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[发明专利]长丰鲢渗入基因的鉴定方法及其应用-CN202310733213.4在审
发明人：李晓晖;梁宏伟;张泽文;李炯棠;王琦;邹桂伟;冯翠 -专利权人：中国水产科学研究院长江水产研究所;中国水产科学研究院
申请日： 2023-06-20 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本申请涉及长丰鲢技术领域，具体涉及长丰鲢渗入基因的鉴定方法及其应用。该鉴定方法包括根据长丰鲢基因组序列和野生鲢基因组序列构建HiFi文库、测序，并进行染色体组装，得到伪染色体；对所述伪染色体进行基因注释，得到长丰鲢mRNA序列；将所述长丰鲢mRNA序列比对至所述野生鲢基因组序列和鲤基因组序列，得到候选的长丰鲢渗入基因；提取所述候选的长丰鲢渗入基因的蛋白序列，比对，得到所述长丰鲢渗入基因的候选渗入基因DNA序列。该鉴定方法具有快速高效、精准的优点。该鉴定方法的鉴定过程简洁，实验步骤的介入程度低，成本低。
长丰渗入基因鉴定方法及其应用

[发明专利]用于分析物分析的系统和方法-CN202180090649.5在审
发明人： H·恩古延;洪儒菘;L·姜 -专利权人：康比纳蒂股份有限公司
申请日： 2021-12-28 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本公开提供了用于分析分析物的方法和系统。分析分析物可包括使分析物与结合试剂接触，该结合试剂可包括：对该分析物具有特异性的结合探针，和核酸分子。可使该核酸分子变性，并且可收集指示该分析物的该变性的信号。这些收集的信号可用于检测、鉴定或定量该分析物。
用于分析系统方法

[发明专利]一种基于多聚单核苷酸多态性的猪10K液相芯片及其应用-CN202310707878.8有效
发明人：丁向东;刘华涛;李淑娟;张梓鹏;都鹤鹤;邵玉如;王楚端 -专利权人：中国农业大学
申请日： 2023-06-15 - 公布日： 2023-09-08 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明涉及基因分子育种领域，具体涉及基于多聚单核苷酸多态性的猪10K液相芯片及其应用。本发明在保持液相芯片设计基本原则下，对已有芯片增加新标记，并利用多聚单核苷酸多态性技术对探针进行优化，产生更多分型质量高、在探针区域内与靶位点SNP连锁不平衡中等的SNP标记，提高芯片的有效标记数量。本发明的mSNP液相芯片使可检测的SNP数目增加到靶位点SNP标记数的1.5‑2倍，解决了已有芯片仅含靶位点SNP，无法提供mSNP标记的问题，且成本没有增加。通过基因型填充技术，将本发明的芯片基因型数据填充至主流的50K芯片，用于基因组选择，获得与50K芯片相同或相近的分子选种准确性，降低了猪分子育种成本。
一种基于多聚单核苷酸多态性 10 芯片及其应用

[发明专利]一种筛选再生水补水影响河道生物多样性的关键水质因子的方法-CN202310532417.1在审
发明人：赵飞;吴书剑;巩志霖;施雪卿;陈栋;肖宜华;魏朋浩;朱鑫胜晖 -专利权人：青岛理工大学
申请日： 2023-05-12 - 公布日： 2023-08-15 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明涉及一种筛选再生水补水影响河道生物多样性的关键水质因子的方法，属于环境技术领域。包括步骤如下：步骤1：设置采样点，采集水样并过滤，提取DNA；步骤2：对提取的DNA进行测序与注释；步骤3：确定采样点水质指标并进行测定；步骤4：确定水质β多样性，利用水质指标结果和β多样性结果解析物种群落结构差异与水质因子之间的关联，筛选得到影响生物多样性的水质因子。本发明基于环境DNA技术的生物多样性监测方法，可以快速、低成本评价再生水河道补水后生物多样性的变化情况。
一种筛选再生水补水影响河道生物多样性关键水质因子方法

[发明专利]浙贝母甾体生物碱合成关键基因及其筛选方法和应用-CN202310306457.4在审
发明人：钟卓珩;黄露漫;付红伟;杨丙贤;梁霜;张琳 -专利权人：浙江理工大学;红河创新技术研究院有限责任公司
申请日： 2023-03-27 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种浙贝母甾体生物碱合成关键基因及其筛选方法和应用，属于植物基因工程领域。本发明采集5组不同产地的新鲜浙贝母鳞茎样本，通过对上述样本的总生物碱含量(以贝母甲素和贝母乙素含量的和计)分析以及转录组差异分析，筛选出了4条与浙贝母甾体生物碱合成相关的关键基因。采用qRT‑PCR技术对筛选出的4条关键基因进行表达验证，结果显示筛选出的基因在转录组分析中的表达水平与采用qPCR技术分析新鲜样本中甾体生物碱表达的趋势基本一致，并且基因表达趋势与总生物碱含量最高的样品结果相一致，证实筛选的关键基因对浙贝母甾体生物碱合成具有重要调控作用。
浙贝母生物碱合成关键基因及其筛选方法应用

[发明专利]一种冬油菜越冬记忆候选基因的鉴定方法及应用-CN202310401143.2在审
发明人：刘丽君;许军;方彦;杨刚;马骊;武军艳;孙万仓;蒲媛媛;王旺田;李学才 -专利权人：甘肃农业大学
申请日： 2023-04-15 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种冬油菜越冬记忆候选基因的鉴定方法，涉及冬油菜越冬记忆机制解析技术领域，本发明对白菜型冬油菜冬前期、越冬期、返青期的根颈部进行取样，通过转录组调查基因的表达模式，对差异基因表达趋势进行分析，从而发现潜在的冬油菜越冬记忆候选基因。本发明方法是在冬油菜不同生长发育时期，采集自然降温状态下冬油菜根颈部组织；采用转录组学获得冬油菜根颈部基因定量表达结果，对冬油菜根颈部不同时期的差异表达基因进行鉴定后分析其表达趋势，获得的“+,+”、“‑,‑”、“‑,+”、“+,‑”4种显著富集趋势可认定为越冬记忆候选基因，可用于冬油菜越冬能力提高、抗寒品种(系)选育、抗寒性改良等方面。
一种油菜越冬记忆候选基因鉴定方法应用

[发明专利]基于GWAS筛选鹅产蛋分子标记及选择方法-CN202310455708.5在审
发明人：高广亮;王启贵;赵献芝;吴睿;许国洋;付文贵;邓娟;张克山;薛佳佳;李静;钟航;谢友慧;王珍;陈主平;汪超 -专利权人：重庆市畜牧科学院
申请日： 2023-04-25 - 公布日： 2023-08-01 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了基于GWAS筛选鹅产蛋分子标记及选择方法，涉及基因检测领域，为达到上述目的，本发明的技术方案包括如下：对5世代若干只母鹅测定群进行基因组测序和飞行时间质谱检测；对7世代若干只种鹅育种群进行飞行时间质谱基因型检测。7世代产蛋数能够明显提升，遗传进展明显高于前两个世代。
基于 gwas 筛选鹅产蛋分子标记选择方法

[发明专利]一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法-CN201910384029.7有效
发明人：陈才;宋成义;王宵燕;高波;沈丹;王赛赛;王亚丽;李奎 -专利权人：扬州大学
申请日： 2019-05-09 - 公布日： 2023-07-28 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法，包括以下步骤：（1）选取目标基因或待研究的基因组片段为参考序列。（2）将参考序列在NCBI的WGS数据库中猪的基因组测序数据进行Blast比对，获取不同品种基因组中的同源序列，并对上述序列进行手动校对和拼接。（3）根据猪转座子数据对参考序列和拼接序列进行转座子注释以及多序列比对。（4）挑选序列间存在的超过100个碱基且对应转座子的Indel位点，作为候选TIP位点。（5）以不同品种的池DNA为模板进行PCR扩增检测，选取带型清楚且存在多态性的TIP位点。该方法可以迅速找到目标区域或基因中便于检测、结果清晰易判断的分子标记。
一种基于比较基因组座子插入 tip 分子标记挖掘方法

[发明专利]多态SNP分子标记的筛选方法、多态SNP分子标记及引物对-CN202010655471.1有效
发明人：朱英;李裕冬;熊铁一;鲜义坤 -专利权人：四川省自然资源科学研究院;峨眉山生物资源实验站
申请日： 2020-07-09 - 公布日： 2023-07-25 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明涉及SNP分子标记技术领域，特别是涉及多态SNP分子标记的筛选方法，包括：通过对比重测序和参考基因组数据，获得候选SNP位点；步骤二、竞争性等位基因特异性PCR扩增、荧光分型，确定具有多态的分型清晰的SNP分子标记。多态SNP分子标记及引物对包括第一SNP标记~第十九SNP标记中的至少一种。本发明解决多态SNP分子标记筛选过程中费时费力的问题。上述筛选方法得到的大熊猫通用的多态SNP分子标记，提供了19个有效的SNP分子标记，补充了大熊猫SNP分子标记的文库。
多态 snp 分子标记筛选方法引物

[发明专利]不育系‘昱香S’纯度鉴定的引物、分子标记及使用方法-CN202211022292.X在审
发明人：李伟荣;农生;王琛;黄春毓;何国松;李永青 -专利权人：广西恒茂农业科技有限公司
申请日： 2022-08-24 - 公布日： 2023-07-21 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了涉及分子生物学领域的不育系‘昱香S’纯度鉴定的引物、分子标记及使用方法，包括不育系昱香S杂交稻纯度鉴定的分子标记的开发，包括如下步骤：步骤一，将21个核心育种亲本材料进行高通量测序，获得二代测序原始序列1710.4Gb，总测序深度687.4×；步骤二，运用生物信息学分析，获得不育系昱香S特异的长度大于5bp的缺失位点32个；步骤三，选择步骤二中的3个位点设计PCR引物，开发成可以用于昱香S不育系纯度鉴定的三个共显性标记，包括HM15‑2、HM15‑4和HM15‑6；步骤四，利用三个共显性标记对不育系昱香S杂交稻进行纯度鉴定的测试。三个共显性标记能够在不育系昱香S中显示独特的PCR扩增缺失条带，能和其它核心育种材料清晰地区分开。
不育昱香纯度鉴定引物分子标记使用方法

[发明专利]用于检测DNA样品中基因组拷贝变化的方法-CN201780059053.2有效
发明人：克里斯多弗·K·雷蒙德;林继力;珍妮弗·埃尔南德斯 -专利权人：分析生物科学有限公司
申请日： 2017-08-24 - 公布日： 2023-07-21 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明包括可用于检测细胞基因组DNA或无细胞DNA(cfDNA)的样品内的突变、SNP、易位、倒位、缺失、拷贝数变化或其他遗传变异的组合物和方法。在一些实施方案中，本发明的组合物和方法提供了极高水平的分辨率，其特别可用于检测来自生物样品(例如血液)的总cfDNA的一小部分中的拷贝数变异。
用于检测 dna 样品基因组拷贝变化方法

[发明专利]一种油松年龄标记基因PtMADS26的筛选鉴定方法与应用-CN202211367270.7在审
发明人：林金星;张莹莹;张曦;沈微微;胡子建;洪岩铭;杨舜垚;许会敏;钮世辉;沈应柏 -专利权人：北京林业大学
申请日： 2022-11-02 - 公布日： 2023-07-07 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了一种油松年龄标记基因PtMADS26的筛选鉴定方法与应用，涉及林木育种技术领域。本发明基于加权共表达网络分析筛选和鉴定到油松年龄标记基因PtMADS26，进一步通过实时荧光定量分析实验检测PtMADS26在不同年龄油松中的表达模式，并测定其在反复截顶和未截顶油松中的表达水平，从而确定其参与油松成熟态向幼年态的调控。本发明通过共表达网络分析为挖掘树木年龄标记基因及互作关系预测提供了新的思路，在克服多年生树木成熟效应，促进无性繁殖，缩短育种年限方面具有重要意义。
一种油松年龄标记基因 ptmads26 筛选鉴定方法应用

[发明专利]一种分析经固定的细胞的组分的方法-CN202180060435.3在审
发明人：施威扬 -专利权人：上海绾塍生物科技有限公司
申请日： 2021-08-05 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：提供了一种分析经固定的细胞的组分的方法，其包括将至多1个所述经固定的细胞和包含多核苷酸的粒子一同包裹在分隔区中，所述粒子包含的所述多核苷酸含有至少一种识别序列以及至少一种捕获序列，所述捕获序列能够直接或间接捕获所述细胞中的组分或其部分；在使得所述分隔区中的所述细胞组分或其部分解交联、且在使经解交联的所述细胞组分或其部分被所述捕获序列捕获的条件下孵育所述分隔区；从所述分隔区中释放所述粒子；通过分析经释放的所述粒子上的多核苷酸序列来分析所述经固定的细胞的组分或其成分。还提供了一种用于分析经固定的细胞的组分的试剂盒，以及一种分析经固定的细胞的组分的系统。
一种分析固定细胞组分方法

[发明专利]凡纳滨对虾耐亚硝酸盐氮性状相关的分子标记及其筛选-CN202010300905.6有效
发明人：赵永贞;杨春玲;刘青云;李强勇;陈晓汉;彭敏;曾地刚;陈秀荔;朱威霖 -专利权人：广西壮族自治区水产科学研究院
申请日： 2020-04-16 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明公开了凡纳滨对虾耐亚硝酸盐氮性状相关的分子标记及其筛选，通过将凡纳滨对虾进行亚硝酸盐氮胁迫实验，留取存活和死亡的凡纳滨对虾的肝胰腺作为样本，再用样本作为模板进行PCR扩增，并将扩增片段测序，得到肝胰腺DNA基因的部分序列以及测序峰图，将序列结果进行BLACT比对，筛选出碱基突变位点即SNP位点，再利用Seqman软件对测序的峰图进行基因分型分析，用SPSS19.0软件的卡方检验对凡纳滨对虾耐亚硝酸盐氮与基因型间的相关性进行分析，得到与凡纳滨对虾耐亚硝酸盐氮显著相关的SNP标记，该标记用于凡纳滨对虾的选择育种，可以准确、高效地选择出具有耐亚硝酸盐氮性状的凡纳滨对虾进行规模养殖。
凡纳滨对虾亚硝酸盐性状相关分子标记及其筛选

[发明专利]一种黄草乌实时定量PCR内参基因的筛选方法-CN201910583061.8有效
发明人：李昆志;李一果;周春艳;陈丽梅 -专利权人：昆明理工大学
申请日： 2019-07-01 - 公布日： 2023-06-16 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明涉及一种黄草乌实时定量PCR内参基因的筛选方法，属于分子生物学领域，具体步骤为：RNA提取；反转录cDNA合成；根据肌动蛋白基因、3‑磷酸甘油醛脱氢酶基因、苹果酸脱氢酶、β‑微管蛋白基因、18S核糖体RNA基因和泛素基因6个候选内参基因的核苷酸序列分别设计定量引物；荧光定量分析；数据分析后筛选出表达稳定的内参基因和内参基因组合。本发明通过分析各候选参考基因的表达变化，筛选出相对稳定的基因作为内参基因，为研究黄草乌基因表达水平的变化奠定良好基础，将有助于在黄草乌基因表达研究中获得可靠的标准化qRT‑PCR数据。
一种草乌实时定量 pcr 内参基因筛选方法

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