本发明涉及用于鉴别小麦矮腥黑粉菌和小麦光腥黑粉菌的抗原及多克隆抗体。用于制备鉴别小麦矮腥黑粉菌和小麦光腥黑粉菌的多克隆抗体的半抗原,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。用于制备鉴别小麦矮腥黑粉菌的多克隆抗体的免疫原,其特征在于,对权利要求1所述的半抗原进行改造和偶联后作为免疫原,免疫家兔,筛选产生高效价全血的家兔;对选中的家兔采取全血,分离纯化获得多克隆抗体。该抗体能够特异识别小麦矮腥黑粉菌,而不能与小麦光腥黑粉菌产生抗原抗体反应,因此能够用于鉴别田间难以区分的小麦矮腥黑穗病和小麦光腥黑穗病。