本发明提供老芒麦不同胁迫条件下荧光定量内参基因,所述内参基因为TBP2、ACT2和DNAJ,内参基因TBP2的核苷酸序列为序列表SEQ ID NO.1,内参基因ACT2的核苷酸序列为序列表SEQ ID NO.2,内参基因DNAJ的核苷酸序列为序列表SEQ ID NO.3。上述3个内参基因序列均来自老芒麦转录组序列,比其他物种上的通用内参基因具有更高的特异性和稳定性。同时这3个内参基因是筛选出的,是老芒麦在不同胁迫处理下最稳定的内参基因,数据真实可靠,可为后期深入挖掘老芒麦功能基因奠定基础。本发明不仅解决了现有老芒麦基因表达分析中没有内参基因的现状,也能提高检测效率和检测结果的可信度。
本发明公开了桂花花序不同发育时期荧光定量内参基因及应用,所述内参基因为OfACT和OfEF1α;其中,所述内参基因OfACT的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示,内参基因OfEF1α的核苷酸序列如序列表中本发明桂花花序不同发育时期荧光定量内参基因OfACT和OfEF1α基因是桂花不同发育时期花序中表达最稳定的两个内参基因,该两个基因表达的稳定性优于现有技术中的其他基因,作为荧光定量内参基因能为桂花不同发育时期花序中获得功能基因表达的精确定量数据提供有力支持
本发明提供老芒麦不同组织的荧光定量内参基因,为TBP2和PP2A,其核苷酸序列分别为序列表SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。上述2个内参基因序列均来自老芒麦转录组序列,比其他物种上的通用内参基因具有更高的特异性和稳定性。同时这2个内参基因是筛选出的,是老芒麦在不同组织中最稳定的内参基因,数据真实可靠,可为后期深入挖掘老芒麦功能基因奠定基础。本发明不仅解决了现有老芒麦基因表达分析中没有内参基因的现状,也能够提高检测效率和检测结果的可信度。本发明的2个内参基因均为新开发的基因,不仅丰富了植物内参基因的数量,还能为在其它小麦族和披碱草属植物上的相关研究提供参考。
本发明公开了一种用于检测与肺癌相关的SHOX2基因启动子甲基化程度的试剂盒,其中包含目的基因引物对和内参基因引物对;以及检测目的基因和内参基因的Taqman探针,和用作阻断作用的阻断剂。所述目的基因引物对包括序列如SEQ ID NO.1所示的目的基因正向引物和序列如SEQ ID NO.2所示的目的基因反向引物;所述内参基因引物对包括序列如SEQ ID NO.3所示的内参基因正向引物和序列如SEQ ID NO.4所示的内参基因反向引物。所述检测的目的基因Taqman探针如SEQ ID NO.5所示,内参基因Taqman探针如SEQ ID NO.6所示。阻断剂序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示。
一种暗黑鳃金龟内参基因,所述内参基因为延伸因子1α(EF1α)、核糖体蛋白S5(RPS5)和真核肽链释放因子3(eRF3);其中EF1α的核苷酸序列表如SEQ ID NO:1所示,RPS5的核苷酸序列表如SEQ ID NO:2所示,eRF3的核苷酸序列表如SEQ ID NO:3所示。本发明从多个候选内参基因中筛选出表达最稳定的暗黑鳃金龟内参基因,以及基于内参基因序列设计的实时荧光定量PCR引物,解决了现有暗黑鳃金龟荧光定量PCR实验中没有可靠内参基因的现状。筛选出的内参基因适用于分析功能基因在暗黑鳃金龟不同发育阶段或不同组织部位的表达水平,能够提高检测数据的可靠性、稳定性和重复性。
本发明涉及一种检测CALR基因突变的内参扩增引物组合物,其包括SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:6所示序列的引物;本发明还涉及一种含有上述内参扩增引物组合物的内参扩增体系及其试剂盒和检测方法,以及由上述内参扩增引物组合物扩增的CALR基因突变的靶序列,该靶序列为SEQ ID NO:7所示序列。本发明所述的内参扩增体系及其检测方法与CALR基因的突变体系配套使用,其既可以对突变型的CALR基因进行快速检测,也可以对野生型的CALR基因进行扩增,作为CALR突变检测试剂盒的内参质控体系,在质量控制的提升方面具有重要意义
本发明涉及“白背飞虱不同龄期稳定表达的内参基因、其筛选方法及应用”,属于生物技术领域。内参基因A1TU,其核苷酸序列如SEQ ID NO2所示。本发明根据NCBI已经公开发表的其它昆虫相关基因序列,设计简并引物,PCR获得白背飞虱6个常用内参基因部分核苷酸序列,经过克隆、测序以及与NCBI数据库Blast比对,确定为白背飞虱内参基因的部分序列;随后又基于此序列设计特异性的定量引物,建立基于SYBR Green I染料技术的RT‑qPCR方法,利用荧光定量PCR技术筛选出了白背飞虱不同龄期最稳定的内参基因A1TU,从而为今后研究不同龄期基因表达水平以及白背飞虱的基因功能方面建立坚实的基础
本发明涉及“白背飞虱不同组织部位稳定表达的内参基因、其筛选方法及应用”,属于生物技术领域。内参基因RPL9,其核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示。本发明根据NCBI公开发表的其它昆虫相关基因序列,设计简并引物,PCR获得白背飞虱6个常用内参基因部分核苷酸序列,经过克隆、测序以及与NCBI数据库Blast比对,确定为白背飞虱内参基因的部分序列;随后又基于此序列设计特异性的定量引物,建立基于SYBR Green I染料技术RT‑qPCR方法,利用荧光定量PCR技术筛选出了白背飞虱不同组织部位稳定表达的内参基因RPL9,为今后研究不同组织部位基因表达水平以及白背飞虱的基因功能方面建立坚实的基础
本发明公开了甘薯不同组织部位中稳定表达内参基因及引物和应用,所述内参基因为IbTUA;其中,所述内参基因IbTUA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示。本发明中甘薯稳定表达的内参基因IbTUA是在不同类型甘薯的不同组织部位最稳定的内参基因,该基因表达的稳定性优于现有技术中的其他基因,作为荧光定量内参基因能为甘薯获得功能基因表达的精确定量数据提供有力支持