本发明公开了一种柱花草多聚半乳糖醛酸酶基因SgPG1及其应用。本发明提供的多聚半乳糖醛酸酶基因SgPG1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,多聚半乳糖醛酸酶SgPG1的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明表明,通过转基因柱花草毛根表达体系,证明SgPG1基因的表达能够促进柱花草根尖类边缘细胞的形成,同时证明了该基因的作用机制是通过降解低甲酯化的同型半乳糖醛酸,从而提高了细胞壁中高甲酯化的同型半乳糖醛酸比例,表明SgPG1基因具有选择性降解细胞壁低甲酯果胶从而改变细胞壁组分的功能,从而提高了植物根系对铝毒的耐受。