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[发明专利]一种用于降低二代测序系统错误的系统-CN202311207718.3在审
发明人：张怡然;陈慧娟;王冰;段小红;郝艳同;蔡丽丽;周启明 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-09-19 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明涉及医学分子生物学技术领域，特别涉及一一种用于降低二代测序系统错误的系统，本发明所提供的一一种用于降低二代测序系统错误的系统，利用生物信息学方法生成针对不同panel的易发生嵌合区域的黑名单，并设置过滤原则，仅将位于嵌合区域的突变进行过滤，捞回不处于嵌合区域的突变，提高检测的灵敏度和准确度。
一种用于降低二代系统错误

[发明专利]用于血液SEPTIN9基因甲基化检测的方法和试剂盒-CN202111620152.8有效
发明人：杨春燕;张怡然;廖蕊;宋莹莹;王冰;段小红 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2021-12-23 - 公布日： 2023-09-12 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及体外诊断技术领域，具体涉及用于血液SEPTIN9基因甲基化检测的方法和试剂盒，该试剂盒中包括用于检测血浆中SEPTIN9基因甲基化程度的引物、探针组合，本检测方法基于Tet1酶及吡啶硼烷特异性将血浆中的ctDNA上甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，而不影响未甲基化的胞嘧啶。通过多重荧光PCR方法检测SEPTIN9基因甲基化程度，可用于结直肠癌和肝癌的早期筛查、诊断，具有较好的灵敏度和准确度。
用于血液 septin9 基因甲基化检测方法试剂盒

[发明专利]基于低深度WGS测序末端特征的癌症早期预测方法-CN202310029968.6有效
发明人：万千惠;张轶群;李振聪;张怡然;裴志华;王东亮;牛孝亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-01-09 - 公布日： 2023-05-30 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：本发明涉及医学分子生物学技术领域，特别涉及基于低深度WGS测序末端特征的癌症早期预测方法，通过采集健康人群与肿瘤人群样本，同时提取和统计样本cfDNA片段末端特征及break‑point末端特征，全面地考虑了不同长度和不同位置的片段末端特征，并利用优化的Mscore算法，更简便区分健康人组和癌症病人组，且在不同数据量的情况下仍能保持高稳定性。
基于深度 wgs 末端特征癌症早期预测方法

[发明专利]基于Alu重复原件的肠癌早期筛查检测引物、检测方法和试剂盒-CN202210945675.8在审
发明人：张腾龙;王冬冬;商宇红;马云;周启明 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-08-08 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及分子生物技术领域，特别涉及基于Alu重复原件的肠癌早期筛查检测引物、检测方法和试剂盒，包括与循环肿瘤相关的Alu‑LFR引物和Alu‑SFR引物。与现有技术相比，本发明选取Alu重复原件作为肿瘤早期筛查，诊断，预后的新型标志物，由于循环肿瘤DNA是肿瘤体细胞DNA脱落或肿瘤细胞凋亡后释放进入循环系统，不依赖于cfDNA浓度的标志物，与肿瘤细胞凋亡相关，其特定的来源使得ctDNA相较于其他蛋白标志物检测准确性更高，且能够反应肿瘤的情况，因此相较于cfDNA浓度更具有早期诊断意义，可作为一种肠癌早期筛查手段为临床提供一定辅助诊断信息。
基于 alu 重复原件肠癌早期检测引物方法试剂盒

[发明专利]基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法-CN202211717385.4有效
发明人：李振聪;张轶群;万千惠;张怡然;裴志华;王东亮;牛孝亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-12-30 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及癌症筛查技术领域，尤其是指基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法，包括以下步骤：S1，对样本进行测序获得下机数据进行拆分得到单个样本的测序数据，转换成FASTQ文件；S2，对FASTQ文件进行获得矫正的BAM文件；S3，从GTRD数据库中筛选得到可信转录因子，在每个转录因子结合位点计算上下游1000BP每个位置的深度，并取平均值；S4，上下游1000BP深度按照Savitzky‑Golay拆分成高频和低频信号，计算得TFscore；S5，筛选转录因子；S6，计算待测样本每个转录因子Zscore，最终取‑ΣlogPvalue作为该样本的指标。本发明中转录因子的选择不仅基于数据库，还使用自建队进行列筛；计算TFscore用的转录因子的选择，使方法具备鲁棒性,各批次样本中具有稳定性。
基于转录因子癌症早期诊断方法

[发明专利]基于染色体不稳定性的癌症早期筛查诊断方法-CN202310023027.1在审
发明人：李振聪;段小红;万千惠;张怡然;裴志华;王东亮;牛孝亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-01-06 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及医学分子生物学技术领域，特别涉及基于染色体不稳定性的癌症早期筛查诊断方法，包括对样品进行基因靶向测序，获取原始fastq文件、对原始fastq文件进行数据控制比对参考基因组获得bam文件、建立黑名单区域、基于该黑名单区域，在染色体半臂水平上计算染色体不稳定值TAZscore。将染色体不稳定作为用于早期癌症预测，首次提出TAZscore算法，通过数据优化采用两个染色体臂来计算最终性能指标，在需要在控制测序成本的情况下，最大限度区分健康人以及癌症患者，具有良好的灵敏性和特异性。
基于染色体不稳定性癌症早期诊断方法

[发明专利]多癌种WGS的肿瘤早期筛查方法-CN202310030788.X在审
发明人：裴志华;段小红;张怡然;李振聪;万千惠;王东亮;牛孝亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-01-09 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明涉及医学分子生物学技术领域，特别涉及多癌种WGS的肿瘤早期筛查方法，利用健康人和肿瘤患者中fragment长度的差异区分健康人和肿瘤患者，在肠癌、胃癌、肝癌、肺癌、胰腺癌等癌种中的AUC效果均在0.9以上，可以用于多癌种早期筛查。
多癌种 wgs 肿瘤早期方法

[发明专利]一种高效的外泌体分离纯化方法-CN202110695490.1有效
发明人：张怡然;顾丽清;段小红;陈玉洁;王丽芬;周启明 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2021-06-23 - 公布日： 2021-10-08 - 主分类号： C12N5/071 文献下载
摘要：本发明涉及分子生物技术领域，特别涉及一种高效的外泌体分离纯化方法，包括分离血浆，加入阳离子聚合物孵育；滤膜截留与阳离子聚合物结合的外泌体并漂洗外泌体；离液剂洗脱外泌体；加入磁珠吸附并富集外泌体；洗脱获得外泌体浓缩液。与现有技术相比，本发明不借助大型离心设备，采用阳离子聚合物对外泌体进行包覆后，采用离液剂解除阳离子聚合物与外泌体作用，通过简单的过滤，实现外泌体回收，然后通过磁性吸附剂对回收的外泌体进行浓缩，纯化。本发明有效缩短分离时间、提高外泌体回收效率、提高处理样本通量、提升外泌体分离纯度、降低外泌体分离所需试剂及耗材成本，分离得到的高纯度外泌体可用于核酸提取Westernblot、粒径分析、电镜检测等实验。
一种高效外泌体分离纯化方法

[发明专利]用于肝癌早期筛查的生物标志物组合、检测方法和试剂盒-CN202110730746.8有效
发明人：段小红;张怡然;王冰;杨春燕;马宇;王东亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2021-06-29 - 公布日： 2021-10-01 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明涉及分子生物技术领域，特别涉及用于肝癌早期筛查的生物标志物组合、检测方法和试剂盒，包括与乙肝阳性人群肝癌早期甲基化位点相关的8对靶标特异引物及对应的内参引物、特异性引物探针。与现有技术相比，本发明通过筛选中国乙肝阳性人群肝癌早期基因组超甲基化区域，并与白细胞基因组对应区域进行比对，选取8个可用于判别早期肝癌风险的引物及对应探针序列；利用甲基化敏感内切酶不能切割甲基化位点的特性，降解非肿瘤来源cfDNA，特异扩增肿瘤来源ctDNA极大提升检查灵敏度；不使用重亚硫酸盐转化，避免了cfDNA体外降解，检测灵敏度高，检测周期短、成本低、易于推广。
用于肝癌早期生物标志组合检测方法试剂盒

[发明专利]一种分子标志物肿瘤缺失突变负荷的检测方法-CN202010971654.4有效
发明人：孙大伟;辛琳;承康平;蔡丽丽;段小红;梁占超;王东亮 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-09-16 - 公布日： 2021-06-08 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及生物医学技术领域，特别涉及一种分子标志物肿瘤缺失突变负荷的检测方法；包括以下步骤：S1：采集肿瘤患者的样本；S2：利用探针捕获或者扩增子技术进行针对人类基因组目标区域的富集；S3：对人基因组中与肿瘤发生发展相关的特定目标基因区域进行测序；S4：针对所有捕获区域，使用生物信息算法，经过样本数据质控、低质量数据过滤、比对参考基因组、变异检测、变异过滤以及变异注释后，获得TDB数值。本发明提供了一种全新的TDB的计算机算法，其中TDB与微卫星不稳定性（Microsatellite Instability，MSI）金标准的检测结果一致性显著高于TMB与MSI检测结果的一致性，可以更好地预测免疫治疗疗效。
一种分子标志肿瘤缺失突变负荷检测方法

[实用新型]一种用于基因测序的自动上样装置-CN202020955088.3有效
发明人：段小红;张腾龙;杨春燕;承康平;辛琳;梁占超 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-05-30 - 公布日： 2021-04-09 - 主分类号： C12M1/36 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种用于基因测序的自动上样装置，包括测序装置主体、放试管门、显示器和支脚，测序装置主体的内部顶部固定连接有试管架，测序装置主体的正前方表面固定连接有挡盖，挡盖的底部活动连接有放试管门，放试管门的表面底部固定连接有把手，试管架的内侧固定连接有试管，试管的底部固定连接有摄像头，摄像头的底部固定连接有分析器，分析器可以自动将患者的名字和样品相匹配，体现了该装置的实用性，伸缩杆可以更好的使测序装置主体自动化，体现了该装置的自动性，带齿皮带可以更好的让伸缩杆上下移动，体现了该装置的连动性，条形码可以让测序装置主体更快的分析的更快，体现了该装置的分析性，在未来具有广泛的发展前景。
一种用于基因自动装置

[发明专利]一种新型分子捕获优化探针及其文库构建方法-CN202011458082.6在审
发明人：张腾龙;杨春燕;杨文娟;李旋;张亮;周启明 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-12-10 - 公布日： 2021-03-09 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及分子检测技术领域，尤其是指一种新型分子捕获优化探针及其文库构建方法，一种新型分子捕获优化探针，由以下部分组成：靶区域互补序列探针A‑单分子标记序列A‑正向引物识别序列A‑连接序列‑反向引物识别序列B‑单分子标记序列B‑靶区域互补序列探针B；一种新型分子捕获优化探针的文库构建方法：包括以下步骤：S1，合成新型分子捕获优化探针；S2，形成环状结构；S3，加入4种游离的核苷酸，形成完整的环化探针；S4，加入链霉亲和素磁珠；S5，用PCR扩增直接产生靶向区域的测序文库。本发明操作简单，具有高特异性，有效节约成本，节省时间，对DNA样品的完整度要求不严格，所需DNA样品少、花费低，还能有效较少引物二聚体。
一种新型分子捕获优化探针及其文库构建方法

[实用新型]一种具有托盘位姿调整机构的微孔板离心机-CN202020955101.5有效
发明人：张腾龙;段小红;杨春燕;承康平;辛琳;梁占超 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-05-30 - 公布日： 2021-02-05 - 主分类号： B04B7/00 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种具有托盘位姿调整机构的微孔板离心机，包括离心机主体、底板和离心机外壳，离心机主体的底部固定连接有底板，底板的底部嵌入连接有支撑柱，底板的顶端紧密贴合有防震垫，离心机主体的表面固定连接有离心机外壳，离心机外壳的表面嵌入连接有防震套，离心机主体的内部固定连接有装机腔，装机腔很好的体现了微孔板离心机的灵活性，固定螺母很好的体现了微孔板离心机的稳定性，以避免发生安全隐患，球头柱塞很好的体现了微孔板离心机的稳固性，防震垫很好的体现了微孔板离心机的安全性，水平固定台很好的体现了微孔板离心机的平衡性、实用性，适用于离心机装置的使用，在未来具有广泛的发展前景。
一种具有托盘调整机构微孔离心机

[发明专利]单分子探针多重靶向捕获文库的构建方法及应用-CN202010983954.4在审
发明人：段小红;张腾龙;杨春燕;杨文娟;李旋;王东亮;周启明 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2020-09-18 - 公布日： 2020-12-11 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明涉及分子检测的技术领域，特别涉及单分子探针多重靶向捕获文库的构建方法及应用；包括以下步骤：根据靶目标区域序列设计并合成分子倒置探针；针对捕获的目标区域，靶序列互补区域探针A和靶序列互补区域探针B可特异性与目标区域模板互补结合，形成含有一个核苷酸至几百个核苷酸缺口的环状结构；然后加入4种游离的核苷酸，在DNA聚合酶的作用下以靶目标序列为模板填补缺口，DNA连接酶催化探针区域两端的3’，5’‑磷酸二酯键，形成完整的环化探针；用PCR扩增直接产生靶向区域的测序文库，此时的PCR扩增产物即为测序文库。本发明在传统的MIP技术基础上做了优化和改进，用于肿瘤相关的低频变异和甲基化的检测。
分子探针多重靶向捕获文库构建方法应用

[实用新型]一种具有移动光源的紫外线消毒车-CN201921472771.5有效
发明人：师雅宁;杨春燕;孙大伟;张腾龙;其他发明人请求不公开姓名 -专利权人： 北京求臻医学检验实验室有限公司
申请日： 2019-09-05 - 公布日： 2020-08-28 - 主分类号： A61L2/10 文献下载
摘要：本实用新型公开了一种具有移动光源的紫外线消毒车，包括消毒车主体、高效活动消毒柜、灵活移动光源和消毒车底座，消毒车主体的一端活动连接有灵活移动光源，消毒车主体的前面活动连接有高效活动消毒柜，消毒车主体的底端固定连接有消毒车底座，消毒车主体的内部一侧固定连接有内嵌柜，消毒车主体的另一端固定连接有推动杆，推动杆很好的体现了消毒车的可移动性，内嵌柜很好的体现了消毒车的收纳性，缓冲减震组很好的体现了消毒车的缓冲性，可折叠轮很好的体现了消毒车的稳定性，灵活移动光源很好的体现了消毒车的实用性，高效活动消毒柜很好的体现了消毒车的消毒高效性，适用于消毒器械的使用，在未来具有广泛的发展前景。
一种具有移动光源紫外线消毒

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