本发明公开了一种核酸分子、PCR引物对及用于检测禽毛滴虫rpoB基因的试剂盒。发明人通过长期研究,在禽毛滴虫中克隆得到如SEQ ID NO:1所示的禽毛滴虫rpoB全长基因编码序列,并利用该rpoB全长基因编码序列进一步设计得到能够检测禽毛滴虫rpoB基因及其转录水平的PCR引物对和相应的上述PCR引物对重复性高,特异性强,灵敏度高,对非目的基因没有扩增信号。
本发明属于分子生物学技术领域,本发明公开了一种肺炎支原体的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用,包括MNP‑1~MNP‑14的14个标记,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.14所示;所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.15‑SEQ ID NO.42所示。所述MNP标记组合能特异的鉴定肺炎支原体并精准的检测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记组合进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的肺炎支原体的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种麻疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在麻疹病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑5的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.10所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定麻疹病毒并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的优势,可应用于大规模样本的麻疹病毒的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种用于梨品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点为在梨基因组上筛选的在梨种群内具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括梨基因组GCA_000315295.1上所述引物如SEQ IDNO.1~SEQ ID NO.1116所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、品种区分能力强,满足梨品种真实性鉴定和实质性派生品种鉴定需求;所述引物互不干扰,鉴定准确度高、结果重现性强,满足DNA指纹数据库构建的要求;可应用于大规模梨品种鉴定,
本发明公开了一种流感嗜血杆菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在流感嗜血杆菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑12的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.24所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定流感嗜血杆菌并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的优势,可应用于大规模样本的流感嗜血杆菌的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种用于木薯品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点为在木薯基因组上筛选的在木薯种群内具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括木薯基因组Mesculenta_305所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.1246所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、品种区分能力强,满足木薯品种真实性鉴定和实质性派生品种鉴定需求;所述引物互不干扰,鉴定准确度高、结果重现性强,满足DNA指纹数据库构建的要求;可应用于大规模木薯品种鉴定
本发明公开了一种炭疽杆菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在炭疽杆菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑11的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.22所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定炭疽杆菌并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的优势,可应用于大规模样本的炭疽杆菌的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种不动杆菌属的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在不动杆菌属菌株基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定不动杆菌属属并精细的区分属内不同的种;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的优势,可应用于大规模样本的不动杆菌的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种肺炎克雷伯菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在肺炎克雷伯菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑9的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.18所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定肺炎克雷伯菌并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的肺炎克雷伯菌的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种人鼻病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在人鼻病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑5的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQID NO.10所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定人鼻病毒并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、免培养的检测优势,可应用于大规模样本的人鼻病毒的鉴定和遗传变异检测
本发明公开了一种寨卡病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在寨卡病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定寨卡病毒并精细的区分不同的毒株;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、免培养的检测优势,可应用于大规模样本的寨卡病毒的鉴定和遗传变异检测
该技术方案针对核桃过敏原基因jug r 1设计特异性引物和探针,并确定反应条件,从而建立了荧光定量PCR检测核桃过敏原的方法。具体来看,本发明首先在NBCI数据库中,根据核桃过敏原基因jug r 1设计特异性引物和探针;在此基础上,以从检测样本中提取的DNA作为模板,以特异性引物及探针对目的基因进行扩增;扩增过程使用实时荧光定量