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[发明专利]基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置-CN202210592146.4有效
发明人：但旭;王佳茜 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2022-05-27 - 公布日： 2022-12-27 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于二代测序数据检测MHC II型肿瘤新生抗原的方法和装置。本申请方法包括，分别获取肿瘤样本DNA和RNA测序数据，比对到人全基因组参考序列，分析鉴定肿瘤样本HLA分型，发生变异的基因，并将发生变异的基因翻译为氨基酸序列，将其作为候选集，分析各基因表达量值TPM，最后，根据HLA分型和MHC II型肿瘤新生抗原预测模型，从候选集中筛选表达量值TPM大于TPM阈值的氨基酸序列，作为MHC II型肿瘤新生抗原。本申请方法，直接通过二代测序数据预测MHC II型肿瘤新生抗原，解决了肿瘤免疫治疗中对II型新生抗原预测和筛选的迫切需求，为肿瘤免疫研究和针对新生抗原的免疫治疗提供了帮助。
基于二代序数检测 mhc ii 肿瘤新生抗原方法装置

[发明专利]一种试剂盒及其染色方法-CN202111482420.4有效
发明人：纵丹丹;张义兴;徐盛强;苏小凡 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司;深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-12-07 - 公布日： 2022-08-23 - 主分类号： G01N33/577 文献下载
摘要：一种试剂盒及其染色方法，试剂盒包含如下单克隆抗体组合中的至少一种：1)抗CD20单克隆抗体、抗α‑SMA单克隆抗体、抗panCK单克隆抗体、抗CD4单克隆抗体、抗CD8单克隆抗体、抗CD68单克隆抗体；2)抗FoxP3单克隆抗体、抗CD19单克隆抗体、抗FAP单克隆抗体、抗CD8单克隆抗体、抗CD163单克隆抗体、抗CD68单克隆抗体。该试剂盒能够有效地在同一组织上标记多种生物标志物，且多种标记之间无交叉反应。
一种试剂盒及其染色方法

[发明专利]一种肿瘤浸润淋巴细胞分析方法、装置和存储介质-CN202111362793.8有效
发明人：金皓玄;李晓婷;王佳茜;苏小凡 -专利权人：深圳裕策生物科技有限公司;深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-11-17 - 公布日： 2022-05-20 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种肿瘤浸润淋巴细胞分析方法、装置以及存储介质，方法包括：获取待测肿瘤组织切片的病理图像，所述病理图像为多重免疫组化染色图像或多重免疫荧光染色图像；根据病理图像的靶标标志物表达信号识别不同细胞的表型，以获得靶标标志物对应的细胞表型数据；根据靶标标志物对应的细胞表型数据对肿瘤浸润淋巴细胞进行定量和/或定性分析。本申请的肿瘤浸润淋巴细胞分析方法，通过mIHC/IF检测对TILs亚群深入分析，不仅能够分析特定的免疫细胞类型，还能整合肿瘤不同部位的免疫细胞之间的关系，获得更多的免疫治疗预后数据和预测数据，解决了肿瘤免疫治疗疗效评估缺乏生物标志物的问题。
一种肿瘤浸润淋巴细胞分析方法装置存储介质

[发明专利]一种判读淋巴细胞的方法及装置-CN202111662822.2在审
发明人：易坚;杨质瑾;王佳茜;苏小凡 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-12-31 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：一种判读淋巴细胞的方法及装置，判读淋巴细胞的方法包括：细胞分割步骤，包括对病理图像进行细胞分割；细胞分类步骤，包括从细胞分割后的病理图像中识别出淋巴细胞。通过软件自动化完成细胞分割、淋巴细胞识别，无需人工参与，有效提高判读淋巴细胞的效率以及准确性。
一种判读淋巴细胞方法装置

[发明专利]一种基于多重免疫组化技术的生物标志物分析方法及其应用-CN202110719936.X有效
发明人：李晓婷;金皓玄;王佳茜;苏小凡 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-06-28 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明提供一种基于多重免疫组化技术的生物标志物分析方法及其应用。其中该生物标志物分析方法利用图像识别系统肿瘤组织样本的组织形态学、细胞表型以及相应的空间坐标信息，并通过双阳性细胞评分、肿瘤‑免疫抑制相对距离比这两种生物标志物对肿瘤免疫微环境进行自动分析。本发明还提供用于实施该方法的装置和设备，以及相应的计算机可读介质。通过本发明可以更加准确高效地表征肿瘤免疫微环境的空间联系状态，使肿瘤免疫微环境相关指标能够更有效地对免疫治疗疗效进行评估，满足临床病理工作以及科学研究中通过多重免疫组化技术进行肿瘤免疫微环境分析的需求。
一种基于多重免疫技术生物标志分析方法及其应用

[发明专利]一种新生抗原免疫原性的测试方法-CN202010607722.9有效
发明人：唐云霞;王煜;高志博;李淼;张义兴;朱小娟 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2020-06-30 - 公布日： 2022-04-05 - 主分类号： C12N5/0783 文献下载
摘要：本发明公开了一种新生抗原免疫原性的测试方法，通过将多条抗原多肽分为几组，利用单独负载、共同刺激的方式，显著降低了实验的操作复杂度，大幅简化了实验流程的同时，保证了实验结果的准确性，与常规单独负载、单独刺激的方式相比，可通过多条多肽共同刺激T细胞，测试时，只需检测一份T细胞中含有的不同新生抗原多肽特异性T细胞，测试过程得到了显著简化，提高了工作效率，同时降低了测试成本。
一种新生抗原免疫原性测试方法

[发明专利]一种预测新生抗原的方法及装置-CN202111602428.X在审
发明人：但旭;王佳茜;苏小凡 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-12-24 - 公布日： 2022-03-18 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：一种预测新生抗原的方法及装置，该方法包括：提取重叠序列步骤；建立索引步骤；比对步骤；融合检测步骤；注释步骤；HLA分型鉴定步骤；预测步骤。将测序数据分别比对到病毒、人类参考基因组，解决了同时比对人基因组和病毒基因组时可能存在比对到病毒和人基因组相似区域的问题。
一种预测新生抗原方法装置

[发明专利]一种非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法及装置-CN202110710886.9在审
发明人：易坚;徐文魁;王佳茜;金皓玄;陈龙昀;苏小凡 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-06-25 - 公布日： 2021-09-28 - 主分类号： G16H50/50 文献下载
摘要：一种非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法及装置，该方法包括：使用来自受试者的样本的生物标志物检测结果进行计算，得到受试者临床持续受益的概率值，根据所述概率值，判断受试者为临床持续受益或不可持续受益的受试者。本发明使用高准确性的算法对基因组学标记物构建了机器学习模型，与当前普遍使用TMB、ITH、HLA LOH等标志物相比，该模型提升了非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测的准确性和稳定性，可以更精准辅助指导患者选择治疗方案。
一种细胞肺癌患者免疫治疗疗效预测方法装置

[发明专利]一种HLA基因分型方法、装置和存储介质-CN202110698318.1在审
发明人：易坚;陈前兴;王佳茜;陈龙昀;苏小凡 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-09-03 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本申请公开了一种HLA基因分型方法、装置以及存储介质，方法包括：HLA预测分型获取步骤、HLA分型标记步骤、HLA分型整合步骤。本申请HLA基因分型方法，通过对不同基因分型工具获得的HLA预测分型进行权重分值的标记，对不同基因分型工具获得的HLA预测分型按照权重分值进行整合，能够充分利用每个基因分型工具的检测优势，减少由于测序深度等因素带来的某些基因分型工具准确率不高等问题，从而提高了HLA分型的准确率。
一种 hla 基因方法装置存储介质

[发明专利]一种使用外周血检测抗原免疫原性的方法-CN202110049135.7在审
发明人：唐云霞;高志博;张义兴;苏小凡 -专利权人：深圳裕康医学检验实验室;深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2021-01-14 - 公布日： 2021-04-16 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：一种使用外周血检测抗原免疫原性的方法，包括：离心步骤，包括使用密度梯度离心管对外周血样本进行离心，分离得到外周血单个核细胞；多肽培养步骤，包括取部分外周血单个核细胞，培养过程中，分多次加入待测抗原多肽、培养基、细胞因子，培养得到被多肽刺激的外周血单个核细胞；树突状细胞培养步骤，包括取部分外周血单个核细胞，诱导培养，得到树突状细胞；检测步骤，将被多肽刺激的外周血单个核细胞与树突状细胞混合孵育，检测抗原多肽是否具有免疫原性。通过短时间离心后，进行多肽刺激培养外周血单个核细胞，可快速检测待测抗原的免疫原性，显著简化操作步骤，缩短检测时间，并且只需少量外周血，显著降低样本的获取难度。
一种使用外周血检测抗原免疫原性方法

[发明专利]同时检测新生抗原免疫原性和新生抗原特异性TCR的方法-CN202010811147.4在审
发明人：唐云霞;高志博;王煜;张义兴;王佳茜;彭厘旻 -专利权人： 深圳裕泰抗原科技有限公司
申请日： 2020-08-13 - 公布日： 2020-11-10 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种同时检测新生抗原免疫原性和新生抗原特异性TCR的方法，通过在外周血单个核细胞(PBMC)中加入新生抗原多肽，获取经抗原刺激的细胞，与传统方法比，减少了获取抗原特异性细胞所需的时间，验证新生抗原免疫原性及获得TCR CDR3序列的整个过程仅需13天，与传统方法长达40天的处理过程相比，大大节省了时间成本。与传统的MHC‑肽四聚体技术相比，费用低廉，MHC‑肽四聚体技术中一条抗原多肽需要制备一种专门的四聚体，而本发明所述的测序方法，成本得到了显著降低，与传统的ELISPOT方法其测试通量仅能达到10条/批次相比，本发明采用的测序方法测试通量不受限，效率更高，且测试结果准确度高、适用性广。
同时检测新生抗原免疫原性特异性 tcr 方法

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