[发明专利]羊源多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线的建立在审
申请号: | 201910152361.0 | 申请日: | 2019-02-28 |
公开(公告)号: | CN109797206A | 公开(公告)日: | 2019-05-24 |
发明(设计)人: | 王凤阳;黄海峰;杜丽 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12N15/70 |
代理公司: | 西安弘理专利事务所 61214 | 代理人: | 宁文涛 |
地址: | 570228 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | 本发明公开了一种羊源多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线的建立,参考GenBank中公布的Pasteurella multocida基因组中toxA毒素基因,利用信息分析软件获取保守序列cstoxA,通过PCR、构建阳性标准品重组质粒pMD‑19T‑cstoxA、优化荧光定量PCR反应体系,建立羊源多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线,得到特异性高、重复性好、敏感性强的多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线,能够为菌株的定型起到方便、快捷、准确等效果,与传统实验室PCR操作相比,不仅能提高特异性又能减少实验耗材等经费开支。 | ||
搜索关键词: | 多杀性巴氏杆菌 荧光定量PCR 标准曲线 荧光定量PCR反应 信息分析软件 阳性标准品 保守序列 毒素基因 经费开支 重组质粒 基因组 构建 耗材 菌株 定型 参考 优化 | ||
【主权项】:
1.羊源多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线的建立,其特征在于,包括以下步骤具体实施:步骤1,阳性标准品重组质粒pMD‑19T‑cstoxA的制备:获取保守序列cstoxA,经PCR扩增得到特异性片段,根据pMD‑19T试剂盒说明书,优化构建体系进行连接,将连接体系转化至E.coli DH5α感受态细胞中,得到阳性标准品重组质粒pMD‑19T‑cstoxA,即经蓝白斑筛选出阳性菌落并测序验证;步骤2,荧光定量PCR反应条件的优化:将步骤1中鉴定正确的重组质粒pMD‑19T‑cstoxA标准品作为模板,进行SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR反应,依次以最佳引物浓度、最佳引物量、最佳模板量、最佳退火温度和最佳循环次数进行反应体系的优化;步骤3,羊源多杀性巴氏杆菌荧光定量PCR标准曲线的建立:对步骤2中重组质粒pMD‑19T‑cstoxA进行浓度测定,计算重组质粒pMD‑19T‑cstoxA的拷贝数,并进行10梯度稀释,以步骤2中构建的优化方法行荧光定量PCR,每组重复3次,反应结束后,以Ct值作为纵坐标、核苷酸拷贝数为横坐标,绘制标准曲线;步骤4,通过特异性实验、敏感性实验和重复性实验验证步骤3中的标准曲线。
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