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[发明专利]基于直标荧光与多重免疫荧光的多癌种染色方法-CN202310136454.0在审
发明人：孙景云;范师恒;王光杓;陈龙昀;吴东方;高志博 -专利权人：深圳裕康医学检验实验室
申请日： 2023-02-20 - 公布日： 2023-08-04 - 主分类号： G01N1/30 文献下载
摘要：一种多色免疫荧光染色方法及试剂盒，该方法包括：直标步骤，包括使用直标抗体对待测样本进行孵育，获得标记有直标抗体的样本；多重染色步骤，包括按照抗原组中的抗原顺序，使用对应的一抗依次对标记有直标抗体的样本进行孵育，使用染色剂对孵育后的样本进行染色，得到染色后的样本。本发明实现多6标mIF Pa nel的多色免疫荧光染色，能够在一张组织切片上同时表达六个抗体，在此基础上加1标、2标、3标进行开发，同时对9标10色mIF Panel进行了性能验证，本发明可以为病理医生提供更多的靶标蛋白质信息和共定位情况，可以大大提高染色效率，节约样本。
基于荧光多重免疫多癌种染色方法

[发明专利]实体瘤多基因检测基因芯片及其制备方法和检测装置-CN201910768791.5有效
发明人：李淼;陈超;张毅红;陈龙昀;李暾;但旭 -专利权人：裕策医疗器械江苏有限公司
申请日： 2019-08-20 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：一种实体瘤多基因检测基因芯片及其制备方法和检测装置，该基因芯片包含如表1所示的用于检测肿瘤突变负荷和靶向用药相关突变位点的基因区域的探针序列，以及如表2所示的用于检测微卫星不稳定位点的探针序列。本发明的基因芯片，能够捕获859个肿瘤突变负荷和靶向用药相关突变位点以及250个微卫星不稳定位点的基因区域，这些基因区域可真实反映人全基因组上肿瘤突变负荷及微卫星不稳定状态的变化趋势，且该区域覆盖了常见的靶向用药相关突变位点，可以同时用于各种肿瘤分子标志物的检测。
实体多基因检测基因芯片及其制备方法装置

[发明专利]一种乳腺癌样本的染色方法及试剂盒-CN202310136460.6在审
发明人：孙景云;王光杓;范师恒;陈龙昀;吴东方;高志博 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2023-02-20 - 公布日： 2023-05-12 - 主分类号： G01N33/533 文献下载
摘要：一种乳腺癌样本的染色方法及试剂盒，染色方法包括：染色步骤，包括按照如下抗原组中的抗原顺序，使用对应的一抗依次对待测的乳腺癌样本进行染色，得到染色后的样本：CD20、CD8、FOXP3、CD4、CD56、panCK。本发明对单张切片进行多重免疫荧光检测，可同时呈现六个抗原靶标的表达情况，显著提高单张组织样本的利用率，尤其是珍贵样本。
一种乳腺癌样本染色方法试剂盒

[发明专利]一种癌样本的染色方法及试剂盒-CN202310136462.5在审
发明人：孙景云;王光杓;范师恒;陈龙昀;吴东方;高志博 -专利权人：深圳裕康医学检验实验室
申请日： 2023-02-20 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： G01N33/533 文献下载
摘要：一种癌样本的染色方法及试剂盒，该方法包括：染色步骤，包括按照如下抗原组中的抗原顺序，使用对应的一抗依次对待测的样本进行孵育，使用染色剂对孵育后的样本进行染色，得到染色后的样本：Granzyme B、CD8、FOXP3、CD4、PD1、CD56。本发明提供的用于尿路上皮癌、食管癌和宫颈癌样本的全自动多色免疫荧光检测试剂盒及方法实现了自动化检测，对单张切片进行多重免疫荧光实验，可同时呈现六个抗原靶标的表达情况，显著提高单个样本的利用率，尤其是珍贵样本。
一种样本染色方法试剂盒

[发明专利]一种肺癌和/或胰腺癌样本的染色方法及试剂盒-CN202310136457.4在审
发明人：孙景云;王光杓;范师恒;陈龙昀;吴东方;高志博 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2023-02-20 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： G01N1/30 文献下载
摘要：一种肺癌和/或胰腺癌样本的染色方法及试剂盒，染色方法包括按照如下抗原组中的抗原顺序，使用对应的一抗依次对待测的肺癌和/或胰腺癌样本进行孵育，使用染色剂对孵育后的样本进行染色，得到染色后的样本：OX40、CD3、FOXP3、CD4、CD8、panCK。本发明可以对单张切片进行多重免疫荧光实验，可同时呈现六个抗原靶标的表达情况，显著提高单张组织样本的利用率，尤其是珍贵样本。
一种肺癌胰腺癌样本染色方法试剂盒

[发明专利]一种分析体细胞变异的方法及装置-CN202210325324.7有效
发明人：杨露;吴东方;杨洁;唐启覃;陈龙昀;陈丽;王鹏;邓乙晓;徐嵘;吴旭君;许淑兰 -专利权人：深圳裕康医学检验实验室
申请日： 2022-03-29 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：一种分析体细胞变异的方法及装置，该方法包括：变异所属基因分析步骤，包括确定目标变异所属基因类型以及基因分类，输出相关信息；变异生物学意义和/或致癌性预测步骤，包括根据目标变异在数据库中的信息，进行综合分析，输出生物学意义和/或致癌性信息。本发明方便体细胞变异解读工作人员快速检索查询、核对目标变异的相关信息，可以快速预测目标变异的生物学意义和/或致癌性，极大地提高了体细胞变异解读的效率和准确性，同时也为后续个体化肿瘤精准用药相关报告的体细胞变异自动化解读提供了强大的技术支持。
一种分析体细胞变异方法装置

[发明专利]用于目标区域捕获测序检测MSI的方法、装置和存储介质-CN201910845662.1有效
发明人： 陈龙昀;李淼;聂新华;杨洁;王佳茜;王鹏 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2019-09-09 - 公布日： 2023-02-07 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：一种用于目标区域捕获测序检测MSI的方法、装置和存储介质，其中方法包括：获取微卫星区域，以及来源于同一受检个体的肿瘤样本和对照样本的目标区域捕获测序数据；通过长度分布统计获得每个微卫星区域的参考基因组上重复序列的长度R，以及肿瘤样本和对照样本中不同重复序列长度的丰度；通过区域筛选获得过滤筛选后的微卫星区域；通过MSI区域判定获得MSI区域；以及，通过MSI打分得到肿瘤样本的最终MSI分值，获知微卫星不稳定性高低情况。本发明的方法，在保证检测速度的同时，提升目标区域检测MSI的结果准确性和稳定性。
用于目标区域捕获检测 msi 方法装置存储介质

[发明专利]基于二代测序的插入缺失突变检测方法、装置和存储介质-CN201810273763.1有效
发明人： 陈龙昀;李淼;高志博;王佳茜;陈超;杨洁 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2018-03-29 - 公布日： 2022-05-20 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于二代测序的插入缺失突变检测方法、装置和存储介质。本申请方法包括，利用待测样本比对到参考基因组的文件，提取突变等位基因频率大于或等于阈值的候选突变位点集合；过滤去除在短串联重复区域的位点；详细统计各突变位点及其周围的比对信息，包括：InDel位点和参考碱基支持数、比对质量、覆盖深度、周围非参考碱基和其他插入缺失突变情况、周围读段质量；根据统计信息，过滤去除未达设定阈值的位点，得到突变结果。本申请方法，无需局部组装，预先对二代测序数据进行过滤，快速排除大部分由比对造成的假阳性结果，降低检测运行时间和计算资源，提高了检测效率；敏感性和特异性强，能快速精准检测InDel突变。
基于二代插入缺失突变检测方法装置存储介质

[发明专利]基于二代测序的肿瘤新生抗原检测方法、装置和存储介质-CN201810601500.9有效
发明人：王佳茜;高志博;陈龙昀;李淼 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2018-06-12 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于二代测序的肿瘤新生抗原检测方法、装置和存储介质。本申请的肿瘤新生抗原检测方法包括，变异检测步骤、MHC分子鉴定步骤、变异注释步骤、突变肽段预测步骤、突变肽段MHC/II型亲和力预测步骤、抗原表达丰度检测步骤、克隆性分析步骤和候选肿瘤新生抗原综合打分排序步骤；其中，新生抗原综合打分排序步骤包括按照公式一，根据MHC亲和力、抗原表达丰度和克隆性对新生抗原进行打分排序。本申请的肿瘤新生抗原检测方法，直接以二代测序的比对文件为基础进行突变和MHC检测，并且从MHC I/II型亲和力、抗原表达丰度、克隆性三个维度对候选肿瘤新生抗原进行打分，从而筛选出高质量的肿瘤新生抗原，为基于肿瘤新生抗原的免疫治疗奠定了基础。
基于二代肿瘤新生抗原检测方法装置存储介质

[发明专利]一种非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法及装置-CN202110710886.9在审
发明人：易坚;徐文魁;王佳茜;金皓玄;陈龙昀;苏小凡 -专利权人：深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-06-25 - 公布日： 2021-09-28 - 主分类号： G16H50/50 文献下载
摘要：一种非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法及装置，该方法包括：使用来自受试者的样本的生物标志物检测结果进行计算，得到受试者临床持续受益的概率值，根据所述概率值，判断受试者为临床持续受益或不可持续受益的受试者。本发明使用高准确性的算法对基因组学标记物构建了机器学习模型，与当前普遍使用TMB、ITH、HLA LOH等标志物相比，该模型提升了非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测的准确性和稳定性，可以更精准辅助指导患者选择治疗方案。
一种细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法装置

[发明专利]一种HLA基因分型方法、装置和存储介质-CN202110698318.1在审
发明人：易坚;陈前兴;王佳茜;陈龙昀;苏小凡 -专利权人：深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-09-03 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本申请公开了一种HLA基因分型方法、装置以及存储介质，方法包括：HLA预测分型获取步骤、HLA分型标记步骤、HLA分型整合步骤。本申请HLA基因分型方法，通过对不同基因分型工具获得的HLA预测分型进行权重分值的标记，对不同基因分型工具获得的HLA预测分型按照权重分值进行整合，能够充分利用每个基因分型工具的检测优势，减少由于测序深度等因素带来的某些基因分型工具准确率不高等问题，从而提高了HLA分型的准确率。
一种 hla 基因方法装置存储介质

[发明专利]基于血液循环肿瘤DNA的单核苷酸变异检测方法、装置和存储介质-CN201910255969.6有效
发明人：倪帅;李淼;陈龙昀;张艳鹏;但旭;陈超 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2019-03-29 - 公布日： 2021-07-20 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：一种基于血液循环肿瘤DNA的单核苷酸变异检测方法、装置和存储介质，该方法包括：获取测试样本的血液循环肿瘤DNA各位点的突变数据，该突变数据包括位点突变频率；获取训练样本的每个位点背景突变频率的置信范围，该置信范围是通过对每一例训练样本中的所有三碱基突变频率和位点突变频率进行学习建模，并使用原地更新的列表对模型进行训练而得到；对测试样本的各位点的位点突变频率和模型中每个位点的背景突变频率的置信范围进行比较，输出测试样本的位点突变频率未在置信范围内的单核苷酸变异作为检测结果。本发明在大幅优化计算资源需求和检测速度的同时，提升了检测ctDNA单核苷酸突变的敏感性和准确性，满足肿瘤临床检测ctDNA单核苷酸突变可靠性需求。
基于血液循环肿瘤 dna 核苷酸变异检测方法装置存储介质

[发明专利]免疫检查点抑制剂治疗相关生物标志物解读系统及其构建方法和装置-CN201910574190.0有效
发明人：杨洁;徐丽;陈晨;邓乙晓;张毅红;陈龙昀 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2019-06-28 - 公布日： 2021-07-20 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：一种免疫检查点抑制剂治疗用药的指导系统，包括免疫检查点抑制剂相关生物标志物解读系统及其构建方法、用药指导适配方法、装置和存储介质，其中解读系统构建方法包括：获取公共数据资源，其包括与肿瘤免疫检查点抑制剂治疗相关的生物标志物信息等；对公共数据资源进行筛选和分类，确定待录入解读系统中的信息的关键字段及属性；对免疫检查点抑制剂相关临床证据信息进行等级归类；建立解读系统的结构框架；按照统一的标准化录入规则将关键字段信息录入到解读系统结构框架的相应字段位置。本发明解决免疫检查点抑制剂治疗用药指导过程中资料零散、资料搜集不全面、查询程序繁琐、免疫检查点抑制剂用药推荐无优先级导致用药指导不精准的问题。
免疫检查点抑制剂治疗相关生物标志解读系统及其构建方法装置

[发明专利]用于预测肿瘤免疫治疗效果的生物标志物检测方法及系统-CN202010885125.2在审
发明人： 陈龙昀;易坚;金皓玄;苏小凡;高志博 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2020-08-28 - 公布日： 2020-11-24 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于预测肿瘤免疫治疗效果的生物标志物检测方法，该方法基于二代测序检测组织全外显子测序(WES)的数据，对多个生物标志物进行检测，构建了一个综合预测肿瘤免疫治疗效果的预测模型，与传统的仅能检测单一生物标志物的方法相比，有效提升了对免疫检查点抑制剂疗效预测的准确性和适用性。
用于预测肿瘤免疫治疗效果生物标志检测方法系统

[发明专利]一种检测肿瘤异质性程度的方法及系统-CN202010231560.3在审
发明人：金皓玄;方文峰;陈龙昀;苏小凡;廖裕威 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司
申请日： 2020-03-27 - 公布日： 2020-07-10 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供一种检测肿瘤异质性程度的方法及系统，该方法包括：获取肿瘤组织样本和对照样本的测序数据，进行体细胞变异检测，获得体细胞变异位点；将体细胞变异位点按簇进行聚类；根据聚类结果，判断主克隆突变簇和亚克隆突变簇；计算肿瘤组织样本中亚克隆突变簇中的体细胞变异数量占所有体细胞变异数量的比值，该比值即为肿瘤异质性数值。本发明充分利用样本各突变位点检测的突变频率，估算出对应肿瘤克隆的细胞占比，从而推算出肿瘤异质性程度的具体数值，为后续预测免疫治疗疗效提供了一个数值上可以参考的依据。
一种检测肿瘤异质性程度方法系统

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