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[发明专利]基因序列的存储和还原方法、计算机存储介质及电子设备-CN202011641634.7有效
发明人：丘佳倩;阮好姬;李钟文;蓝田 -专利权人：云舟生物科技（广州）有限公司
申请日： 2020-12-31 - 公布日： 2022-01-11 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基因序列的存储和还原方法、计算机存储介质和电子设备，基因序列的存储和还原方法包括以下步骤：S1、上传基因序列，并设定还原密码；S2、将设定了所述还原密码的所述基因序列存储为图片格式的基因图片，并在存储过程中添加定位码；S3、上传所述基因图片，并从所述基因图片中查找所述定位码，以确定所述基因图片所记载的基因序列的起始位置及读取方向；S4、输入密码，并判断所述密码与所述还原密码是否匹配；S5、当所述密码与所述还原密码匹配时，将所述基因图片还原为所述基因序列。根据本发明实施例的基因序列的存储和还原方法，可以有效缩减基因图片在还原为基因序列时的试错时间，提高基因序列还原效率，提高用户体验。
基因序列存储还原方法计算机介质电子设备

[发明专利]一种培育高抗病毒转基因植物的方法与应用-CN03100708.2有效
发明人：朱祯;冯德江;郑翔 -专利权人：中国科学院遗传与发育生物学研究所
申请日： 2003-01-21 - 公布日： 2004-08-11 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：本发明公开了一种培育高抗病毒转基因植物的方法与应用，本发明的方法包括以下步骤：a.查阅宿主密码子的使用频率，确定稀有密码子，修饰目的基因中的密码子，把目的基因中某些密码子突变成宿主植物中的稀有同义密码子；b.构建含有密码子修饰目的基因的用于植物转化的载体；c.转化植物，获得再生转基因植株；d.检测转化植株，筛选目的基因发生基因沉默的转基因植株，获得高抗病毒转基因植株。利用本发明的方法可以培育高效稳定的抗病毒转基因植物。
一种培育抗病毒转基因植物方法应用

[发明专利]信息处理程序、信息处理方法以及信息处理装置-CN202080102744.8在审
发明人：片冈正弘;松村量;茂栉薰 -专利权人：富士通株式会社
申请日： 2020-07-08 - 公布日： 2023-04-18 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：信息处理装置获取作为特定的个人的基因组信息的被断开为多个的断开基因组数据。信息处理装置基于将密码子和代码建立对应的密码子变换表，生成将多个断开基因组数据分别以密码子为单位进行编码的多个断开密码子数据。信息处理装置基于将成为基准的基准基因组数据以密码子为单位进行编码的基准密码子数据、和多个断开密码子数据的每一个断开密码子数据，确定出现在多个断开密码子数据中的代码中的与出现在基准密码子数据中的代码不同的基因变异出现的位置和种类信息处理装置生成将基因变异和基因变异出现的位置及种类建立对应的基因变异转置索引。
信息处理程序方法以及装置

[发明专利]基因序列的处理方法、计算机存储介质及电子设备-CN202011637857.6有效
发明人：丘佳倩;阮好姬;李钟文;蓝田 -专利权人：云舟生物科技（广州）有限公司
申请日： 2020-12-31 - 公布日： 2021-11-30 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基因序列的处理方法、计算机存储介质和电子设备，基因序列的处理方法包括以下步骤：S1、上传基因序列，并设定还原密码；S2、将设定了所述还原密码的所述基因序列存储为图片格式的基因图片；S3、上传所述基因图片，输入密码，并判断所述密码与所述还原密码是否匹配；S4、当所述密码与所述还原密码匹配时，将所述基因图片还原为所述基因序列。根据本发明实施例的基因序列的处理方法，在对基因序列进行存储时，通过将其转换成图片格式进行存储，可以大幅减少数据存储占用的空间，提高基因序列传输的速度，并且在基因序列转换成图片的过程中，对其进行加密，可以有效提高信息安全性
基因序列处理方法计算机存储介质电子设备

[发明专利]设计、合成的符合大豆密码子用法的高甲硫氨酸蛋白基因-CN200410043869.0无效
发明人：朱延明;柏锡;李杰;侯爱菊;吴迪 -专利权人：东北农业大学
申请日： 2004-09-15 - 公布日： 2006-03-22 - 主分类号： C12N15/62 文献下载
摘要：本发明提供的是一种设计、合成的符合大豆密码子用法的高甲硫氨酸蛋白基因。它是依据大豆密码子用法和高表达优越密码子分析结果，在保留富含甲硫氨酸玉米醇溶蛋白基因编码氨基酸序列不变的情况下，使用大豆的高表达优越密码子和偏爱密码子替换富含甲硫氨酸玉米醇溶蛋白基因密码子，得到具有大豆密码子使用特点的高甲硫氨酸蛋白基因序列，命名为SCMRP基因；采用ABI3900高通量DNA合成仪合成SCMRP基因，基因合成产物克隆到质粒pUC18上，转化到大肠杆菌DH5α中保存所得到的基因。其编码的蛋白质中含硫氨基酸含量高达26.4％，其所采用的密码子符合大豆密码子用法。因此，该基因可以在大豆种子中高水平表达，显著提高大豆含硫氨基酸含量。
设计合成符合大豆密码子用法甲硫氨酸蛋白基因

[发明专利]一种牛全基因组密码对使用偏好性的检测方法-CN201210142809.9无效
发明人：刘小林;张慧林;赵胜 -专利权人：西北农林科技大学
申请日： 2012-05-10 - 公布日： 2012-09-26 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开一种牛基因组密码对使用偏好性的检测方法，包括以下步骤：计算牛全基因组CDS序列的3721种密码对的使用偏好性分值CPS；根据不同密码对的CPS值，分析牛基因组中单个序列的密码对使用偏好性CPB，某一序列的CPB值为该序列中所有密码对值的算数平均值；根据基因组上3721种密码对的CPS值，针对基因组中的每一个CDS序列，按照CDS序列上密码对的排列顺序，构建了一个密码对偏好性分布型；针对该生物基因组中的所有CDS序列的密码对偏好性分布型分别从序列的5’和3’末端联配，并计算联配结果中的每一个密码对位点上CPS值的平均值，得到了该生物所有CDS序列的全基因组平均密码对偏好性分布型。
种牛基因组密码使用偏好检测方法

[发明专利]一种利用基因技术寻找离散亲人的系统-CN201910627975.X有效
发明人：顾栗先;顾永才 -专利权人：顾永才
申请日： 2019-07-11 - 公布日： 2022-09-16 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：一种利用基因技术寻找离散亲人的系统，涉及寻找离散亲人的软件开发技术领域。本发明为了方便寻找者与被寻找者快速准确地对接上并相认。所述系统包括寻找者基因数据输入模块，寻找者基因数据输入模块需支付费用后才能进行输入操作；根据寻找者与被寻找者的不同情形，给出四个输入子模块，还包括用于输入基因密码进行搜索和基因数据进行搜索被寻找者基因数据输入模块，被寻找者基因数据匹配检索模块和双密码登陆模块，双密码登陆模块用于实现基因密码登陆或非基因密码登陆，被寻找者采用基因密码登陆寻找者的帐户，系统限制其在帐户中操作；采用非基因密码登陆寻找者帐户，系统不限制其在账户中操作
一种利用基因技术寻找离散亲人系统

[发明专利]密码子植物化改造的NmeCas9基因及其应用-CN201811535144.1有效
发明人：秦瑞英;魏鹏程;李娟;李浩;杨亚春;杨剑波 -专利权人：安徽省农业科学院水稻研究所
申请日： 2018-12-14 - 公布日： 2021-12-21 - 主分类号： C12N15/55 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术和植物基因工程技术领域，公开了密码子植物化改造的NmeCas9基因及其应用。所述密码子植物化改造的NmeCas9基因具有SEQ ID No：1所示的核苷酸序列。本发明提供的密码子植物化改造的NmeCas9基因是以模式作物水稻密码子为基础改造获得的，即在维持编码氨基酸序列不变的前提下，利用发明人从与水稻基因相关密码子中所筛选出的密码子替换原有密码子，得到植物化改造的NmeCas9基因，再经过化学合成而来。采用本发明的基因可以明显提高剪切效率。
密码子植物改造 nmecas9 基因及其应用

[发明专利]鉴别或辅助鉴别外源基因密码子优化的方法-CN201410655357.3在审
发明人：朱祯;周云;戴艳 -专利权人：中国科学院遗传与发育生物学研究所
申请日： 2014-11-17 - 公布日： 2016-06-15 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了鉴别或辅助鉴别外源基因密码子优化的方法。本发明所提供的鉴别或辅助鉴别外源蛋白基因是否为受体生物材料密码子优化基因的方法，包括：S1)将没有进行受体生物材料密码子优化的外源基因和待测外源基因分别转入受体生物材料中，分别得到对照转基因生物材料和待测外源基因转基因生物材料；S2)如果待测外源基因转基因生物材料中报告基因的表达量高于对照转基因生物材料中报告基因的表达量，待测外源基因为或候选为所述受体生物材料密码子优化基因；如果待测外源基因转基因生物材料中报告基因的表达量等于或低于对照转基因生物材料中报告基因的表达量，待测外源基因不为或候选不为受体生物材料密码子优化基因。
鉴别辅助基因密码子优化方法

[发明专利]密码子植物化改造的Plant Nme2Cas9基因及其应用-CN201910543766.7有效
发明人：许蓉芳;魏鹏程;李娟;秦瑞英;李浩;刘小双;徐善斌 -专利权人：安徽省农业科学院水稻研究所
申请日： 2019-06-21 - 公布日： 2022-07-22 - 主分类号： C12N15/55 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术和植物基因工程技术领域，公开了密码子植物化改造的Plant Nme2Cas9基因及其应用。所述密码子植物化改造的Plant Nme2Cas9基因具有SEQ ID No：1所示的核苷酸序列。本发明提供的密码子植物化改造的Plant Nme2Cas9基因是以模式作物水稻密码子为基础改造获得的，即在维持编码氨基酸序列不变的前提下，利用发明人从与水稻基因相关密码子中所筛选出的密码子替换原有密码子，得到植物化改造的Plant Nme2Cas9基因，再经过化学合成而来。采用本发明的基因可以明显提高剪切效率。
密码子植物改造 plant nme2cas9 基因及其应用

[发明专利]一种用于异源基因体外表达的密码子优化方法及应用-CN201910715705.4有效
发明人：徐盛春;郑元庭;徐飞;李素娟;邵健丰;王钢军;李琪恺 -专利权人：浙江省农业科学院
申请日： 2019-08-05 - 公布日： 2021-08-17 - 主分类号： G16B25/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于异源基因体外表达的密码子优化方法，该方法包括：获取宿主细胞全基因组的核苷酸序列和全蛋白组的氨基酸序列；以密码子对为统计对象，统计每个密码子对在宿主细胞全基因组中的权重；选定待优化蛋白，构建一个以密码子为节点、上下游密码子对间的权重值为线值的单向图模型；根据单向图模型，得到优化后基因的核苷酸序列。本发明利用宿主细胞的全基因组和全蛋白组作为序列库，以密码子对为统计对象，通过构建以密码子为节点、上下游密码子对间的权重值为线值的单向图模型，来获得最优的密码子组合顺序，得到具有最优化核苷酸序列的优化基因，该优化基因能够在体外高效表达，表达量显著提高。
一种用于基因体外表达密码子优化方法应用

[发明专利]一种密码子优化的重组人溶菌酶基因及其应用-CN201810257256.9有效
发明人：成功;昝林森;王力 -专利权人：西北农林科技大学
申请日： 2018-03-27 - 公布日： 2021-07-13 - 主分类号： C12N15/56 文献下载
摘要：本发明涉及一种密码子优化的重组人溶菌酶基因及其应用，该密码子优化的重组人溶菌酶基因是通过比较牛乳腺优势乳蛋白高频密码子和低频密码子对人溶菌酶密码子进行全局优化(Lyzop)和翻译起始后23位密码子进行优化优化后的密码子显著提高了人溶菌酶mRNA稳定性及在牛乳腺细胞中mRNA表达量。通过蛋白免疫印迹实验证明，密码子优化的重组人溶菌酶基因在牛乳腺细胞中表达量是野生型的2.18倍。为今后细胞生物反应器以及牛乳腺生物反应器高效生产重组人溶菌酶提供了工具基因。同时，将密码子优化的重组人溶菌酶基因与荧光素酶融合表达，通过分析荧光素酶表达量，实现密码子优化效果的快速、准确评价，为今后开展基因密码子优化提供了新的可靠评价方法。
一种密码子优化重组人溶菌酶基因及其应用

[发明专利]一种基于密码子对使用频度的基因密码子优化方法-CN201610838127.X有效
发明人：李阳 -专利权人：武汉伯远生物科技有限公司
申请日： 2016-09-21 - 公布日： 2019-04-05 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明提出了一种基于密码子对使用频度的基因密码子优化方法，本方案采用密码子对使用频度对目的基因进行优化，不光考虑单个密码子使用频度，同时考虑两个密码子联合使用情况，即：相邻密码子的关系，挑选物种中两个tRNA连用时频度较高的密码子对对目标基因进行优化起到关键作用。
一种基于密码子使用频度基因优化方法

[发明专利]大黄鱼清道夫受体家族基因的密码子偏好性分析方法-CN201811123784.1在审
发明人：刘慧慧;王君如;迟长凤;黄伟 -专利权人：浙江海洋大学
申请日： 2018-09-26 - 公布日： 2019-02-01 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：本发明公开了大黄鱼清道夫受体家族基因的密码子偏好性分析方法，包括，获得大黄鱼清道夫受体家族基因；利用密码子偏好性分析软件Codon W统计所有基因的第三位密码子频率和密码子第三位为G或C的频率，同时计算所述受体家族基因的偏好性指数，得出清道夫受体家族在进化中的密码子偏好性使用情况。本发明分析方法简单可行，可准确地判断大黄鱼清道夫受体家族基因的密码子偏好性，更好地帮助认识清道夫受体家族基因特征，在后续改造基因以及实现其高效表达中发挥重要作用。
清道夫受体密码子偏好性家族基因大黄鱼密码子频率分析软件改造基因高效表达受体家族分析基因偏好性码子进化统计帮助

[发明专利]基于碱基编辑系统突变起始密码子实现基因敲除的方法及应用-CN201910105331.4有效
发明人：马旭;李广磊;金孝华;王鑫杰 -专利权人：国家卫生健康委科学技术研究所
申请日： 2019-02-01 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：基于碱基编辑系统突变起始密码子实现基因敲除的方法及应用。该基因敲除方法基于精确的单碱基编辑技术，针对编码基因起始密码子ATG进行突变，使其不能正常发挥翻译起始功能，从而达到对靶基因的敲除目的。具体包括：选定位于待敲除基因翻译起始区20bp‑NGG或CCN‑20bp目标序列，使其包含完整的起始密码子ATG；利用sgRNA序列来将ABE或BE4定位到目标序列，使目标基因起始密码子ATG中的目标单碱基发生A到G、T到C或G到A突变，破坏起始密码子，以实现基因敲除。本发明的敲除方法更高效、更精确以及更少脱靶效应，实现对部分常规方法无法敲除基因的敲除。
基于碱基编辑系统突变起始密码子实现基因方法应用

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