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[发明专利]盐肤木无花色素还原酶及其编码基因及编码基因验证方法-CN201510910604.4在审
发明人：陈航;陆沁;刘娟;崔凯;吴海霞;王海英;王超 -专利权人：中国林业科学研究院资源昆虫研究所
申请日： 2015-12-10 - 公布日： 2016-03-30 - 主分类号： C12N9/02 文献下载
摘要：本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种盐肤木无花色素还原酶及其编码基因及该编码基因的验证方法。本发明通过对盐肤木进行接种，并定期收集不同发育阶段的虫瘿分别提取RNA，通过进行转录组测序分析、基因注释、KEGG数据库比对等步骤，得到了盐肤木单宁合成关键基因RchLAR，并采用qPCR技术对RchLAR基因进行验证。
盐肤木花色素还原酶及其编码基因验证方法

[发明专利]白叶枯病菌诱导表达的药用野生稻Oo92082基因及其特异扩增引物-CN201610838696.4在审
发明人：程在全;蒋春苗;肖素勤;杨雅云;柯学;李定琴;余腾琼;陈玲;钟巧芳;殷富有;付坚;张敦宇;王波;陈越;蒋聪;曾民;王玲仙;李娥贤;黄兴奇 -专利权人：云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
申请日： 2016-09-22 - 公布日： 2016-12-21 - 主分类号： C12N15/29 文献下载
摘要：本发明公开一种白叶枯病菌诱导表达的药用野生稻Oo92082基因及其特异扩增引物，还公开了该基因在药用野生稻受白叶枯病菌胁迫不同时间点的表达水平分析引物。该基因在白叶枯病菌PXO99和C5胁迫处理的0h、24h、48h、72h和96h中，相对表达量(RQ)均在48h达到最高峰，其中PXO99胁迫后RQ是0h的16倍多，C5胁迫后RQ是0h的85倍多。该基因在接种白叶枯病菌后表现为上调表达，经注释到核酸和蛋白数据库，未获得任何功能注释，是一个直接参与药用野生稻抗白叶枯病应答进程的新基因。该基因的成功分离克隆，为深入研究该基因与药用野生稻抗白叶枯病机制奠定了基础。
白叶枯病菌诱导表达药用野生 oo92082 基因及其特异扩增引物

[发明专利]结核分枝杆菌H37Rv编码基因及其应用-CN201910073833.3在审
发明人：徐平;张瑶;吴雪琼;张俊仙;武舒佳;常蕾;徐丹洋;高慧英 -专利权人：北京蛋白质组研究中心
申请日： 2019-01-25 - 公布日： 2019-10-18 - 主分类号： C12N15/31 文献下载
摘要：本发明涉及一种结核分枝杆菌H37Rv及其应用，具体涉及新的漏注释编码基因Rv0007A(+|10966‑11121|)，其可用作结核分枝杆菌复合群分子鉴定的标准基因，用于结核分枝杆菌复合群的分子鉴定及临床检测
结核分枝杆菌复合群结核分枝杆菌编码基因分子鉴定标准基因临床检测可用应用

[发明专利]结核分枝杆菌H37Rv编码基因及其应用-CN201810403796.3有效
发明人：徐平;张瑶;武舒佳;孙金帅;王富强;何崔同;常蕾 -专利权人：北京蛋白质组研究中心
申请日： 2018-04-28 - 公布日： 2021-04-20 - 主分类号： C12N15/31 文献下载
摘要：本发明涉及一种结核分枝杆菌H37Rv及其应用，具体涉及新的漏注释编码基因Rv2494c(‑|2808520‑2808696|)，其可用作结核分枝杆菌复合群分子鉴定的标准基因，用于结核分枝杆菌复合群的分子鉴定及临床检测
结核分枝杆菌 h37rv 编码基因及其应用

[发明专利]从肿瘤样品中检测突变负荷的方法-CN201780075938.1有效
发明人： R·查达瑞;F·海兰德 -专利权人：生命科技股份有限公司
申请日： 2017-12-07 - 公布日： 2023-07-25 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：所述方法包括检测对应于所述肿瘤样品基因组中的靶向位置的核酸序列读数中的变体；用来自群体数据库的注释信息注释检测到的变体；过滤所述检测到的变体，其中所述过滤规则集保留所述体细胞变体并去除种系变体；对所述所识别的体细胞变体进行计数，以得到体细胞变体的数量；确定所述肿瘤样品基因组中所述靶向位置的覆盖区域中的碱基的数量；和计算每兆碱基的体细胞变体的数量，提供所述肿瘤样品基因组中每兆碱基的所述突变负荷的估计值。
肿瘤样品检测突变负荷方法

[发明专利]一种玉米氮响应基因调控元件分析方法-CN202210810064.2在审
发明人：徐筋燕;赵涵 -专利权人：江苏省农业科学院
申请日： 2022-07-11 - 公布日： 2022-12-30 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种玉米氮响应基因调控元件分析方法。通过将转录组测序、基因共表达网络构建、基因功能注释、元件富集分析和酵母单杂交等技术进行融合应用，将复杂的基因调控网络简化从而挖掘其中的关键转录调控因子。
一种玉米响应基因调控元件分析方法

[发明专利]一个用于筛查突变基因的609基因panel-CN201810436962.X在审
发明人：李小花;陆世鑫;刘朝煜;郑媛;涂小年;黄庆俊;于丹;徐飞岳 -专利权人：深圳因合生物科技有限公司
申请日： 2018-05-09 - 公布日： 2018-09-25 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：一种用于筛查突变基因的609基因panel，其包含有609个基因1273个位点，609个基因是通过有MSK提供的样本中468个基因和48个中心的400多个驱动基因进行基因注释和加入用药位点信息进行筛选而得，不仅覆盖了市场上的大panel的绝大部分基因，而且有针对性的选取每个基因的热点突变区域与用药位点，整体成本会下降，又可以了解肿瘤用药的全面信息。
基因突变基因筛查基因注释驱动基因突变区域位点信息整体成本肿瘤用药个位位点样本筛选覆盖

[发明专利]一种盐肤木黄酮3‑O‑单氧酶编码基因-CN201710117090.6在审
发明人：丁伟峰;陈航;陆沁;凌晓霏;刘娟;陈晓鸣 -专利权人：中国林业科学研究院资源昆虫研究所
申请日： 2017-03-01 - 公布日： 2017-08-18 - 主分类号： C12N15/53 文献下载
摘要：本发明涉及一种盐肤木黄酮3‑O‑单氧酶编码基因。盐肤木Rch2HD基因及其应用，通过对不同发育阶段角倍中单宁含量及RNA转录组高通量测序，结合基因注释、KEGG通路分析、不同发育期表达量比对等步骤，筛选并鉴定出调控异黄酮合成的盐肤木(Rhus chinensis)新基因Rch2HD，并通过实时荧光定量PCR(qPCR)对Rch2HD基因的表达进行验证。
一种盐肤木黄酮单氧酶编码基因

[发明专利]一种樱花耐涝基因的筛选方法及其在耐涝樱花品种或砧木中的应用-CN202211174753.5在审
发明人：付涛;王志龙;李文;蒋劢博 -专利权人：宁波城市职业技术学院
申请日： 2022-09-26 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供了一种樱花耐涝基因的筛选方法，其包括水胁迫试验、RNA提取、文库构建、测序、原始数据的处理、拼接以及基因的功能注释、差异表达基因分析和实时荧光定量分析，本发明还提供了所述筛选方法筛选得到的樱花耐涝基因的应用通过本发明可以解决樱花种植不耐涝等问题，挖掘出的抗涝基因对樱花分子育种有一定的指导意义。
一种樱花基因筛选方法及其品种砧木中的应用

[发明专利]一种土曲霉基因组规模代谢网络模型及其构建方法-CN201110419312.2无效
发明人：刘立明;刘杰;高倩;陈坚 -专利权人：江南大学
申请日： 2011-12-15 - 公布日： 2012-06-13 - 主分类号： G06F19/12 文献下载
摘要：本发明涉及土曲霉的基因组规模代谢网络模型及其构建方法。模型的构建基于生物系统发生树下亲缘微生物的基因编码蛋白序列比对。通过模型的构建，明确了土曲霉生理活动中所发生的反应及其基因，补充了基因编码蛋白序列的注释信息。土曲霉的基因组规模代谢网络模型进一步对深入了解土曲霉的生理特性将有极大的推进作用。
一种曲霉基因组规模代谢网络模型及其构建方法

[发明专利]鲍曼不动杆菌多糖抗原检索和注释分析系统及其构建方法-CN202210656813.0在审
发明人：刘程智;王莹;史亚;刘周萍;华孝挺;陈欢 -专利权人：杭州微数生物科技有限公司
申请日： 2022-06-11 - 公布日： 2022-11-04 - 主分类号： G16B35/10 文献下载
摘要：本发明公开一种鲍曼不动杆菌多糖抗原检索和注释分析系统及其构建方法。方法采用了多步骤和多模块策略，包括：构建鲍曼不动杆菌多糖抗原数据库，数据库包括已知多糖抗原分型对应的菌株名称、多糖抗原结构图、合成基因簇序列及功能、多糖合成信息、单糖合成通路、菌株名称、基因组信息；查询模块；检索模块；分型和糖基转移酶注释模块。该系统，整合了鲍曼不动杆菌多糖抗原信息数据和分型、细菌糖基转移酶模块，可用于快速检索多糖抗原信息、多糖合成信息和单糖合成通路信息，填补了细菌糖基转移酶注释分析平台和鲍曼不动杆菌多糖结构信息检索数据库的空白
不动杆菌多糖抗原检索注释分析系统及其构建方法

[发明专利]用于确定致病风险变异位点的方法、设备和存储介质-CN202110268390.0有效
发明人：钟韵山;刘蒙蒙;张钰;穆婷;李云双 -专利权人：北京贝瑞和康生物技术有限公司
申请日： 2021-03-12 - 公布日： 2021-07-30 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：该方法包括：一种用于确定致病风险变异位点的方法，包括：获取待测对象的样本的全外显子测序序列比对结果信息和关于待测对象的临床描述信息；基于全外显子测序序列比对结果信息，确定变异位点，以便针对变异位点进行注释；经由第一神经网络模型，提取临床描述信息中的表型关键词；基于表型关键词，针对候选基因进行排序；以及基于关于变异位点的注释信息，过滤变异位点；基于经过滤的变异位点的注释信息和关于候选基因的排序信息，生成输入数据用以输入经训练的预定模型
用于确定致病风险变异方法设备存储介质

[发明专利]从肿瘤样品中检测突变负荷的方法-CN201980056780.2在审
发明人： R·查达瑞;F·海兰德 -专利权人：生命科技股份有限公司
申请日： 2019-08-26 - 公布日： 2021-04-09 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：所述方法可包括：检测对应于肿瘤样品基因组中靶向位置的核酸序列读段中的变体；用来自群体数据库的注释信息注释检测到的变体；过滤所述检测到的变体，其中所述过滤保留体细胞变体并且去除生殖系变体；计算初始TMB；以及将校准应用于所述初始TMB水平，以产生所述肿瘤样品基因组的所述突变负荷的最终TMB水平。
肿瘤样品检测突变负荷方法

[发明专利]一种结直肠癌基因变异及用药解读系统及解读方法、装置-CN202010911302.X在审
发明人：李明明;蔡文君;李明壮;胡菲菲 -专利权人：荣联科技集团股份有限公司
申请日： 2020-09-02 - 公布日： 2020-11-20 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本说明书提供一种结直肠癌基因变异及用药解读系统及解读方法、装置，该系统包括结直肠癌数据库版块，数据库版块包括通过相同关键字段或相同关键字段组合相互关联的多个数据库，多个数据库分别用于存储结直肠癌的相关信息；进行解读时，对受检样本的测序下机数据进行生物信息分析，获取受检样本的基因变异注释信息；其中，测序下机数据包括受检样本的样本信息；将受检样本的样本信息及基因变异注释信息与结直肠癌数据库版块内的数据库进行关联读取基于该结直肠癌基因变异及用药解读系统进行用药解读时，能够快速、准确地找到并提出全方面的、证据等级明确的用药指导建议，为医疗决策提供重要参考。
一种直肠癌基因变异用药解读系统方法装置

[发明专利]一种乳腺癌基因变异及用药解读系统及解读方法、装置-CN202010912233.4在审
发明人：蔡文君;李明壮;胡菲菲;李明明 -专利权人：荣联科技集团股份有限公司
申请日： 2020-09-02 - 公布日： 2020-11-24 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本说明书提供一种乳腺癌基因变异及用药解读系统及解读方法、装置，该系统包括乳腺癌数据库版块，乳腺癌数据库版块包括通过相同关键字段或相同关键字段组合相互关联的多个数据库，多个数据库分别用于存储乳腺癌的相关信息；进行解读时，对受检样本的测序下机数据进行生物信息分析，获取受检样本的基因变异注释信息；其中，测序下机数据包括受检样本的样本信息；将受检样本的样本信息及基因变异注释信息与乳腺癌数据库版块内的数据库进行关联读取基于该乳腺癌基因变异及用药解读系统进行用药解读时，能够快速、准确地找到并提出全方面的、证据等级明确的用药指导建议，为医疗决策提供重要参考。
一种乳腺癌基因变异用药解读系统方法装置

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