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[发明专利]一种双向同源比对的非模式物种细胞注释方法-CN202210727902.X在审
发明人：周煌凯;高川;艾鹏;张从曦;孙鹏鹏 -专利权人：广州基迪奥生物科技有限公司
申请日： 2022-06-22 - 公布日： 2022-09-20 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种双向同源比对的非模式物种细胞注释方法，属于细胞注释技术领域，主要包括以下步骤：将非模式物种的基因组和模式物种的基因组进行双向同源比对，保留在两个方向上都配对一致的基因对；在模式物种的标记基因数据库中，将双向同源比对的基因对中的非模式物种的基因替代双向同源比对的基因对中与非模式物种同源的基因，得到非模式物种的表达量矩阵；通过软件调用非模式物种的表达量矩阵的基因数据进行注释，得到非模式物种细胞类型的注释结果采用该双向同源比对的非模式物种细胞注释方法，可以精确对非模式物种的基因进行同源比对，得到与模式物种同源的基因，利用模式物种的标记基因数据库实现对非模式物种的细胞注释。
一种双向同源模式物种细胞注释方法

[发明专利]等位基因调用和倍性调用的方法-CN201510180799.1有效
发明人： M·罗比诺威特茨;G·杰梅罗斯;M·班杰维齐;A·瑞安;J·斯威特凯德-辛格 -专利权人：纳特拉公司
申请日： 2009-08-04 - 公布日： 2017-08-22 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明涉及进行等位基因调用、确定一个或少数细胞或当可用的基因数据数量有限时的倍性态的体系和方法。使用目标基因组之间可预期的相似性以及有关基因相关个体基因组的知识，可重建测量不充分或不准确的碱基对、缺失的等位基因和缺失的区域，以及确定单体型。在一个具体实施方式中，使用来自父母双方和可能的一个或多个精子和/或同胞胚胎的基因数据，重建了胚胎细胞多个基因座上不完整的基因数据。在另一个具体实施方式中，染色体的拷贝数可使用相同的输入数据确定。
等位基因调用方法

[发明专利]等位基因调用和倍性调用的方法-CN200980139431.3有效
发明人： M·罗比诺威特茨;G·杰梅罗斯;M·班杰维齐;A·瑞安;J·斯威特凯德-辛格 -专利权人：吉恩安全网络公司
申请日： 2009-08-04 - 公布日： 2011-08-31 - 主分类号： G01N33/483 文献下载
摘要：本发明涉及进行等位基因调用、确定一个或少数细胞或当可用的基因数据数量有限时的倍性态的体系和方法。使用目标基因组之间可预期的相似性以及有关基因相关个体基因组的知识，可重建测量不充分或不准确的碱基对、缺失的等位基因和缺失的区域，以及确定单体型。在一个具体实施方式中，使用来自父母双方和可能的一个或多个精子和/或同胞胚胎的基因数据，重建了胚胎细胞多个基因座上不完整的基因数据。在另一个具体实施方式中，染色体的拷贝数可使用相同的输入数据确定。
等位基因调用方法

[发明专利]用于处理基因数据的方法和数据处理设备-CN202080087497.9在审
发明人：海克·齐默尔曼;萨宾·穆勒 -专利权人：弗劳恩霍夫应用研究促进协会
申请日： 2020-12-16 - 公布日： 2022-08-12 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：一种用于处理基因数据的方法，该基因数据包括一系列序列元素，该序列元素分别代表生物分子，该方法包括以下步骤：形成(S2)序列片段，其中，每个序列片段都包括所述一系列序列元素的、具有至少两个序列元素的片段长度的区段；将编码函数应用(S3)到该序列片段中的每个上以生成多个加密的片段数据，该加密的片段数据分别配属于该序列片段中的一个；以及存储(S4)该加密的片段数据，其中，实现序列片段的形成，以使得一系列序列元素的区段彼此重叠并且每个序列元素都包含在至少两个序列片段中还描述了一种用于处理基因数据的数据处理设备和一种用于查询数据库的方法，该数据库包含加密的片段数据，该加密的片段数据已利用该用于处理基因数据的方法被生成和存储。
用于处理基因数据方法数据处理设备

[发明专利]基于Android系统的智能基因库手机客户端-CN201210357649.X无效
发明人：姚迎宪 -专利权人：无锡莱吉特信息科技有限公司
申请日： 2012-09-24 - 公布日： 2013-01-09 - 主分类号： H04M1/725 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于Android系统的智能基因库手机客户端，其中：包括一个以上的基因数据搜集模块、数据对象信息采集模块、关系生成模块、基因关系分析模块和手机客户端；本发明所设计的基于Android系统的智能基因库手机客户端能够全面的采集个体的基因数据信息
基于 android 系统智能基因库手机客户端

[实用新型]基于Android系统的智能基因库手机客户端-CN201220489174.5有效
发明人：姚迎宪 -专利权人：无锡莱吉特信息科技有限公司
申请日： 2012-09-24 - 公布日： 2013-03-13 - 主分类号： H04M1/725 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种基于Android系统的智能基因库手机客户端，其中：包括一个以上的基因数据搜集模块、数据对象信息采集模块、关系生成模块、基因关系分析模块和手机客户端；本实用新型所设计的基于Android系统的智能基因库手机客户端能够全面的采集个体的基因数据信息，并生成相应的关系模型通过Android系统发送至移动设备，便于医疗工作者和科研工作者随时的进行工作。
基于 android 系统智能基因库手机客户端

[发明专利]一种基于表型表现的育种筛选系统及方法-CN202310751919.3在审
发明人：杨其长;王森;周成波;李宗耕;卢威;巫小兰;袁泉 -专利权人：中国农业科学院都市农业研究所
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于表型表现的育种筛选系统，包含：第一信息采集模块，包含采集植株图像的第一检测单元；基于所述第一信息采集模块采集的包含植株的表型数据，远程服务器将采集到的n个表型数据基于其数据特征进行分类，并生成对应的表型数据集合，其中，每个集合设置有其对应的类别标签；所述远程服务器包含基因数据库，其中，基于集合的类别标签，所述远程服务器关联所述基因数据库中存储的与植株表型相关的基因数据和集合的类别标签，并将具有关联性的至少一个基因作为第一优先级基因集合，以获得所述植株可能发生突变的基因。
一种基于表型表现育种筛选系统方法

[发明专利]药物组合预测系统和药物组合预测方法-CN201611052822.X在审
发明人：刘韦驿;邱育贤;徐仁徽;谢嘉珊;蔡孟勳;卢子彬;赖亮全;庄曜宇;萧晖议 -专利权人：财团法人资讯工业策进会
申请日： 2016-11-25 - 公布日： 2018-05-25 - 主分类号： G06F19/20 文献下载
摘要：储存装置用于储存数据库，数据库用于储存多个原始基因组、第一药品所影响的至少第一基因和第二药品所影响的至少第二基因。处理器用于将第一原始基因组中的至少第一基因的部分和至少第二基因的部分指定为第一协同基因组，计算第一协同基因组中的基因数量，以取得第一协同基因数量，依据第一协同基因数量在第一原始基因组中所占的第一比例，计算第一药物和第二药物的组合所对应的协同值
基因组基因协同储存装置协同基因预测系统处理器数据库储存协同药物运算量预测筛选

[发明专利]基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法-CN202210802687.5有效
发明人：盛晓娜;王嘉琦;佟良;周影 -专利权人：哈尔滨学院
申请日： 2022-07-07 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： G16B20/40 文献下载
摘要：基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法，涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决由于近亲亲属对数据获取难度大导致目前的基因连锁关系检测方法并不适用的问题。本发明所述系统包括：极值祖孙对判定模块：用于判定祖孙对类型；极值祖孙对设计模块：用于获取不同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率；遗传连锁检验模块：用于根据同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数判断祖孙对是否存在连锁关系；功效测定模块，用于根据祖孙对的类型和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率获取有连锁关系的祖孙对的检验功效。本发明用于检测基因的连锁关系并获取检验功效。
基于极值表型祖孙数据遗传连锁检验系统方法

[发明专利]使用具有患者特异性的相关性评价的变体-疾病关联性的诊断基因分析-CN201380061665.7在审
发明人： S·卡玛拉卡兰;V·瓦拉达恩;N·班纳吉;A·亚内夫斯基;N·迪米特罗娃 -专利权人：皇家飞利浦有限公司
申请日： 2013-11-15 - 公布日： 2015-08-12 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：通过临床研究与表型特征相关联的在诊断对象基因数据中观察到的研究基因变体的相关性依照下文进行评价。与所述研究基因变体在功能上相关的一组多态被识别。针对该组多态计算在所述诊断对象基因数据中观察到的变体的前景分布。针对该组多态计算在所述临床研究的对象的基因数据中观察到的变体的背景分布。计算比较所述前景分布和所述背景分布的比较度量。
使用具有患者特异性相关性评价变体疾病关联性诊断基因分析

[发明专利]多模态脑影像与基因数据的处理方法和装置-CN202210559404.9在审
发明人：杜磊;崔鼎男;郭雷;韩军伟 -专利权人：西北工业大学
申请日： 2022-05-23 - 公布日： 2022-10-11 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种多模态脑影像与基因数据的处理方法和装置。该方法包括：利用代谢通路来划分共表达基因集，综合多模态脑影像进行关联分析，具体来说，通过收集整理的数据，利用模型自动导出目标脑区与目标脑区的基因位点。通过本发明，解决了相关技术中基于原始基因数据和单一模态的脑影像数据进行关联分析，存在获取数据难度大、处理效果不佳的问题，达到了降低数据获取难度、提升预测结果的准确性的技术效果。
多模态脑影像基因数据处理方法装置

[发明专利]一种耐药基因数据平台的多维数据展示方法及系统-CN201710409822.9在审
发明人：李娟;陈霞;张雯;陈晨;卢金星;车洁;袁敏;王海印;于伟文;龚林;张利锋;于栓宝;赵晓菲 -专利权人：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
申请日： 2017-06-02 - 公布日： 2017-11-10 - 主分类号： G06F19/26 文献下载
摘要：本发明涉及微生物数据处理技术领域，提供一种耐药基因数据平台的多维数据展示方法及系统，接收用户在预先创建的耐药基因数据平台的首页显示界面上的输入动作，生成对应的操作指令，然后根据操作指令的类型执行平台多维数据展示、信息检索和生物信息分析动作，实现对有关耐药基因及相关信息的汇集和对学者用户的展示，同时为学者用户提供基于blast的基因序列的比对分析结果和耐药基因预测分析，也为初学者和中外学者提供便利的研究平台。
一种耐药基因数据平台多维展示方法系统

[发明专利]一种基因网络表达状态的二值化观测方法及系统-CN202310115699.5在审
发明人：高会军;杜奕辉;佟明斯;姜蒙 -专利权人：哈尔滨工业大学
申请日： 2023-02-15 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开一种基因网络表达状态的二值化观测方法及系统，涉及生命科学领域的细胞基因表达量测定技术领域，方法包括：根据基因字典和被测细胞的基因维度确定随机测量矩阵，进而确定随机测量矩阵对应的多组基因名称组；针对所述随机测量矩阵对应的每组基因名称组，采用T7分别定制正值引物和负值引物，并分别进行标记，得到对应的正值标记引物和负值标记引物；采用正值标记引物对正值基因名称小组对应的基因数据进行扩增，采用负值标记引物对负值基因名称小组对应的基因数据进行扩增，以得到综合基因扩增数据，对其进行标记观测得到基因观测数据；根据基因观测数据和基因字典计算被测细胞的基因表达量。本发明提高了基因表达量测量稳定性。
一种基因网络表达状态二值化观测方法系统

[发明专利]基于多层次并行的基因数据无损压缩方法及装置-CN202110632386.8有效
发明人：谭光明;李叶文;高睿昊;臧大伟;刘万奇;康宁 -专利权人：中科计算技术西部研究院
申请日： 2021-06-07 - 公布日： 2022-10-14 - 主分类号： G06F16/174 文献下载
摘要：本发明涉及数据压缩技术领域，具体涉及一种基于多层次并行的基因数据无损压缩方法及装置,所述方法包括以下步骤：S1、将输入的原始基因数据分割为N个数据字段；S2、将每个数据字段分割为M个数据块，并分别为每个数据字段分配M条相同的压缩流水线；S3、对每个数据块分别匹配一条压缩流水线，并进行压缩；S4、获取压缩流水线的第一并行度和第N个数据字段的第二并行度；S5、根据每个数据字段的第二并行度，分析最后完成压缩的数据字段；S6、在每个数据字段均完成压缩后，先对各数据字段中每个数据块的压缩结果进行合并，再对各数据字段的压缩结果进行合并，获得原始基因数据的压缩数据。本发明能够更加高性能、低成本的对基因数据进行压缩处理。
基于多层次并行基因数据无损压缩方法装置

[发明专利]基因型信息获取方法、育种方法、装置、设备和介质-CN202310237142.9在审
发明人：刘毓文;郑伟刚;马文龙;王超 -专利权人：中国农业科学院农业基因组研究所
申请日： 2023-03-02 - 公布日： 2023-06-13 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种基因型信息获取方法、育种方法、装置、设备和介质；其中基因型信息获取方法包括：获取目标物种的多个测序样本的基因数据；获取目标物种的模板参考基因组数据；将每个测序样本的基因数据与所述模板参考基因组数据进行比对，获取每个测序样本的样本基因组信息；获取目标物种的参考群体基因型信息；根据所述参考群体基因型信息对每个测序样本的样本基因组信息进行基因填充，得到对应的样本基因组已填充基因型信息；对所述参考群体基因型信息进行基因填充，得到参考群体填充基因型信息；根据所述参考群体填充基因型信息对每个测序样本的样本基因组已填充基因型信息进行基因填充，得到每个测序样本的目标基因型信息。
基因型信息获取方法育种装置设备介质

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