[发明专利]测序芯片及其制备方法在审
| 申请号： | 201980090338.1 | 申请日： | 2019-01-28 |
| 公开（公告）号： | CN113396229A | 公开（公告）日： | 2021-09-14 |
| 发明（设计）人： | 李世峰;李腾跃;李元;王照辉;江雪芹;陈家诚;王奥立;黄扶兴;宋晓刚;彭玲玲;李汉东;章文蔚 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6876 | 分类号： | C12Q1/6876;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵丽婷 |
| 地址： | 518083 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 一种芯片基质、测序芯片及其制备方法，该芯片基质包括：晶圆层(111)，所述晶圆层(111)上具有均匀分布的切割线；第一氧化硅层(112)，所述第一氧化硅层(112)由氧化硅构成，形成在所述晶圆层(111)的上表面；过渡金属氧化物层(113)，所述过渡金属氧化物层(113)由过渡金属氧化物构成，形成在所述第一氧化硅层(112)的上表面。该芯片基质具有耐高温、耐高湿度等苛刻环境的特点，同时，通过改变含有待测序序列溶液的pH及表面活性剂等成分，可以使得芯片基质表面功能区特异性吸附待测序序列。 | ||
| 搜索关键词： | 芯片 及其 制备 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳华大生命科学研究院，未经深圳华大生命科学研究院许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201980090338.1/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：控制装置、控制方法及显示系统
- 下一篇：用于目标互补DNA富集的方法
- 同类专利
- 用于将样品分拣为临床相关类别的方法-202180092239.4
- G·库姆巴里斯;A·阿喀琉斯;A·伊利亚蒂斯;C·洛伊兹迪斯;K·曾加拉斯;M·约阿尼德斯;P·帕萨利斯;E·吉普力 - 医保生物科技有限公司
- 2021-12-16 - 2023-09-29 - C12Q1/6876
- 本公开提供了用于将生物样品分拣为临床相关类别的方法和试剂盒。所述方法是包含无细胞肿瘤DNA的样品的分拣方法，所述方法包括以下步骤：(i)通过与参考序列比对，在包含多个无细胞DNA(cfDNA)片段的样品中确定至少100,000个cfDNA片段的起始和/或终止的序列坐标，(ii)在所述参考序列中确定以下由三核苷酸、四核苷酸和五核苷酸组成的所有核酸基序：a)在向内1至5个碱基对的范围内但与(i)中确定的每个起始和/或终止序列坐标相邻，和/或b)在向外1至5个碱基对的范围内但与(i)中确定的每个起始和/或终止序列坐标相邻，(iii)确定以下的频率：a)在所述样品中包含的所述多个cfDNA片段中，在(i)中确定的每个序列坐标加和/或减1个碱基对，b)在所述样品中包含的所述多个cfDNA片段中，在(ii)a)和b)中确定的每个所述核酸基序，(iv)计算在(iii)a)和b)中确定的每个所述频率与相应参考频率的比率，(v)针对在步骤(iv)中确定的每个比率单独计算诊断评分，所述评分是步骤(iv)的所有相应频率比率的相应加权和，(vi)根据在(v)中确定的所述诊断评分中的至少两个或更多个计算综合诊断评分，所述评分是在(v)中确定的所述两个或更多个诊断评分的加权和，和(vii)通过将所述综合诊断评分与参考评分进行比较来确定所述样品的分类，其中，如果所述综合诊断评分值比所述参考评分的平均值高所述参考评分的至少一个标准差，则将所述样品分类为包含肿瘤cfDNA，其中所述参考评分由一个或多个参考值计算。
- 用于大规模平行核酸测序的试剂-202180088914.6
- 锡南·阿尔斯兰;莫利·何;迈克尔·普雷维特;拉姆雷迪·蒂帕纳;余华;威廉·莱特;赵军花 - 元素生物科学公司
- 2021-10-29 - 2023-08-18 - C12Q1/6876
- 本公开内容提供了组合物和采用该组合物进行核酸测序工作流的方法，其中工作流包括文库制备，文库分子的固定和扩增以形成固定化模板分子，以及对模板分子进行测序。在一些实施方案中，组合物包含用于进行核酸测序工作流的试剂。
- 婴幼儿特应性皮炎的检测方法-202180063499.9
- 志摩恭子;上原裕也;井上高良;高田直人 - 花王株式会社
- 2021-09-16 - 2023-05-30 - C12Q1/6876
- 本发明提供一种使用皮肤表面脂质检测婴幼儿特应性皮炎的方法。一种受试者中的婴幼儿特应性皮炎的检测方法，其中，包括针对从受试者采集的皮肤表面脂质，对TARC基因或其表达产物的表达水平进行测定的工序。
- 核酸序列测定方法以及核酸序列测定用试剂盒-202180061861.9
- 蓼沼崇;宫内祐树;田口朋之 - 横河电机株式会社
- 2021-08-27 - 2023-05-12 - C12Q1/6876
- 使用具有检测部的检测探针(10)、标记分子A(20)和具有与所述标记分子A(20)的核酸序列互补的核酸序列的标记分子B(30)，在所述标记分子A(20)和所述标记分子B(30)中的任一者上附加荧光分子，使所述标记分子A(20)与所述标记分子B(30)在至少两处以上结合，形成所述标记分子A(20)与所述标记分子B(30)的分支结构体，由此测定样本中包含的具有特定核酸序列的靶标(50)，其中，所述检测部具有与靶标(50)的核酸序列互补的核酸序列，所述标记分子A(20)具有核酸序列，所述核酸序列是与所述靶标(50)的核酸序列互补的、并与所述检测部的核酸序列不同的核酸序列。
- 使用混合报告子的多重核酸检测-202080104474.4
- A·V·托德;N·J·哈西克;R·R·金姆;A·L·劳伦斯 - 斯皮德斯私人有限公司
- 2020-06-30 - 2023-04-25 - C12Q1/6876
- 本发明提供了寡核苷酸和其用于检测和/或区分靶核酸的方法。发现所述寡核苷酸和方法特别适用于同时扩增、检测和/或辨别多个靶标。
- 核酸探针-202080099895.2
- 庄国豪;吴杰霖;周士杰;萧婉仪;夏孝恩;赵自清;吴思葿 - 新加坡科技研究局
- 2020-06-24 - 2023-04-04 - C12Q1/6876
- 本发明涉及用于荧光原位杂交中检测多核苷酸分析物的一对非天然存在的核酸探针，其中所述探针包含第一核酸探针和第二核酸探针，该第一核酸探针包含与桥式探针的第一探针靶区域互补的第一探针结合臂和与多核苷酸分析物的第一分析物靶区域互补的第一多核苷酸分析物结合臂，该第二核酸探针包含与所述桥式探针的第二探针靶区域互补的第二探针结合臂。所述探针对与靶多核苷酸的结合允许与桥式探针的结合，以检测多核苷酸分析物。还提供了包含所述核酸探针对的探针系统和检测样品中多核苷酸分析物的方法。
- 用于扩增和检测SARS-CoV-2的多核苷酸-202180037559.X
- 那德亚·安迪尼;凯西·邱;姜学文;赫迪亚·曼玛尔 - 达丽斯生物医学公司
- 2021-03-23 - 2023-02-03 - C12Q1/6876
- 本文公开了与通过核酸扩增测试(NAAT)检测SARS‑CoV‑2(例如用于扩增测试样品中的SARS‑CoV‑2和确定测试样品中SARS‑CoV‑2的存在和/或用于诊断COVID‑19)有关的引物和探针。具体地说，本公开内容描述了与SARS‑CoV‑2冠状病毒的N基因、ORF1ab或E基因结合，用于通过环介导等温扩增(LAMP)和分子信标杂交进行检测的引物和探针。
- 用于增加测序文库产量的方法-202180034126.9
- A·C·阿迪;R·玛尔奎因;F·史蒂莫斯;D·K·波霍洛克;F·张;E·马斯格雷夫-布朗 - 因美纳公司;因美纳剑桥有限公司;俄勒冈健康科学大学
- 2021-06-09 - 2022-12-30 - C12Q1/6876
- 本公开涉及用于制备测序文库的组合物和方法。在一个实施方案中，方法包括产生在每个末端具有相同衔接子的靶核酸的文库，并且然后转换一个衔接子的同一性以产生侧接不同衔接子的靶核酸。
- 用于确定岩藻糖基化人乳低聚糖的分泌水平的方法-202180024454.0
- A·比尼亚;G·勒菲弗 - 雀巢产品有限公司
- 2021-03-26 - 2022-11-18 - C12Q1/6876
- 本发明涉及一种多基因评分和一种包括此类多基因评分以预测人类受试者在哺乳期间分泌的岩藻糖基化人乳低聚糖，例如α‑1,2‑岩藻糖基化人乳低聚糖的水平的方法。
- 用于鸡形目的表观遗传时钟-202180023862.4
- G·拉达茨;F·吕科;F·博埃尔;A·卡佩尔;E·I·伊圭;F·蒂曼;S·佩尔策 - 赢创运营有限公司
- 2021-01-22 - 2022-11-11 - C12Q1/6876
- 本发明涉及用于预测健康的鸡形目实足年龄的体外方法，所述方法包括以下步骤：(a.)从来源于待测鸡形目对象或来源于待测鸡形目群体的生物样本材料中获得基因组DNA，(b.)确定在步骤(a)中获得的基因组鸡形目DNA中一组特定CpG位点的甲基化水平，以及(c)将来自待测样本的基因组鸡形目DNA中这些CpG位点的甲基化水平与来自年龄相关的参考样本的相同CpG位点的甲基化水平进行比较，从而确定表观遗传年龄并预测对象或待测群体的实足年龄；其中，对于步骤(b)中的该组特定CpG位点，通过排除与单核苷酸多态性相关的CpG位点来消除遗传多态性的影响，以及通过排除位于性染色体上的所有CpG位点来消除性别特异性甲基化差异对性染色体的影响。
- 平行核酸分析方法-202180012016.2
- U·艾林;拉梅什·叶拉甘杜拉;亚历山大·斯塔克;玛丽亚·路易莎·科切拉 - IMBA-莫利库尔生物技术研究所
- 2021-10-19 - 2022-09-06 - C12Q1/6876
- 本发明提供了一种检测多个样本中目标核酸的方法，该方法包括以下步骤：a)在用于每个样本的单独容器中提供来自多个样本的分析物核酸，其中所述容器布置成子集阵列，其中所述阵列包括两个或更多个子集；b)使用与所述分析物核酸杂交的至少一对引物对通过引物延伸反应扩增核酸，其中引物对包含正向引物和反向引物，其中所述正向引物和反向引物均分别包含接头序列、样本标识符序列和用于与所述分析物核酸杂交的结合序列；c)将两个或更多个子集的容器的步骤b)的扩增的核酸组合成组合容器的阵列，其中一个子集而非另一子集的容器组合成组合容器；d)使用与步骤c)的组合容器的所述扩增的核酸杂交的至少一对另外的引物对通过引物延伸反应扩增核酸，其中另外的引物对包含另外的正向引物和另外的反向引物，其中所述另外的正向引物和另外的反向引物均包含子集标识符序列和用于与所述接头序列杂交的序列；e)确定步骤d)扩增的核酸的序列；f)通过与具有所述子集标识符序列和所述样本标识符序列的子集和容器相关联，将步骤e)的确定的目标核酸序列分配给样本。还提供了用于这种方法的引物组。
- 基于保守基因座的哺乳动物DNA甲基化测量-202080016297.4
- S.霍瓦思;J.恩斯特;A.C.阿内森;B.巴恩斯 - 加利福尼亚大学董事会;亿明达股份有限公司
- 2020-01-20 - 2022-06-07 - C12Q1/6876
- 虽然甲基化芯片在过去十年中已广泛用于人类研究，但还没有针对非人物种的甲基化芯片，可能是由于缺乏足够的需求和/或因为物种特异性甲基化芯片可能不是跨物种比较的最佳选择。为了应对这项技术中的挑战，我们开发了一种算法，即保守甲基化阵列探针选择器(CMAPS)，其重新利用了用于容忍人类内部变异的简并基础技术来容忍跨物种突变。CMAPS执行贪心搜索(greedy search)，基于多序列比对，使用针对人类基因组中任何CpG的探针来获得最大数量的物种。然后，CMAPS对所有探针进行排序并选择最终集合，以便可以根据外显子、CpG岛和高甲基化对比低甲基化区域的外部注释来制备可以查询大量哺乳动物物种和不同基因组位置的阵列。
- DNA序列的选择性共价捕获-202080066678.3
- K·盖茨;顾立群;M·I·内贾德;郭序 - 密苏里大学管理者
- 2020-08-10 - 2022-06-07 - C12Q1/6876
- 本文提供了探针，其中探针链的Ap位点可选择性地与靶链的2'‑脱氧鸟苷(dG)交联。还提供了使用此类探针产生和检测交联分子的方法以及检测疾病相关基因突变的方法。
- 预测子宫内膜容受性的方法-202080060684.8
- 聂桂英;S·亨;L·J·F·伦鲍茨 - 哈德逊医学研究所;莫纳什IVF控股有限公司
- 2020-06-25 - 2022-06-07 - C12Q1/6876
- 本发明涉及预测受试者的胚胎植入的子宫内膜容受性的方法，所述方法包括：确定受试者的子宫内膜上皮细胞中的足糖萼蛋白的水平。本发明还涉及监测上皮细胞容受性和提高上皮细胞容受性的方法。
- CRISPR多靶标检测方法及其试剂盒-202080052987.5
- 王金;李诗渊 - 上海吐露港生物科技有限公司
- 2020-07-24 - 2022-03-11 - C12Q1/6876
- 本发明属于核酸检测领域，提供了一种利用CRISPR方法快速检测多靶标的方法和试剂盒。本发明提供了一种用于检测靶标核酸分子的检测体系，包含：(a)n种具有特定结构的向导RNA‑报告核酸复合探针；和(b)Cas蛋白，所述Cas蛋白是具有旁路单链核酸切割活性的Cas蛋白。
- 用于稳定化微小RNA的组合物和方法-202080026086.9
- 祖海尔·马吉德 - 基恩菲特公司
- 2020-04-16 - 2021-11-16 - C12Q1/6876
- 本发明涉及微小RNA分子的稳定化。本文所述的组合物和方法可以有利地用于提供内部对照和标准微小RNA以便包含到试剂盒中，所述试剂盒可用于生物流体中的微小RNA的标准化的相对或绝对定量。
- 测序芯片及其制备方法-201980090338.1
- 李世峰;李腾跃;李元;王照辉;江雪芹;陈家诚;王奥立;黄扶兴;宋晓刚;彭玲玲;李汉东;章文蔚 - 深圳华大生命科学研究院
- 2019-01-28 - 2021-09-14 - C12Q1/6876
- 一种芯片基质、测序芯片及其制备方法，该芯片基质包括：晶圆层(111)，所述晶圆层(111)上具有均匀分布的切割线；第一氧化硅层(112)，所述第一氧化硅层(112)由氧化硅构成，形成在所述晶圆层(111)的上表面；过渡金属氧化物层(113)，所述过渡金属氧化物层(113)由过渡金属氧化物构成，形成在所述第一氧化硅层(112)的上表面。该芯片基质具有耐高温、耐高湿度等苛刻环境的特点，同时，通过改变含有待测序序列溶液的pH及表面活性剂等成分，可以使得芯片基质表面功能区特异性吸附待测序序列。
- 染色体生物标志物-201980085359.4
- E·亨特;A·拉马达斯;A·阿库利切夫 - 牛津生物动力公共有限公司
- 2019-10-21 - 2021-09-07 - C12Q1/6876
- 一种分析染色体区域和与体能相关的相互作用的方法。
- 寡核苷酸，寡核苷酸组，脑膜炎奈瑟菌、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌同时检测方法和试剂盒-201980026480.X
- I·R·V·D·F·卡帕索;A·E·C·C·德阿尔梅达 - 奥斯瓦道·克鲁兹基金会
- 2019-02-20 - 2021-07-30 - C12Q1/6876
- 本发明提供了允许在单个步骤中同时检测细菌性脑膜炎病原体，更具体而言，允许在单个步骤中同时检测脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)和流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)的实时PCR方法。为此，使用引物扩增所述细菌基因组的特定区域。扩增子的存在指示样品中存在细菌，该扩增子通过适合于所用PCR方法的检测方法来检测。
- 定量PCR探针-201980039079.X
- 山本俊辅;松本真一;平林英树 - 武田药品工业株式会社
- 2019-06-10 - 2021-03-05 - C12Q1/6876
- 本发明的课题为提供qPCR用探针等作为能够检测被移植或施予至人以外的动物的人细胞的新型手段。本发明的解决手段为定量PCR探针，其包含：序列，所述序列能与包含来自人LINE‑1基因的规定的碱基序列中的连续10～35个碱基的序列的寡核苷酸进行杂交；及标记部分。该定量PCR探针还可用于包含来自人LINE‑1的正向引物及来自人LINE‑1的反向引物(各序列处于规定的位置关系)的定量PCR试剂盒的制作等。
- 单核苷酸多态性检测用寡核苷酸探针和顺式-反式判别方法-201980009100.1
- 松井贵香 - 荣研化学株式会社
- 2019-03-12 - 2020-09-01 - C12Q1/6876
- 本发明公开包含对第一单核苷酸多态性进行检测的报告区、对第二单核苷酸多态性进行检测的锚定区和接头区的探针。上述报告区具有由与上述第一靶碱基序列完全匹配的碱基序列构成的寡核苷酸、和在与存在上述第一单核苷酸多态性的第一靶碱基序列杂交时猝灭的荧光色素。上述锚定区具有由与存在上述第二单核苷酸多态性的第二靶碱基序列完全匹配的碱基序列构成的寡核苷酸。上述报告区的寡核苷酸的长度比上述锚定区的寡核苷酸的长度短。
- 寡核苷酸构建体及其用途-201880071398.4
- S.格里亚佐夫;L.贝格曼;T.云 - 詹森生物制药有限公司
- 2018-11-02 - 2020-08-28 - C12Q1/6876
- 本公开描述了基于寡聚脱氧核苷酸的免疫刺激性Toll样受体9(TLR9)激动剂。还描述了包含TLR9激动剂的组合物，制备TLR9激动剂的方法，以及使用TLR9激动剂治疗免疫疾病、障碍或病症，诸如病毒感染或癌症的方法。
- 用于下一代测序仪的引物及其制备方法，通过使用用于下一代测序仪的引物得到的DNA文库及其制备方法，以及使用DNA文库的DNA分析方法-201880083369.X
- 榎宏征;竹内由枝;稻森稔 - 丰田自动车株式会社
- 2018-12-21 - 2020-08-14 - C12Q1/6876
- 本发明提供了用于下一代测序仪的引物，其可以提供大数量的读段。基于序列：5'‑CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT‑N
- 作为用于鉴定免疫细胞，特别是初始CD8+ T细胞的表观遗传标志物的内皮唾液酸蛋白(CD248)-201880069377.9
- 斯文·欧莱克;贾尼卡·约瑟芬·舒尔茨 - 艾皮恩蒂斯有限公司
- 2018-10-25 - 2020-06-12 - C12Q1/6876
- 本发明涉及用于鉴定特异性免疫细胞(特别是初始CD8+ T细胞)的方法(特别是体外方法)，其包括分析哺乳动物内皮唾液酸蛋白(CD248)基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态，其中当与非初始CD8+ T细胞或任何其它(血液)细胞类型相比时，所述基因区的脱甲基化或甲基化的缺乏指示初始CD8+ T细胞。根据本发明的分析可以在表观遗传水平上鉴定初始CD8+ T细胞，并将它们与复杂样品中的所有其它细胞(如例如其它血液细胞或免疫细胞)区分开。本发明还提供了用于定量初始CD8+ T细胞(特别是在初始CD8+ T细胞复杂样品中的初始CD8+ T细胞)的改进方法。所述方法可以在有或没有纯化和/或富集细胞的步骤的情况下进行，优选在全血和/或非胰蛋白酶消化的组织中进行。
- 一种测试基因治疗载体的方法-201880045823.2
- 迈克尔·忒弥斯 - 伦敦布鲁内尔大学
- 2018-07-09 - 2020-03-24 - C12Q1/6876
- 一种在基因治疗载体在个体上开始基因治疗前确定其安全性和/或功效的方法，该方法包括用基因治疗载体感染从个体中获得的诱导多能干细胞的培养物。理想的，允许细胞分化，并在培养开始时感染，以及在分化期间和/或分化之后至少感染一次。从感染的细胞中提取核酸，然后分析核酸以测量和/或确定，来自所述载体的核酸的整合的不利影响和/或来自所述载体的核酸表达的效率。
- 专利分类
