[发明专利]利用DNA折纸结构构建级联反应的方法在审

专利信息
申请号: 201711087044.2 申请日: 2017-11-07
公开(公告)号: CN107881211A 公开(公告)日: 2018-04-06
发明(设计)人: 何丹农;徐艳;陈玮嘉;王萍;金彩虹 申请(专利权)人: 上海纳米技术及应用国家工程研究中心有限公司
主分类号: C12Q1/28 分类号: C12Q1/28;C12Q1/26;C12Q1/00
代理公司: 上海东亚专利商标代理有限公司31208 代理人: 董梅
地址: 200241 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提出一种利用DNA折纸结构构建级联酶的体系,包括级联酶分别与DNA组装、两种管状DNA折纸形成、级联酶分别与两种DNA折纸组装和带有级联酶的两种DNA折纸组装,实现酶间距的精准调节。将级联酶分别与两种不同位点延伸的管状DNA折纸连接,随后管状DNA折纸进一步杂交,从而拉近两酶之间的距离,达到调控酶间距的目的。利用折纸的可寻址的优点,精确调控级联酶的间距。将两种酶分别组装在两个DNA折纸上,利用折纸延伸链的杂交将两个酶有序级联,提高级联的效率。
搜索关键词: 利用 dna 折纸 结构 构建 级联 反应 方法
【主权项】:
一种利用DNA折纸构建级联反应的方法,其特征在于,将级联酶分别与两种不同位点设计的管状DNA折纸连接,随后管状DNA折纸进一步杂交,包括下述步骤:(1)级联酶分别与DNA组装:将级联酶分别与连接剂3‑(2‑吡啶二巯基)丙酸N‑羟基琥珀酰亚胺酯(SPDP)以一定比例混合25℃孵育2hr后,超滤洗去过量的SPDP,随后SPDP修饰的两种酶的分别与巯基修饰的DNA 1、DNA2以一定比例均匀25℃孵育过夜,后采用超滤洗去过量的DNA,得到酶与DNA 的复合物Ⅰ和复合物Ⅱ;(2)两种管状DNA折纸形成:将替换链DNA分别与原有DNA订书钉链以等量的比例混合均匀,所得混合物随后以一定比例与所述的长链单链DNA在1×TAE‑Mg2+溶液体系中通过PCR退火,形成DNA折纸结构,形成的折纸结构采用超滤洗去过量订书钉链,分别得到折纸Ⅰ和折纸Ⅱ;(3)级联酶分别与两种DNA折纸组装:两种级联酶‑DNA复合物Ⅰ和复合物Ⅱ分别与两种管状DNA折纸Ⅰ和折纸Ⅱ以一定比例混合均匀,于45 ℃退火组装,分别得到级联酶‑折纸复合物Ⅲ和复合物Ⅳ,通过琼脂糖凝胶电泳分离除去未连接的酶与折纸,得到包含复合物Ⅲ和复合物Ⅳ的条带,采用过滤柱纯化回收级联酶‑折纸复合物Ⅲ和复合物Ⅳ;(4)带有级联酶的两种DNA折纸组装:将级联酶‑折纸复合物Ⅲ和复合物Ⅳ以一定比例混合均匀,于37℃退火组装,得到级联酶‑折纸终产物复合物Ⅴ。
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