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[发明专利]一种全转录组范围单碱基分辨率检测RNA内部N7-甲基鸟苷修饰的方法及试剂盒-CN201810885063.8有效
发明人：滕花景;陈云;梁加龙;孙中生 -专利权人：中国科学院动物研究所
申请日： 2018-08-06 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： C12Q1/6858 文献下载
摘要：本发明提供了一种全转录组范围单碱基分辨率检测RNA内部m7G修饰的方法及试剂盒，属于基因测序技术领域，所述方法包括以下步骤：将所述样本细胞全转录组RNA断裂为片段化RNA；用硼氢化钠还原片段化RNA后；用苯胺盐酸盐断裂还原RNA，并在断裂后的RNA两端连接测序接头；反转录后，用测序引物进行PCR扩增构建测序文库；对所述测序文库进行测序获得测序数据；分析所述测序数据得到RNA断点次数和测序深度的比值，所述比值大于0.5，且断点位置是G碱基位点的被确定是m7G位点。本方法利用测序结果分析不仅可以分析m7G修饰在转录组中的分布还可以确定m7G修饰在转录组中的具体位点。
一种转录范围碱基分辨率检测 rna 内部 n7 甲基修饰方法试剂盒

[发明专利]用于构建单细胞转录组测序文库的试剂盒及文库构建方法-CN201510696296.X有效
发明人：柳青;王占东;邵长超;曹善柏;刘涛;杨洁;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 -专利权人：安诺优达基因科技（北京）有限公司;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司
申请日： 2015-10-22 - 公布日： 2019-05-21 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提供一种单细胞转录组测序文库的构建方法。通过将前期构建的测序用DNA片段文库用RsaI限制性内切酶进行酶切，并对酶切产物进行PCR扩增，能够显著提高对单细胞转录组测序文库进行测序时的有效数据比例。
用于构建单细胞转录序文试剂盒文库方法

[发明专利]对核酸进行扩增和测序的方法-CN200680036591.1无效
发明人： K·E·麦达德;J·M·费罗;J·R·奈特;J·乍鲁米林;J·H·利蒙;E·W·迈尔斯;J·W·辛普森;G·A·福尔克默 -专利权人： 454生命科学公司
申请日： 2006-08-01 - 公布日： 2008-10-01 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本文提供了用于进行快速DNA测序，如基因组测序的装置和方法。该方法包括以下步骤：制备用于基因组测序的样品DNA，以代表性的方式扩增制备的DNA，以及在扩增的DNA上用仅仅一个引物杂交步骤进行多个测序反应。
核酸进行扩增方法

[发明专利]一种用于副溶血弧菌MLST分型溯源的多重PCR引物组及其二代测序建库方法-CN202010748999.3有效
发明人：张子龙;田桢干;张威;周娴;李深伟;杜鹃 -专利权人：上海国际旅行卫生保健中心（上海海关口岸门诊部）
申请日： 2020-07-30 - 公布日： 2022-08-30 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：本发明提供了一种用于副溶血弧菌MLST分型溯源的多重PCR引物组及其二代测序建库方法，属于微生物检测技术领域。用于副溶血弧菌MLST分型溯源的多重PCR引物组，包括gyrB基因扩增用引物、dnaE基因扩增用引物、dtdS基因扩增用引物、pyrC基因扩增用引物、tnaA基因扩增用引物和pntA基因扩增用引物以及recA‑1基因扩增用引物或recA‑2基因扩增用引物中的一种。本发明针对这7个基因进行多重PCR扩增，建立基于二代测序的建库方法，针对两种类型的RecA基因都可以实现扩增及测序，且测序结果与一代测序结果较为一致；同时一次PCR可以实现所有基因的扩增，直接用于建库，
一种用于溶血弧菌 mlst 溯源多重 pcr 引物及其二代测序建库方法

[发明专利]一种检测健康人易感基因的方法及其应用-CN201910038193.2在审
发明人：黄仲曦;章建平;李高生;汪佳宏;潘星华 -专利权人：广州序科码生物技术有限责任公司
申请日： 2019-01-15 - 公布日： 2019-05-17 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测健康人易感基因的方法，包括如下步骤：(1)提取健康人的基因组DNA；(2)采用步骤(1)所得基因组DNA构建基因组测序文库；(3)将步骤(2)构建的基因组测序文库上样至测序仪，设置测序参数，启动测序，得到健康人的全基因组测序数据，其中，测序深度为4.85～8.3倍；(4)从GWAS Catalog数据库选取有突变位点相对危险度的记录，建成易感基因数据库，用易感基因数据库对步骤(3)所得健康人的全基因组测序数据进行易感基因注释采用本发明的检测健康人易感基因的方法，相比芯片法能更准确地得到健康人的易感基因信息，相比深度测序法具有成本优势。
易感基因健康测序基因组DNA 测序数据测序文库全基因组数据库基因组种检测构建相对危险度成本优势突变位点测序法测序仪检测上样应用芯片记录评估

[发明专利]一种无创癌症检测方法及其试剂盒-CN201310547104.X有效
发明人：张亚晰;李天成;梁丹丹;宋卓;张建光 -专利权人：北京贝瑞和康生物技术有限公司
申请日： 2013-11-04 - 公布日： 2015-05-13 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种无创癌症检测方法，包括以下步骤：从受试者采集外周血并分离血浆；抽提血浆DNA并用亚硫酸氢盐处理；将上述用亚硫酸氢盐处理后的血浆DNA用聚合酶扩增以制备测序文库；对所制备的测序文库进行高通量测序；将高通量测序得到的序列与人类基因组进行对比；统计高通量测序得到的序列中基因组特定区域甲基化水平，并与健康人群确定的基因组单位长度内甲基化水平进行对比，以判断所述受试者是否患有癌症。
一种癌症检测方法及其试剂盒

[发明专利]一种单细胞转录组及染色质可及性双组学测序文库构建方法及测序方法-CN202211237949.4在审
发明人：瞿昆;高绪远;刘柯 -专利权人：中国科学技术大学
申请日： 2022-10-10 - 公布日： 2022-12-16 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本申请公开了一种单细胞转录组和染色质可及性双组学单细胞测序文库的构建方法，其包括a)制备单细胞悬液；b)获取染色质开放位点，c)使用逆转录酶和逆转录引物对细胞的转录组进行逆转录反应，以获取单细胞的转录组信息；d)使用模板转换寡聚物(TSO)进行模板转换反应；e)后续编码；f)初始文库扩增，和g)制备测序用染色质开放位点文库以及转录组文库。本申请还公开了一种对单细胞转录组和染色质可及性双组学测序文库测序的方法，其包括将通过所述方法制备的染色质开放位点文库以及转录组文库分别进行测序。
一种单细胞转录染色质性双组学测序文构建方法

[发明专利]一种全基因组DNA序列拼接测序方法-CN201110089243.3有效
发明人：陈先锋 -专利权人：陈先锋
申请日： 2011-04-11 - 公布日： 2017-03-01 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种全基因组DNA序列拼接测序方法，属于生物技术领域，改进了目前DNA测序的底物制备并提出新的序列拼接方法，应用于生物、医学、农林牧副业相关DNA检测。本专利涉及一系列DNA相关操作，包括基因组DNA两端添加不对称接头，单端锚定到布满扩增引物的平面支持物上，通过电泳等方法使DNA片段定向化后锚定另一端，在DNA双链上制造并扩大缺刻，用含有随机末端的测序引物连接到缺刻5’端，用单链DNA连接酶使扩增引物与测序引物连接，增加缺刻数目等产生可测序的局部DNA片段。与现有测序技术相比，每个局部DNA片段都保留了距离信息，以距离作权值对局部序列的拼接结果进行打分，可得到完整的基因组序列。我们的方法在拼接未知生物基因组和检测基因组变异上具有突出的优势。
一种基因组 dna 序列拼接方法

[发明专利]一种鉴定软骨组织中细胞种类的方法-CN202110248937.0在审
发明人：赵海波;于腾波;高甲科;付海涛;尚振;任中楷;王俊杰;徐奎帅;张翌帆;王丰坤;马温儒 -专利权人：青岛大学附属医院
申请日： 2021-03-08 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明涉及一种鉴定软骨组织中细胞种类的方法，包括以下步骤：(1)消毒；用75％酒精擦拭骨关节炎患者膝骨关节出进行消毒；(2)取样；在手术台中取出关节软骨，PBS清洗三遍，剪碎后消化，用移液枪轻轻吹匀，制备成单细胞悬液；(3)单细胞测序仪器进行上机建库；(4)对测序数据进行分析；(5)细胞亚群的鉴定。通过本发明，可以准确的鉴定软骨组织中细胞的种类，与传统的测序方式不同，单细胞测序可以检测细胞之间的异质性，在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析，在相关研究中具有极高的准确性和可信度
一种鉴定软骨组织细胞种类方法

[发明专利]膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统-CN201710576974.8在审
发明人：眭维国;戴勇;马井生;薛雯 -专利权人：中国人民解放军第一八一医院
申请日： 2017-07-14 - 公布日： 2019-01-22 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：一种膀胱癌组织T细胞图谱模型及其构建方法和构建系统，其中构建方法包括如下步骤：设置疾病组与对照组，其中，疾病组取膀胱癌患者膀胱癌组织的标本待用，对照组取膀胱癌患者膀胱癌旁组织的标本待用；提取各标本的全基因组DNA；扩增出TCR的CDR3区，分别得到疾病组文库和对照组文库；采用高通量测序技术，对所述疾病组文库和所述对照组文库进行测序；对测序结果进行分析，构建膀胱癌组织T细胞图谱模型。上述膀胱癌组织T细胞图谱模型的构建方法，通过膀胱癌组织和癌旁组织免疫组库测序分析TCR数量的变化，能发现那些高克隆扩增TCR CDR3序列，可间接获知这些高克隆扩增T细胞亚家族的分布特点，从而有利于进一步研究膀胱癌发生发展机制
膀胱癌构建图谱模型文库扩增疾病构建系统测序标本克隆高通量测序技术全基因组DNA 测序分析分布特点组织免疫获知分析发现研究

[发明专利]一种高鲁棒性DNA测序用条形码生成和读取方法-CN201910252268.7有效
发明人：陈为刚;王丽霞;韩明哲 -专利权人：天津大学
申请日： 2019-03-29 - 公布日： 2021-08-13 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种高鲁棒性DNA测序用条形码生成和读取方法，属于基因组学的高通量测序领域，将已知伪随机序列与相同长度的短码长循环码逐比特组合成比特对，比特对映射为一个碱基，不同的碱基序列经过筛选后就构成了测序用条形码；进一步，提出用循环移位和动态规划判断接收测序用条形码发生插入、删节错误的位置，修正接收的纠错码字并进行译码的处理方法。混样测序中，该发明对测序条形码的各类错误均具有良好纠错能力，能够对抗合成、建库以及测序中的插入(insertion)、删节(deletion)与替代错误，具有很高的鲁棒性。
一种高鲁棒性 dna 测序用条形码生成读取方法

[发明专利]一种微生物宏基因组测序用标准品体系及其制备方法-CN202310901569.4在审
发明人：焦志军;邓国伟;陈胜兰;殷剑峰;范泽文;王春香 -专利权人：康为医学检验实验室（泰州）有限公司;北京健为医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-07-20 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种微生物宏基因组测序用标准品体系及其制备方法，将肠道微生物的菌种按照细胞数比例混合得到微生物宏基因组测序标准品，可保存于菌种保存液中，保证细胞的完整性；将肠道微生物的菌种基因组DNA定量按照比例混合得到微生物宏基因组测序标准品本发明提供的宏基因组测序标准品的制备方法，可以混合10‑30种肠道微生物，更好的模拟肠道微生物的实际情况。本方法制备的微生物宏基因组测序标准品可用于生信建模、流程测试和开发；可作为微生物学或宏基因组学高通量建库测序的质控，评估检测流程稳定性，可靠度，一致性。
一种微生物宏基组测序用标准体系及其制备方法

[发明专利]一种用宏基因组测序数据肿瘤检测的分析系统及分析方法-CN202210874597.7在审
发明人：齐向云;李建平;何奕辉;张爱国 -专利权人：南京帝基生物科技有限公司
申请日： 2022-07-25 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及生物检测技术领域，具体涉及一种用宏基因组测序数据肿瘤检测的分析系统及分析方法，包括过滤子系统、预处理子系统和识别子系统，过滤子系统包括识别模块、定位模块和去除模块，识别模块识别宏基因组测序数据中的冗余序列，得到识别结果；定位模块对识别结果进行定位，得到定位信息；去除模块基于定位信息将宏基因组测序数据中的冗余序列去除，得到过滤序列；预处理子系统对过滤序列进行预处理，得到染色体波动情况；识别子系统将染色体波动情况输入肿瘤识别模型进行训练，得到肿瘤检测结果，解决了现有的用宏基因组测序数据肿瘤检测的分析系统对肿瘤检测的精确度较低的问题。
一种宏基序数肿瘤检测分析系统方法

[发明专利]一种转录组测序-CN201711184564.5在审
发明人：于思创;王海云 -专利权人：南宁科城汇信息科技有限公司
申请日： 2017-11-23 - 公布日： 2018-02-23 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种转录组测序，①总RNA→富集mRNA→RNA随机打断→用随机引物和逆转录酶从RNA片段合成cDNA片段→再cDNA片段末端修复，连接到测序接头→制备测序文库及测序；②总RNA→去除rRNA→富集mRNA→然后将RNA随机打断→用随机引物和逆转录酶从RNA片段合成cDNA片段→再cDNA片段末端修复→连接到测序接头→制备测序文库及测序③总RNA→然后Small RNA，再3’端，5’端接头连接→逆转录合成cDNA片段→制备测序文库及测序。
一种转录组测序

[发明专利]全基因组重测序分析及用于全基因组重测序分析的方法-CN201910989715.7有效
发明人：张凯;沈一鸣 -专利权人：南京医基云医疗数据研究院有限公司
申请日： 2019-10-17 - 公布日： 2020-09-15 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明公开一种全基因组重测序分析及用于全基因组重测序分析的方法。所述用于全基因组重测序分析的方法包括：获取对待检测样本的DNA序列进行识别所得到的多条测序序列；将所述多条测序序列分成多个测序序列组；基于每个测序序列组，并行地执行如下操作：依次地或并行地将所述测序序列组中的各条测序序列与参考基因组进行测序序列对比，确定每条测序序列在所述参考基因组上的对应位置及对应的染色体编号；以及根据每条测序序列在所述参考基因组上的对应位置及对应的染色体编号，对各条测序序列进行排序和去重，生成对应各染色体的测序序列库。
基因组重测序分析用于方法

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