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- [发明专利]一种gtf文件解析方法及工具-CN201910198991.1有效
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简洁;王智健;姜丽荣;孙子奎
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南京派森诺基因科技有限公司
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2019-03-15
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2023-07-25
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G16B50/00
- 本发明公开了一种gtf文件解析方法,其特征在于,包括如下步骤:初始化步骤,基因/转录本/基本结构读取步骤,基因/转录本分解步骤,基因/转录本/基本结构解析步骤。本发明还公开了一种gtf文件解析工具。本发明的有益效果在于:以基因或转录本为单位:本模块可以以基因或转录本为单位对gtf文件进行解析,将基因或转录本的子结构添加到解析结果的子节点中,使用者能对整个基因或转录本进行操作,更能满足生物信息分析的需求占用内存少:先读取完一个基因/转录本所有行再解析,处理完这个基因/转录本后相应的内存就会被释放,不需要占用很多内存空间。功能丰富:可根据基因/转录本ID或name进行查找,多条件筛选基因/转录本/基本结构,根据子结构获得基因所在位置,获得基因外显子覆盖长度等功能。
- 一种gtf文件解析方法工具
- [发明专利]数字转录装置-CN200580010173.0无效
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竹内吉和;天野克巳;张子青
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日本先锋公司
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2005-03-08
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2007-03-28
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G11B27/034
- 本发明提供了一种数字转录装置(1),该数字转录装置(1)用于按声音单位压缩音频数据以存储该音频数据。该数字转录装置(1)包括:音乐数据计数器(22),其用于在压缩音频数据时对音乐数据采样的数量进行计数,并且根据音乐数据TOC信息和计数的音乐数据采样的数量,从音乐数据中检测位于声音单位的尾部处的音乐数据流;数据存储单元(60),其用于存储检测到的音乐数据流;音乐数据比较器(30),其在音乐数据转录处理中途中断时使用,用于从音乐数据中检测与存储的音乐数据流相同的音乐数据流;以及控制器(80),其用于在跟随检测到的音乐数据流之后的音乐数据处继续音乐数据转录处理
- 数字转录装置
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