本发明是用αD珠蛋白基因作为鸡的高载氧能力的分子标记及其检测方法与应用,属于鸡遗传标记辅助选择技术领域。本发明所提供的分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示,在该序列第251bp处有1个A/C的碱基突变,记为A251C,导致BSEG I-RFLP多态性。扩增所述分子标记的引物的序列如SEQ ID No:2和SEQ ID No:3所示。检测该分子标记的方法包括待测样品的鸡基因组DNA的提取及其PCR扩增,PCR产物的限制性内切酶BSEGI的酶切,当待测鸡个体基因型为CC型(478bp+35bp),则为高载氧能力个体。本发明为培育既适应高原低氧又高产优质的藏优杂交鸡提供了有效的分子标记。