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- [发明专利]一种检测CNV的精确断点及断点周围特征的方法及装置-CN201510638685.7有效
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朱文娟
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深圳华大基因科技服务有限公司
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2015-09-30
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2018-03-06
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G06F19/22
- 本发明公开了一种检测CNV的精确断点及断点周围特征的方法,包括以下步骤使用已知的CNV检测软件检测模糊的CNV断点;提取模糊的CNV断点周围异常的read pairs;找出一端比对上而另一端被截断的read pairs,当这样的read pairs位于断点附近且有超过3个被截断超过10bp的高质量reads时,我们通过计算高质量reads的mapping部分及被剪切部分,即可得到两个精确的CNV断点;根据异常的insert size的read pairs来验证两个精确的CNV断点是否是目标CNV的两个断点;获取断点周围特征;本发明还公开了一种检测CNV的精确断点及断点周围特征的装置;本发明检测CNV的精确断点及断点周围特征的方法及装置重点考虑到比对错误,测序错误及相似序列的存在等多种因素,帮助检测CNV的精确断点及断点周围特征。
- 一种检测cnv精确断点周围特征方法装置
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