[发明专利]茄子EST-SSR标记的开发及应用方法

摘要

一种茄子EST-SSR标记的开发及应用方法，步骤为：1）从NCBI数据库中获得EST序列，进行处理并检测SSR；2）设计SSR标记的引物序列；3）获取表1编号1-48的茄子材料和茄子F2群体的植株嫩绿叶片，提取总DNA；4）用设计的SSR标记引物序列扩增表1编号1-12的茄子材料；5）获得表1编号7-12的茄子材料中有差异的EST-SSR标记，其序列如序列表；6）用所获EST-SSR标记扩增表1编号13-48的茄子材料和F2群体；7）计算每对引物的多态性信息含量并对表1编号13-48的茄子材料进行遗传多样性聚类分析；8）对步骤6）所获F2群体扩增标记进行连锁作图和QTL定位。结果表明：G249引物与茄子果实长度及果型性状连锁，分别解释表型变异的4%和5.1%；G192引物与茄子花萼果实大小性状连锁，解释表型变异的5.3%。

主权项

一种茄子EST‑SSR标记的开发及应用方法，其特征在于，具体按照以下步骤完成：1）从NCBI数据库中获得EST序列，对所获得的EST序列进行处理并检测该EST序列中的SSR；2）设计SSR标记的引物序列；3）从田间获取如表1所示的编号1‑48的茄子材料和茄子F2群体的植株的嫩绿叶片，提取其总DNA；4）用步骤2）所设计的SSR标记的引物序列扩增步骤3）中表1所示的编号1‑12的茄子材料；5）获得在步骤3）中表1所示的编号7‑12的茄子材料中有差异的EST‑SSR标记，其序列如序列表所示；6）用步骤5）所获得的EST‑SSR标记扩增步骤3）中表1所示的编号13‑48的茄子材料和F2群体；7）计算每对引物的多态性信息含量并对步骤3）中表1所示的编号13‑48的茄子材料进行遗传多样性的聚类分析；8）对步骤6）所获得的F2群体扩增的标记进行连锁作图和茄子果实性状的QTL定位。