[发明专利]一种基于数字微滴PCR无创产前胎儿染色体非整倍体筛查方法在审

专利信息
申请号: 201910440068.4 申请日: 2019-05-24
公开(公告)号: CN110106235A 公开(公告)日: 2019-08-09
发明(设计)人: 陈谦;刘弘扬;刘泓;贾海雪 申请(专利权)人: 苏州索真生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851
代理公司: 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 代理人: 陈娟
地址: 215163 江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于数字微滴PCR无创产前胎儿染色体非整倍体筛查方法,包括以下步骤:采集孕妇血浆样本并分离出游离DNA;用去离子水洗脱游离DNA,形成待测染色体;将正常女性基因组DNA剪切成200bp的片段DNA,形成参照染色体;对待测染色体及参照染色体进行定量标记,形成靶标区域;在靶标区域内选择目标序列设计引物和探针;选择具有相同探针的引物对目标序列中潜在的二级结构进行筛选,形成靶向区域;通过PCR反应体系对靶向区域进行PCR扩增和结果定量分析;确定靶向区域中DNA分子的拷贝数;判断孕妇血浆样本中胎儿是否存在非整倍体染色体。有益效果:在保证准确率的同时,降低设备门槛。
搜索关键词: 染色体 非整倍体 胎儿染色体 靶向区域 孕妇血浆 游离DNA 靶标 筛查 探针 微滴 无创 样本 序列设计引物 基因组DNA 定量分析 定量标记 二级结构 降低设备 目标序列 选择目标 正常女性 剪切 拷贝数 潜在的 水洗脱 准确率 对靶 引物 胎儿 离子 采集 门槛 筛选 保证
【主权项】:
1.一种基于数字微滴PCR无创产前胎儿染色体非整倍体筛查方法,其特征在于,包括以下步骤:采集孕妇血浆样本,并从中分离出游离DNA;采用预先准备好的去离子水洗脱所述游离DNA,形成待测染色体,并放置在‑80℃下保存备用;将预先制备的正常女性基因组DNA剪切成200bp的片段DNA,形成参照染色体;使用荧光计对所述待测染色体及所述参照染色体进行定量标记,形成靶标区域;在所述靶标区域内选择目标序列设计引物和探针;选择具有相同探针的引物对所述目标序列中潜在的二级结构进行筛选,形成靶向区域;通过预先配置的PCR反应体系对靶向区域进行微滴式数字PCR扩增和结果定量分析;读取并分析每滴液滴中FAM和VIC荧光强度,确定所述靶向区域中DNA分子的拷贝数;根据所述靶向区域中DNA分子的拷贝数,判断孕妇血浆样本中胎儿是否存在非整倍体染色体。
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  • 2012-09-14 - 2019-08-13 - C12Q1/6851
  • 相互作用并标记的多核苷酸探针和反义探针和/或互补的靶探针,为我们提供了用于扩增或检测核酸的组合物及方法。这些组分的竞争性热力相互作用导致显示靶频率的信号变化,并且可以提供促成单碱基识别错误的检查功能。这些探针、反探针组合物能进行实时荧光定量PCR检测,终点检测和微生物的微阵列检测,耐药突变和癌症相关的变异。一些探针、反义探针在两个引物之间作为内部探针,一些作为引物探针。采用两个探针:反义探针系统检测同一模板的不同方面,以辨别或量化一些靶序列。还提供了增强靶扩增和检测特定单碱基变异的系统。探针也可通过引入一个碱基不匹配以增加相差一个碱基的正确与不正确的靶的热力学识别力而修饰。
  • 一种胞外囊泡/外泌体的数字PCR检测方法-201910228223.6
  • 田庆常;谢恬 - 杭州师范大学
  • 2019-03-25 - 2019-08-09 - C12Q1/6851
  • 一种胞外囊泡/外泌体的数字PCR检测方法,属于生物技术及医学检测技术领域。其特征在于包含如下操作步骤:1)将胞外囊泡/外泌体与微球孵育结合;2)将结合后的胞外囊泡/外泌体进行数字核酸扩增检测,定量。相对于现有技术,本发明具有如下有益效果:1.可以实现胞外囊泡/外泌体的精确绝对定量;2.实现本发明所需的原料简便易得,操作简单,对设备无特殊要求,成本低廉;3.适用范围广,可以同时提供特异性和非特异性两种定量方式。
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