[发明专利]筛选基因编辑产物的方法有效
申请号: | 201610695151.2 | 申请日: | 2016-08-19 |
公开(公告)号: | CN106319045B | 公开(公告)日: | 2020-01-31 |
发明(设计)人: | 王克剑;华宇峰;王春 | 申请(专利权)人: | 中国水稻研究所 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
代理公司: | 33212 杭州中成专利事务所有限公司 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 310006 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种ACT‑PCR筛选基因编辑产物的方法,包括如下步骤:1)、提取野生型及待测样品的基因组DNA;2)、设计引物:使正向引物FA的3’末端跨过基因编辑拟切割位点;反向引物RA是以目标基因的基因组序列为参照,位于互补链的下游,反向引物RA的Tm值不低于正向引物FA;3)、获得最大临界退火温度T | ||
搜索关键词: | 退火 基因组DNA 反向引物 正向引物 野生型 扩增 条带 琼脂糖凝胶电泳 纯合突变体 杂合突变体 待测样品 基因组序 扩增产物 目标基因 切割位点 设计引物 互补链 基因 引物 跨过 | ||
【主权项】:
1.ACT-PCR筛选基因编辑产物的方法,其特征是包括如下步骤:/n1)、提取野生型及待测样品的基因组DNA,以获得PCR模板;/n2)、设计引物:/n以目标基因的基因组序列为参照,设计ACT-PCR正向引物FA,使正向引物FA的3’末端跨过基因编辑拟切割位点;反向引物RA是以目标基因的基因组序列为参照,位于互补链的下游,反向引物RA的Tm值不低于正向引物FA;/n正向引物FA的3’末端跨过基因编辑拟切割位点为2~6bp;/n正向引物FA的长度为20bp;/n3)、利用步骤2)的引物对FA/RA以野生型基因组DNA为模板进行温度梯度PCR扩增;将所得的扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳进行分离;/n能够扩增出目的条带所对应的最高温度为最大临界退火温度T
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