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[发明专利]集群配置方法及其装置、设备、介质、产品-CN202210473900.2在审
发明人：万季 -专利权人：广州华多网络科技有限公司
申请日： 2022-04-29 - 公布日： 2022-08-09 - 主分类号： G06F9/455 文献下载
摘要：本申请公开一种集群配置方法及其装置、设备、介质、产品，所述方法包括：获取初始集群配置信息，所述集群配置信息包括商品搜索服务相对应的节点数量；基于初始集群配置信息变动其中的节点数量获得多个目标集群配置信息；应用预设的性能评估公式，以根据预设的调节系数计算出所述各个目标集群配置信息对应的集群搜索性能数据；选取符合预设条件的集群搜索性能数据相对应的目标集群配置信息用于配置所述商品搜索服务所需的节点数量。本申请可在集群扩缩容操作之前预估变更后集群相对应的搜索性能，合理化规划运算资源配置集群。
集群配置方法及其装置设备介质产品

[发明专利]基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法和装置-CN201711276870.1有效
发明人：万季;宋麒;潘有东;崔好;韩艳;高峰 -专利权人：北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
申请日： 2017-12-06 - 公布日： 2022-08-05 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：提供一种基于细胞游离DNA的深度测序数据提取生物标记物的方法和装置。方法包括由处理器执行的如下步骤：获取不同类别的样本的细胞游离DNA的深度测序数据；计算每个样本数据在每个碱基位置的各变异的频率值；基于所计算的每个碱基位置的各变异的频率值，得到每个类别在所有碱基位置上的变异的频率分布；确定频率分布在类别间具有充分差异的变异；以及基于所确定的变异提取所述生物标记物。该方法可以极大限度地挖掘cfDNA数据中的信息。
基于细胞游离 dna 深度序数提取生物标记方法装置

[发明专利]一种提取免疫治疗新抗原的方法及系统-CN201910823630.1有效
发明人：万季;宋麒;潘有东;夏迪;刘鹏;汪健 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2019-09-02 - 公布日： 2022-06-17 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种提取免疫治疗新抗原的方法及系统，其中方法包括：步骤S1：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的常规蛋白质组；步骤S2：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的碱基单体单元序列库以及样本肿瘤组织的特异蛋白质组；步骤S3：基于样本肿瘤组织的常规蛋白质组、样本肿瘤组织的特异蛋白质组和人类白细胞抗原HLA分子分型，获得若干候选的肿瘤特异性新抗原；步骤S4：基于所获取的若干候选的肿瘤特异性新抗原，分别计算其在样本肿瘤组织常规蛋白质组、样本正常组织常规蛋白质组、样本肿瘤组织碱基单体单元序列库与样本正常组织碱基单体单元序列库中的存在情况，并与基因表达变化倍数作为过滤规则，获得肿瘤特异性新抗原。从来源上讲，通过本发明的方案发现的肿瘤特异新抗原部分来自基因组非编码区，而不局限于编码区，因此可以发现更多的新抗原。
一种提取免疫治疗抗原方法系统

[发明专利]三重qPCR检测DNA甲基化的试剂盒和方法-CN201811056731.2有效
发明人：韩艳;霍华德·霍约恩·章;余涛;万季;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2018-09-11 - 公布日： 2022-04-08 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本公开提供了三重qPCR检测DNA甲基化的试剂盒和方法。所述试剂盒包含三组引物和探针的组合，其中两组引物和探针的组合是以选自人类SEPT9基因序列范围内的两个区域为靶点设计的引物和探针的组合，另一组引物和探针的组合是以内部参照基因为靶点设计的引物和探针的组合。所述试剂盒能够更敏感和准确地确定特定区域DNA甲基化水平或状态。
三重 qpcr 检测 dna 甲基化试剂盒方法

[发明专利]基于多肽结构性指标预测新抗原的方法-CN202110696098.9在审
发明人：万季;李东;汪健;赵钊;潘有东;王弈 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-10-22 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多肽结构性指标预测新抗原的方法，属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤：S01，获取样品测序数据；S02，识别样品体细胞变异；S03，样品变异过滤；S04，翻译变异序列为蛋白质；S05，蛋白片段分割，并过滤人类正常蛋白质组中多肽；S06，预测蛋白片段结构；S07，计算相应多肽结构性指标；S08，筛选新抗原。发明基于多肽结构的指标，可以从微观层面对新抗原的性质进行刻画，从而对分子生物学特征筛选新抗原的方法是一个重要补充。
基于多肽结构性指标预测抗原方法

[发明专利]用于肺癌检测的DNA甲基化qPCR试剂盒及使用方法-CN201910054201.2有效
发明人：韩艳;霍华德;万季;王志强;余涛;张超;张剑;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2019-01-21 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明属于生物技术和DNA检测技术领域，尤其涉及一种用于肺癌检测的DNA甲基化qPCR试剂盒及其使用方法，具体而言，涉及一种利用血浆游离DNA进行甲基化qPCR以确定一个或多个基因靶点(例如SHOX2、HOXA9和TAC1)的甲基化状态来用于肺癌检测或筛查的试剂盒及其使用方法，经实验测试，本发明试剂盒可将生物标记物的检测灵敏度提高到皮克/纳克级DNA分子，检测灵敏度的提高是通过优化特定核苷酸序列引物及DNA探针以及改进血浆游离DNA的亚硫酸氢盐处理方法来实现的。
用于肺癌检测 dna 甲基化 qpcr 试剂盒使用方法

[发明专利]基于价格收益与社会感知个性化动态车辆合乘方法及系统-CN201811300578.3有效
发明人：李亚飞;万季;顾红艳;吕培;徐明亮;郭毅博;姜晓恒;朱睿杰;周兵 -专利权人：郑州大学
申请日： 2018-11-02 - 公布日： 2021-09-10 - 主分类号： G06Q10/04 文献下载
摘要：本发明具体涉及一种基于价格收益与社会感知个性化动态车辆合乘方法及系统，本发明基于价格收益与社会感知的个性化动态车辆合乘方法，将用户关心的社交关系与价格机制同时作用于车辆合乘匹配服务中，进行匹配时，在保证乘客基本行程约束的前提下，不仅考虑新乘客对司机带来的价格收益，还考虑把具有一定社会关系的乘客优先安排在一辆车上，在满足乘客基本行程需求的情况下，兼顾乘客的舒适度和司机的价格收益。本发明可以为用户提供一整套匹配过程的优化机制，通过利用价格收益和社会关系的上限，分支界限算法以及索引机制等对搜索空间进行裁剪，提高了乘客与车辆匹配的速率，提升了系统运行效率，改善了合乘体验。
基于价格收益社会感知个性化动态车辆方法系统

[发明专利]一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法-CN202110696080.9在审
发明人：万季;刘鹏;沈一鸣;潘有东;王弈 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-09-07 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法，属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤：S01，组装肿瘤样品转录本；S02，筛选样本HPV整合转录本；S03，翻译HPV整合转录本为多肽；S04，获取多肽短序列片段，并过滤人类正常蛋白质组中多肽；S05，样品人类白细胞抗原基因分型；S06，肽段亲和力预测、新抗原筛选。本发明得到的新抗原是HPV整合的结果，与疾病进展过程密切相关。本发明得到的新抗原来自于RNA测序数据，是细胞转录的结果，有更高的概率翻译产生蛋白质。
一种基于 hpv 整合肿瘤抗原预测方法

[发明专利]一种筛选siRNA序列以降低脱靶效应的方法及系统-CN202110213616.7在审
发明人：万季;沈一鸣;刘鹏;徐韵婉;潘有东;王弈;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2021-02-25 - 公布日： 2021-06-11 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明提出了一种筛选siRNA序列以降低脱靶效应的方法及系统，包括：步骤S1：整合siRNA候选序列数据，对siRNA序列目标区域基因组区间进行有无常见SNP的标注；步骤S2：对siRNA正负链序列特征进行分析，对siRNA正负链序列进行是否能正确识别正负链的标注；步骤S3：对siRNA序列的负链特征进行分析，对siRNA序列的负链进行是否能够引发自身免疫反应的标注；步骤S4：对siRNA正负链序列特异性进行分析，对siRNA正负链序列进行siRNA序列特异性标注；步骤S5：综合上述所有标注结果，对候选siRNA序列进行筛选。所述系统包括与所述方法的步骤对应的单元模块。
一种筛选 sirna 序列降低脱靶效应方法系统

[发明专利]一种基于机器学习算法获取肿瘤标记物的方法和系统-CN202011411176.8在审
发明人：万季;叶一林;汪健;夏迪;潘有东;王弈;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2020-12-04 - 公布日： 2021-03-09 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于机器学习算法获取肿瘤标记物的方法和系统，所述方法包括：采集点肿瘤标记物检测样本的样本数据；对所述样本数据进行初步特征数据的筛选，获得特征索引；将特征索引对应的特征数据取出并拼接形成样本的特征向量；根据样本特征向量进行神经网络模型的训练；利用训练好的神经网络模型对肿瘤标记物进行检测，并输出真的结果信息，所述系统包括与所述方法步骤对应的模块。
一种基于机器学习算法获取肿瘤标记方法系统

[发明专利]检测人MLH1基因甲基化的试剂盒及其使用方法-CN202011415072.4在审
发明人：王志强;万季;蔡雪儿;罗海燕;王一杏;夏迪;汪健;金泰庆;关建洪;王弈;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2020-12-04 - 公布日： 2021-02-23 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测人MLH1基因甲基化的试剂盒及其使用方法。该试剂盒包括检测或测量受试样品DNA中MLH1基因的甲基化状态或水平的特异性引物和探针。本发明试剂盒能够显著提高早期结直肠癌的阳性检出率和特异性(真实阴性率)，可将生物标记物的检测灵敏度提高到皮克/纳克级DNA分子，检测灵敏度的提高是通过优化特定核苷酸序列引物及DNA探针以及改进血浆游离DNA的亚硫酸氢盐处理方法来实现的。
检测 mlh1 基因甲基化试剂盒及其使用方法

[发明专利]检测人SEPT9基因甲基化的试剂盒及其使用方法、应用-CN202011414930.3在审
发明人：王志强;万季;蔡雪儿;罗海燕;王一杏;夏迪;汪健;金泰庆;关建洪;王弈;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2020-12-04 - 公布日： 2021-02-05 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测人SEPT9基因甲基化的试剂盒及其使用方法、应用。该试剂盒包括检测或测量受试样品DNA中SEPT9基因的甲基化状态或水平的特异性引物和探针。本发明试剂盒能够显著提高早期肝癌的阳性检出率和特异性(真实阴性率)，可将生物标记物的检测灵敏度提高到皮克/纳克级DNA分子，检测灵敏度的提高是通过优化特定核苷酸序列引物及DNA探针以及改进血浆游离DNA的亚硫酸氢盐处理方法来实现的。
检测 sept9 基因甲基化试剂盒及其使用方法应用

[发明专利]一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统-CN202011098269.X在审
发明人：万季;沈一鸣;汪健;潘有东;王弈;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2020-10-14 - 公布日： 2021-02-02 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提供一种计算肿瘤新抗原负荷的方法及系统，其中方法包括：步骤S1：整合样本正常及肿瘤数据，对特定区间进行测序并检测样本的体细胞突变；步骤S2：对体细胞突变进行注释过滤，并进行翻译得到患者的突变多肽序列；步骤S3：根据样本正常蛋白质组，过滤突变多肽序列，得到新多肽序列；步骤S4：根据样本正常比对数据进行人类白细胞抗原分型分析，得到样本的HLA基因型；本发明的计算肿瘤新抗原负荷的方法，对每一个预测的新抗原进行权重打分，考虑到突变质量、突变频率以及亲和力高低等不同维度信息，能够区别高质量和低质量的新抗原，从而得到一个更能反应样本真实肿瘤新抗原负荷的数值。
一种计算肿瘤抗原负荷方法系统

[发明专利]一种基于甲基化芯片数据获取肿瘤甲基化标记物的方法及系统-CN202011100217.1在审
发明人：李霞;万季;陈文霞;吴大英;祁淑英;杨楚钦;胡桂林 -专利权人：深圳市龙岗中心医院
申请日： 2020-10-15 - 公布日： 2020-12-04 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提供一种基于甲基化芯片数据获取肿瘤甲基化标记物的方法及系统，所述方法包括：获取甲基化芯片中的样本数据；对样本数据进行预处理；对预处理结果进行T检验；根据T检验结果从预处理结果中筛选出肿瘤甲基化标记物。所述系统包括与所述方法步骤对应的模块。本发明的基于甲基化芯片获取肿瘤甲基化标记物的方法及系统，基于DNA甲基化芯片数据筛选肿瘤甲基化标志物，提高了肿瘤甲基化标记物筛选的可靠性与有效性，筛选方法简便可行，可广泛应用于医学计算机应用领域。
一种基于甲基化芯片数据获取肿瘤标记方法系统

[发明专利]基于深度学习的白细胞抗原与多肽结合亲和力预测方法-CN202010732369.7在审
发明人：叶一林;万季;汪健;徐韵婉;潘有东;王奕;宋麒 -专利权人：深圳市新合生物医疗科技有限公司
申请日： 2020-07-27 - 公布日： 2020-11-17 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供一种基于深度学习的白细胞抗原与多肽结合亲和力预测方法，包括：步骤S101：对人类白细胞抗原序列进行编码；步骤S102：构建人类白细胞抗原序列与肽段对序列；步骤S103：构建人类白细胞抗原序列与肽链对编码矩阵；步骤S104：人类白细胞抗原与肽段结合的亲和力预测模型构建。本发明综合考虑了人类白细胞抗原蛋白序列与肽段各自的序列对亲和力强度的影响，开发了一种基于深度学习的白细胞抗原与多肽结合亲和力预测方法。
基于深度学习白细胞抗原多肽结合亲和力预测方法