：张德强;肖亮;权明洋;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2017-02-23 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto‑MIR475b基因的第1929位、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位以及Pto‑EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，其中，所述Pto‑MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto‑RPF3‑1基因的第1828位基因型为GG和Pto‑EMP16基因的第365位基因型为GG，是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。
一种联合利用 microrna 及其基因 snp 筛选杨树木材品质性状方法

[发明专利]一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短的方法、引物组、试剂盒及其应用-CN201910005388.7有效
发明人：张德强;权明洋;卢文杰;肖亮;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2019-01-03 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短的方法、引物组、试剂盒及其应用，属于植物分子育种技术领域，包括以下步骤：1)测定杨树样品基因组DNA中编码lncRNA LNC‑033373的基因内的第189位碱基，编码lncRNA LNC‑228084基因内的第346位碱基，Pto‑PO46基因内的第171位碱基和Pto‑COMT24基因内的第613位碱基；2)根据4个位点基因型的组合判断杨树样品纤维的长短；当所述基因型组合为CT‑AG‑GT‑AA时，杨树样品木材的纤维长度最长，当所述基因型组合为CT‑AA‑GT‑AC时，杨树样品木材的纤维长度最短。所述方法能够应用于杨树育种，缩短育种周期。
一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短方法引物试剂盒及其应用

[发明专利]一种选育杨树纸浆材新品种的单体型-上位性位点聚合育种模块及其应用-CN202110255234.0在审
发明人： 杜庆章;吕晨飞;卢文杰;权明洋;张德强 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2021-03-09 - 公布日： 2021-06-25 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，所述聚合育种模块包括1个单体型分子标记和1个上位性分子标记，其中，所述单体型分子标记由标记1、标记2、标记3、标记4组合而成，均位于杨树ALG14基因内，所述上位性标记为SNP标记，位于杨树IRX15‑L基因上游第980位碱基处。本发明公开的改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述标记的引物组、试剂盒及其应用、改善杨树木材品质的方法，能够在分子水平对杨树的4种木材重要品质性状做出精准评价，提高单位时间内育种群体的木材品质。
一种选育杨树纸浆新品种体型上位性位点聚合育种模块及其应用

[发明专利]一种木质素合成途径中上位性效应检测方法-CN201611163560.4有效
发明人：张德强;巩琛锐;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2020-10-02 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明提供了一种木质素合成途径中上位性效应检测方法，包括以下步骤：1)根据已知木质素合成通路，选取参与合成木质素单体的基因作为目的基因；2)对待测样品目的基因进行InDel位点基因型分型，获得待测样品的基因型数据；3)根据待测样品的基因型数据和待测样品的木质素含量，用epiSNP软件计算目的基因的上位性效应位点；4)对上位性效应位点间的上位性效应的显著性进行检测验证。本发明所述方法利用InDel位点基因型分型，采用简单的PCR就可以精准、简便的测定木质素合成通路中的上位性效应，实验技术成熟，操作简便，检测通量高。
一种木质素合成途径上位效应检测方法

[发明专利]一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法-CN201811549079.8有效
发明人：张德强;权明洋;杜庆章;肖亮;卢文杰 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2018-12-18 - 公布日： 2020-07-28 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法，涉及分子遗传学技术领域，包括获得lncRNA与基因的群体SNP基因型数据；获得基因在所研究组织的群体表达量数据；获得目标性状群体表型数据；将群体SNP基因型数据与目标性状群体表型数据关联分析；将群体SNP基因型数据与群体表达量数据关联分析；计算群体SNP基因型数据与所述目标性状群体表型数据的相关性系数r；当同时满足3个限定条件时，表明lncRNA与基因有相互作用，共同影响植物目标性状的表型变异。采用该方法准确检测毛白杨lncRNA LNC‑0052611与基因Pto‑COMT25之间存在互作关系，且该互作关系影响了毛白杨胸径的表型变异。
一种鉴定植物 lncrna 基因方法

[发明专利]一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用-CN201710100726.6有效
发明人：张德强;权明洋;杜庆章 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2017-02-23 - 公布日： 2020-03-10 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc‑CK基因的第221位、Pto‑CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状。利用本发明的方法能够预测出杨树的生长性状，选育出速生杨树，缩短育种周期。
一种联合利用 lncrna 及其基因筛选杨树生长性状方法试剂盒应用

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