本发明公开了一种藏药小檗皮的检测引物、检测试剂盒及检测方法,具体涉及分子生物学技术领域。一种藏药小檗皮的检测引物的正向内引物的碱基序列如SEQ ID No.1所示;反向内引物的碱基序列如SEQ ID No.2所示。所述藏药小檗皮的检测试剂盒包括超快速核酸扩增和荧光可视化分析。本发明提供的试剂盒和方法,可以准确、有效的鉴别小檗皮的4种主流品种匙叶小檗、鲜黄小檗、甘肃小檗和刺红珠与常见的混淆品黄柏,还可以检测成药中是否含有小檗皮,采用快速核酸扩增技术和荧光可视化技术,操作简单,扩增和检测时间短,30分钟即可完成扩增和检测过程,高效快速且准确,为小檗皮主流品种和成药的检测提供可靠依据。