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[发明专利]基于对比学习的合成致死基因搭档的推荐方法、装置、终端及介质-CN202210957122.4在审
发明人：郑杰;王诗珂;刘勇;吴敏;冯艺苗;刘鑫 -专利权人：上海科技大学
申请日： 2022-08-10 - 公布日： 2022-10-25 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于对比学习的合成致死基因搭档的推荐方法、装置、终端及介质，通过获取基因数据，将基因数据中的待匹配基因和被推荐基因分别组成多个候选基因对，将候选基因对输入训练完毕的对比学习模型得到各候选基因对的基因嵌入，基于各候选基因对的基因嵌入，计算各候选基因对中两基因的相似度，作为各候选基因对的得分结果，选定得分最高的候选基因对中的被推荐基因作为待匹配基因的合成致死基因搭档。本申请利用对比学习框架达到仅用已知的合成致死基因作为正样本训练模型并推荐合成致死基因搭档的效果，排除现有技术对负样本的依赖，有效缓解基因样本的稀缺问题，较现有技术相比具备优越的预测性能。
基于对比学习合成致死基因搭档推荐方法装置终端介质

[发明专利]一种富集程度检验方法、装置及可读介质、存储控制器-CN201811531077.6有效
发明人：李淼;于治楼;李锐 -专利权人：山东浪潮科学研究院有限公司
申请日： 2018-12-14 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种富集程度检验方法、装置及可读介质、存储控制器，该方法包括：确定测试基因组和候选功能条目集合，测试基因组和候选功能条目集合中的各组候选功能条目均分别包括有至少一个基因；针对每一组候选功能条目均执行：分别计算当前候选功能条目中每一个基因的权重，基因的权重与基因在该候选功能条目集合中的出现次数成负相关；根据当前候选功能条目中每一个基因的权重并基于费舍尔精确检验，检验当前候选功能条目在测试基因组中的富集程度通过基因在候选功能条目中出现的次数来定义基因的多功能性，并基于此来检验富集程度，故本方案能够降低多功能基因对富集分析问题的影响，从而提高检验准确度。
一种富集程度检验方法装置可读介质存储控制器

[发明专利]一种低密度SNP基因组区域准确预测BSA-seq候选基因的方法-CN201811373098.X有效
发明人：杨行海;夏秀忠;曾宇;张宗琼;农保选;吴艳艳;熊发前;李丹婷;邓国富;荘洁 -专利权人：广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
申请日： 2018-11-19 - 公布日： 2019-09-06 - 主分类号： G16B25/00 文献下载
摘要：本发明涉及基因组测序技术领域，特别涉及一种低密度SNP基因组区域准确预测BSA‑seq候选基因的方法，本发明针对BSA‑seq在候选区间附近有低密度SNP区域，通过比价两亲本间的SNP，对SNP列表进行严格过滤，找出低密度区域，然后利用置信区间为95％时对应的候选区间加上低密度候选区间，利用基因组注释网站对候选区域内的基因进行注释；对候选区域变异位点功能注释，得到存在移码变异等功能性变异的基因，并确定该基因为候选基因；使用本发明的方法能弥补由于基因组差异小的区域而造成的候选区域的假阳性，获得真正的候选区间。
候选基因候选区域基因组区域低密度区域功能性变异基因组测序基因组差异基因组注释变异位点功能注释置信区间基因假阳性预测亲本网站过滤

[发明专利]基因分类方法与装置-CN201810623452.3有效
发明人：孙林;孔祥琳;陈清利;翟瑞冰;刘延;李源;赵婧;秦小营;殷腾宇;王学敏 -专利权人：河南师范大学
申请日： 2018-06-15 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： G16B40/20 文献下载
摘要：本发明涉及基因分类方法与装置，根据设定基因的变异系数，采用属性加权算法为基因样本中的每个基因配置权重系数，按照权重系数从大到小的顺序，依次选取前N1个基因，作为候选基因集；利用蚁群算法在所述候选基因集中选取最优基因子集，并利用该基因子集进行基因分类。本发明首先采用属性加权算法初步筛选出候选基因集，然后再在候选基因集中进行再次筛选，利用蚁群算法再在候选基因集中选取基因子集，有效地去除了冗余或无效的基因。
基因分类方法装置

[发明专利]一种判断种公猪精液质量的基因检测引物及判断方法-CN202110907141.1在审
发明人：丁月云;殷宗俊;张晓东;郑先瑞;王彩云;吴旭东;曹邦基;陈琼;夏静;凌紫荆;侯银辉;孔诚诚 -专利权人：安徽农业大学
申请日： 2021-08-09 - 公布日： 2021-10-01 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明属于家畜分子生物技术领域，提供一种判断种公猪精液质量的基因检测引物、方法及种公猪精液质量候选基因的筛选方法。通过研究候选基因表达水平与精液质量指标相关性，获得种猪精液质量判断的候选基因HSF1、VDAC2和WIP1。根据候选基因信息特异性设计检测引物对，分别为候选基因HSF1基因引物对、VDAC2基因引物对和WIP1基因引物对。根据候选基因表达水平判断种公猪精液质量的方法，具有快速、准确、高效的特点，填补了本领域的空白。
一种断种公猪精液质量基因检测引物判断方法

[发明专利]一种水稻数量性状基因快速发掘的方法-CN202310058245.9在审
发明人：魏鑫;黄学辉;陈蒙娇;刘杰 -专利权人：上海师范大学
申请日： 2023-01-13 - 公布日： 2023-05-02 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种水稻数量性状基因快速发掘的方法，所述方法包括：对水稻巢式联合作图群体进行全基因组关联分析和每个子群体的连锁分析，发掘能同时被两种方法鉴定到的数量性状位点；对QTL位点内候选基因的功能、变异和表达进行全面分析；对候选基因注释信息中目标表型特异的关键词匹配次数、候选基因变异位点对基因功能的影响、候选基因在特异组织中的表达量等进行加权打分和排序，选择评分最高的3个基因作为目标数量性状的候选基因。本发明通过开发一套可根据关键词判定候选基因功能及综合判定变异对基因功能影响的评价打分系统对水稻NAM群体中发掘的数量性状候选基因进行评估筛选，可大幅度提高水稻数量性状基因发掘的效率。
一种水稻数量性状基因快速发掘方法

[发明专利]一种获得丝瓜抗黄瓜花叶病毒病候选基因的方法-CN201910286986.6在审
发明人：娄丽娜;苏小俊;刘晓宏;刘哲 -专利权人：江苏省农业科学院
申请日： 2019-04-11 - 公布日： 2019-06-21 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种获得丝瓜抗黄瓜花叶病毒病候选基因的方法，属于农业技术领域，包括：从无参考基因组序列物种筛选候选基因；采用SLAF‑seq方法构建丝瓜高密度遗传图谱以及定位丝瓜抗黄瓜花叶病毒基因；以定位标记为锚，从转录组文库中，筛选到候选基因序列，并进行候选基因的功能分析。本发明采用SLAF‑seq方法构建丝瓜高密度遗传图谱以及定位丝瓜抗黄瓜花叶病毒基因，以定位标记为锚，从转录组文库中，筛选到候选基因序列，并进行候选基因的功能分析。
丝瓜候选基因黄瓜花叶病毒病候选基因序列黄瓜花叶病毒定位标记功能分析遗传图谱转录组构建文库参考基因组序列农业技术领域筛选物种筛选基因

[发明专利]一种文本基因提取方法、装置及电子设备-CN201610622162.8在审
发明人：康潮明 -专利权人：乐视控股（北京）有限公司;乐视网信息技术（北京）股份有限公司
申请日： 2016-08-01 - 公布日： 2016-12-21 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：本发明涉及自然语言处理技术，尤其涉及一种文本基因提取方法、装置及电子设备。其中，该文本基因提取方法包括：构建文本基因词典，根据所述文本基因词典，生成待提取文本的第一候选文本基因集合；根据文本基因提取规则，生成所述待提取文本的第二候选文本基因集合；根据所述第一候选文本基因集合与所述第二候选文本基因集合，生成目标文本基因集合。本发明实施例通过两种方式分别获取两个候选文本基因集合，从而获取待提取文本的目标文本基因集合，丰富了文本基因提取方法，提高了文本基因提取准确率。
一种文本基因提取方法装置电子设备

[发明专利]数据处理、数据处理模型的训练方法、装置、设备及介质-CN202111387290.6在审
发明人：王文川;杨帆;姚建华 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2021-11-22 - 公布日： 2022-04-12 - 主分类号： G16B25/00 文献下载
摘要：该方法包括：从目标细胞的目标基因表达数据中提取目标细胞下的各个候选基因对应的目标表达值；基于各个候选基因对应的目标表达值，获取各个候选基因对应的目标特征；基于各个候选基因对应的目标特征，提取各个候选基因在目标细胞下的相互作用信息；基于各个候选基因在目标细胞下的相互作用信息，获取目标细胞对应的预测结果。此种方式，目标细胞对应的预测结果是基于各个候选基因在目标细胞下的相互作用信息获取的，各个候选基因在目标细胞下的相互作用信息能够体现出目标细胞的功能方面的特征，获取的预测结果的准确性较高。
数据处理模型训练方法装置设备介质

[发明专利]筛选及鉴定肥胖基因的方法-CN201811479366.6在审
发明人：王巧平 -专利权人：中山大学
申请日： 2018-12-05 - 公布日： 2019-04-16 - 主分类号： A01K67/033 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选及鉴定肥胖基因的方法，包括以下步骤：(1)构建候选肥胖基因UAS‑RNAi果蝇株；(2)未交配的雌性Gal4果蝇株与候选肥胖基因UAS‑RNAi果蝇株交配产卵，孵化获得新果蝇；(3)收集雄性新果蝇并定期对其进行检测体重、摄食及甘油三脂的含量，观察候选肥胖基因是否与体重、摄食及甘油三脂分别相关，若不相关将该候选肥胖基因排除，若相关进行下一步；(4)建立候选肥胖基因敲除果蝇株，鉴定所述候选肥胖基因是否与肥胖相关，若相关则判断为肥胖基因。本发明用于新肥胖基因的筛选及鉴定工作，而且可从全基因组的层面上挖掘新肥胖基因。
肥胖基因果蝇甘油三脂交配筛选摄食全基因组产卵肥胖构建敲除孵化挖掘观察检测

[发明专利]鉴定促进杂种优势和杂种无活力的基因的方法及其用途-CN200580010744.0无效
发明人：彼特·H·凯 -专利权人：混合生物科学有限公司
申请日： 2005-02-03 - 公布日： 2007-07-11 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及鉴定在疾病的诊断治疗和/或杂种优势的诱导中潜在有用的候选基因的方法。具体地，本发明涉及鉴定能在动物或植物中产生杂种优势或杂种无活力的候选基因的方法，包括如下步骤：(i)比较候选基因的等位基因的核苷酸序列；(ii)鉴定来自所述动物或植物的等位基因中的核苷酸序列差异；和(iii)鉴定候选基因的等位基因之间的氨基酸序列变化位于候选基因内的两个或更多个不同外显子中。
鉴定促进杂种优势杂种活力基因方法及其用途

[发明专利]一种筛选数量性状候选基因的方法-CN201910064006.8有效
发明人：崔艺馨;钱伟;万华方;贺亚军;熊清;丁一娟;梅家琴;刘智;曾晓;廖泾行;索朗贡布 -专利权人：西南大学
申请日： 2019-01-23 - 公布日： 2023-05-05 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明属于分子育种领域，主要涉及一种筛选数量性状候选基因的方法，该方法是提取数量性状相关区间（QTL区间和GWAS区间）的基因作为“候选基因集”，收集与该性状相关的已知基因作为“诱饵”基因，通过对一组样品的转录组数据进行基因共表达分析或者权重共表达分析，构建共表达网络，从中挑选出跟诱饵基因连通性强的基因即为候选基因。本方法相比以前的分析方法，能快速、有效地筛选数量性状相关区间内的候选基因，缩小了候选基因的筛选范围，同时可以预测基因之间的互作关系，克服了传统精细定位工作量大且繁琐的问题，加速物种分子育种进程。
一种筛选数量性状候选基因方法

[发明专利]一种基因变异识别方法、装置和存储介质-CN201910252747.9有效
发明人：胡志强 -专利权人：北京市商汤科技开发有限公司
申请日： 2019-03-29 - 公布日： 2021-08-31 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本公开涉及基因变异识别方法、装置和存储介质，其中，该方法包括：获取基因变异候选位点对应的至少一个基因测序读段；获取所述基因变异候选位点的碱基排列特征；基于所述至少一个基因测序读段在预设位点区间的非碱基排列信息，确定所述基因变异候选位点的非碱基排列特征；其中，所述非碱基排列特征在碱基排列顺序改变后保持不变；基于所述基因变异候选位点的碱基排列特征和非碱基排列特征，对所述基因变异候选位点的基因变异进行识别。本公开实施例可以考虑非碱基排列特征不受碱基排列顺序制约的特点，更好地筛除由于胚系基因变异以及噪声、错误等干扰造成的伪基因变异，更好地对基因变异进行识别，提高基因变异识别的准确性。
一种基因变异识别方法装置存储介质

[发明专利]肺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备-CN202110061920.4在审
发明人：张蕾;张琦;冯林;程书钧;张开泰;肖汀 -专利权人：中国医学科学院肿瘤医院
申请日： 2021-01-18 - 公布日： 2021-04-30 - 主分类号： G16H50/50 文献下载
摘要：该构建方法包括：获取多个肺癌患者和多个参考人的外周血白细胞转录谱表达数据；基于上述转录谱表达数据，筛选候选基因；以及，基于候选基因，构建风险评分模型。肺癌预后模型包括风险评分模型。基于上述转录谱表达数据，筛选候选基因，包括：对上述转录谱表达数据进行相似性分析，确定多个肺癌亚群；将多个肺癌亚群分别与多个参考人进行差异表达基因分析，确定多个肺癌亚群各自的差异表达基因；比较多个肺癌亚群的差异表达基因中的表达状态，选择多个肺癌亚群中有较多的免疫抑制基因处于高表达状态的肺癌亚群作为候选肺癌亚群；以及，从候选肺癌亚群的差异表达基因中筛选候选基因。
肺癌预后模型构建方法应用电子设备

[发明专利]基因变异的识别方法及装置、电子设备和存储介质-CN201911284520.9在审
发明人：胡志强 -专利权人：北京市商汤科技开发有限公司
申请日： 2019-12-13 - 公布日： 2020-04-28 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本公开涉及一种基因变异的识别方法及装置、电子设备和存储介质。所述方法包括：确定基因变异的候选位点的特征；将所述候选位点的特征输入更新后的基因变异识别网络，经由更新后的所述基因变异识别网络输出所述候选位点的基因变异识别结果，其中，更新后的所述基因变异识别网络用于判断所述候选位点是否发生第一类基因变异本公开实施例能够提高对于第一类基因变异的识别准确性。
基因变异识别方法装置电子设备存储介质

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