[发明专利]乙型肝炎病毒CCCDNA的定量测量

摘要

乙型肝炎病毒(HBV)感染导致病毒基因组DNA进入宿主肝脏细胞中。该病毒松弛环状DNA(rcDNA)被转运到细胞核中并转化为共价闭合环状DNA(cccDNA)，所述共价闭合环状DNA作为病毒转录的模板。需要消除cccDNA来治愈HBV感染，这仍然是一个主要的治疗挑战。测量本文所述的cccDNA的稳健且灵敏的方法对于促进药物开发和监测疗法功效是有用的。设计一组引物与病毒DNA的亚硫酸氢钠处理组合，允许cccDNA的特异性扩增而不干扰rcDNA的扩增。该方法可用于进一步指导治疗发展，并提供一种监测经历抗病毒治疗的HBV感染患者的非侵入性的替代方法。

主权项

1.用于检测或定量DNA样品中的闭合共价环状DNA(cccDNA)的方法，所述DNA样品含有cccDNA和与所述cccDNA具有基本上相同的DNA序列且与所述cccDNA呈不同形式的非cccDNA，所述方法包括：i)处理DNA样品以消除经处理的DNA样品中的双链DNA分子的互补特征并从而防止双链DNA分子的两条链复性；和ii)对所述经处理的DNA样品进行扩增测定，使得所述cccDNA能产生扩增的产物，但非cccDNA不能产生扩增的产物。