[发明专利]在微生物中利用基因组中结构变化对抗微生物药物的基因抗性预测有效
| 申请号： | 201680044780.7 | 申请日： | 2016-08-05 |
| 公开（公告）号： | CN108271392B | 公开（公告）日： | 2023-01-10 |
| 发明（设计）人： | 安德烈亚斯·凯勒;苏珊娜·施默尔克;科德·弗里德里希·施塔勒;克里斯蒂娜·巴克斯;瓦伦蒂娜·加拉塔 | 申请（专利权）人： | 阿瑞斯遗传股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B20/20;G16B15/00;G16B40/00;G16B30/10;G16B30/20;G16B30/00;C12Q1/6883;C12Q1/689;C12Q1/6858;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人： | 王达佐;洪欣 |
| 地址： | 奥地利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明涉及确定患者感染对抗微生物药物治疗可能具有抗性的至少一种微生物尤其是细菌微生物的方法，选择对感染了至少一种微生物尤其是细菌微生物的患者的治疗的方法，以及确定包含至少一种基因的微生物尤其是细菌微生物的基因组结构变化的方法，以及用于这些方法的计算机程序产品。 | ||
| 搜索关键词： | 微生物 利用 基因组 结构 变化 对抗 药物 基因 抗性 预测 | ||
【主权项】：
1.确定微生物尤其是细菌微生物的基因组中的结构变异的方法，所述结构变异包括基因组中包含多于一个碱基的至少一处变化，所述方法包括：获得或提供所述微生物的多种临床分离株的基因序列的第一数据集，其中任选地组装所述第一数据集的基因序列的至少一部分；和/或获得或提供所述微生物的多种临床分离株的基因序列的第一数据集，并将所述第一数据集的所述基因序列与至少一个，优选一个参考序列进行比对；分析所述第一数据集的基因序列的所述基因组的结构变异以获得结构变体的第三数据集，所述结构变异包括基因组中包含多于一个碱基的至少一处变化；提供所述微生物的多种临床分离株的抗微生物药物如抗生素的抗性和/或敏感性的第二数据集；将所述第三数据集与所述第二数据集关联，并对所述关联进行统计学分析；以及确定所述微生物的基因组中与抗微生物药物如抗生素的抗性相关的的结构变异。
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