本发明公开了属于功能酶筛选技术领域的一种脂肪酶及其应用。本发明的脂肪酶氨基酸序列为SEQ ID NO:1,本发明还提供重组宿主,用于重组表达上述的脂肪酶。本发明的脂肪酶用于催化鱼油水解反应获得富集DHA/EPA的甘油酯。本发明的脂肪酶具有一定的脂肪酸选择性和甘油骨架位置选择性,可催化鱼油甘油酯组分中饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸的优先水解,从而使甘油骨架上的EPA/DHA含量升高,36h内即可使鱼油中EPA/DHA含量从17.5同时,该脂肪酶还表现出了位置选择性,可以得到56.66%EPA/DHA含量的sn‑2位甘油单酯,这种形式的DHA甘油酯最容易被人体吸收。