本发明公开了一套用于扩增犬瘟热病毒全基因组序列的通用引物组及其应用。所述的引物组由11对引物组成,每对引物由上游引物和下游引物组成,所述的11对引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑22所示。本发明分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒的全基因组序列,针对保守区设计了11对特异性通用引物。研究结果表明,这11对通用引物能够方便、精准扩增犬瘟热病毒野毒和疫苗毒株的全基因组序列,显著提高了获得犬瘟热病毒不同毒株全基因组序列的效率,缩短了获得其他犬瘟热病毒未知毒株全序列的时间。
本发明公开了BRAF基因突变检测的引物和探针及应用,属于基因检测技术领域,所述引物包括同时扩野生型基因和突变型基因的通用引物,以及只扩增突变型基因的突变引物,所述突变引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。本发明的引物和探应用于荧光定量PCR检测中,结果发现操作简单、费用低廉且准确度高。
本发明属于生物医学领域,具体涉及一种高灵敏的SNPs检测体系(Competitive Snake primer PCR,CoSP)及应用,包括分别针对野生型、突变型基因的野生型snake引物、突变型的snake引物,以及分别针对野生型、突变型基因的野生型引物、突变型引物;野生型snake引物、突变型引物、通用发光探针构成第一引物组合,用于特异性扩增突变型模板;突变型snake引物、野生型引物、通用发光探针构成第二引物组合本发明通过特异性snake引物和和另一引物竞争杂交方法,提高了检测的特异性和灵敏度。可以不需要特殊反应试剂和碱基特殊修饰,成本低;不需要特殊反应程序,操作简单。
本发明属于分子生物学检测技术领域,具体涉及一种鲍疱疹病毒HaHV‑1通用型RPA核酸等温扩增引物、试剂盒及其应用。所述引物为成套引物组合,由上下游引物和探针引物组成;上游引物如SEQ ID NO.1所示;下游引物如SEQ ID NO.2所示;探针引物如SEQ ID NO.3所示。本发明针对目前已知鲍疱疹病毒HaHV‑1不同变异株,根据保守区段设计了通用的RPA扩增检测引物,建立了HaHV‑1的试纸条RPA检测体系和方法,该技术对养殖过程或进出口贸易中涉及HaHV‑1的现场快速筛查和检测具有重要价值
本发明公开了一种一种鱼类线粒体12S宏条形码通用扩增引物,所述引物的上游引物为qdfish‑F1,如SEQ ID NO.1所示:CGGTAAAACTCGTGCCAGCC;所述引物的下游引物为qdfish‑R1,所述引物用于鉴定或辅助鉴定鱼类物种以及应用于利用eDNA技术进行鱼类多样性调查、入侵物种调查和濒危物种保护。一种如权利要求1所述鱼类线粒体12S宏条形码通用扩增引物的应用方法,(1)环境DNA样本的提取;(2)目的片段的扩增:对步骤(1)中的环境DNA样本进行PCR扩增,引物为权利要求1或2所述的至少一对引物对
本发明涉及一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,包括:(1)miRNA检测引物的设计:茎环引物包括两部分,通用的茎环序列和与靶标miRNA3’端互补配对的特异引物序列,其中与靶标miRNA互补配对的碱基数为11bp;qPCR的下游引物针对通用的茎环序列,上游引物针对靶标miRNA的5’端;在所述上游引物的5’末端增加GC尾巴,以使上下游引物的退火温度相近;(2)将靶标miRNA反转录成cDNA本发明的方法特异性好、灵敏性高,且只需合成一种下游引物,采用SYBR Green I荧光染料法,大大节约了成本。